ما هو علم الجينوم المقارن؟
جوهر تحليل الجينوم المقارن هو إنشاء المراسلات بين الجينات (تحليل علم الأورثولوجيا) أو الميزات الجينومية الأخرى في الكائنات الحية المختلفة. هذه الخرائط بين الجينوم هي التي تجعل من الممكن تتبع العمليات التطورية المسؤولة عن الاختلاف بين الجينومين. العديد من الأحداث التطورية التي تعمل على مختلف المستويات التنظيمية تشكل تطور الجينوم. على أدنى مستوى، تؤثر الطفرات النقطية على النيوكليوتيدات الفردية. على مستوى أعلى، تخضع الشرائح الكروموسومية الكبيرة للتكرار، والنقل الجانبي، والانعكاس، والتحويل، والحذف، والإدراج. في نهاية المطاف ، تشارك الجينومات بأكملها في عمليات التهجين والتكثيف والتكثيف والتكافل الداخلي ، مما يؤدي في كثير من الأحيان إلى التنوع السريع. تعقيد تطور الجينوم يطرح العديد من التحديات المثيرة لمطوري النماذج والخوارزميات الرياضية ، الذين يلجأون إلى مجموعة من التقنيات الخوارزمية والإحصائية والرياضية ، بدءًا من الخوارزميات الدقيقة والهيورستيكية والبارامتر الثابتة وخوارزميات التقريب للمشاكل القائمة على نماذج التكافؤ إلى خوارزميات سلسلة ماركوف مونتي كارلو للتحليل البايسي للمشاكل القائمة على نماذج احتمالية.  وتستند العديد من هذه الدراسات على اكتشاف التسلسل المماثل لتعيين التسلسلات لعائلات البروتين.