جینومکس میں کینسر میں تغیرات کا تجزیہ کیا ہے؟
-
کینسر میں، متاثرہ خلیوں کے جینومز کو پیچیدہ یا حتیٰ کہ غیر متوقع طریقوں سے دوبارہ ترتیب دیا جاتا ہے۔ بڑے پیمانے پر ترتیب دینے کی کوششیں کینسر میں مختلف جینوں میں پہلے سے نامعلوم نقطہ اتپریورتنوں کی شناخت کے لئے استعمال کی جاتی ہیں۔ بایو انفارمیٹشین تیار کردہ ترتیب کے اعداد و شمار کے سراسر حجم کو منظم کرنے کے لیے خصوصی خودکار نظام تیار کرنا جاری رکھتے ہیں، اور وہ ترتیب کے نتائج کا انسانی جینوم کی ترتیب اور جراثیمی پولیمورفزم کے بڑھتے ہوئے مجموعہ سے موازنہ کرنے کے لیے نئے الگورتھم اور سافٹ ویئر بناتے ہیں۔ نئی فزیکل ڈٹیکشن ٹیکنالوجیز استعمال کی جاتی ہیں، جیسے اولیگونیوکلیوٹائڈ مائیکرو رے کروموسومل فوائد اور نقصانات کی نشاندہی کرنے کے لیے (جسے تقابلی جینومک ہائبرڈائزیشن کہا جاتا ہے)، اور سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم صفیں معلوم پوائنٹ کی تبدیلیوں کا پتہ لگانے کے لیے۔ یہ پتہ لگانے کے طریقے بیک وقت پورے جینوم میں کئی لاکھ سائٹس کی پیمائش کرتے ہیں، اور جب ہزاروں نمونوں کی پیمائش کے لیے ہائی تھرو پٹ میں استعمال کیا جاتا ہے، تو فی تجربہ ٹیرا بائٹس ڈیٹا تیار کرتا ہے۔ ایک بار پھر بڑی مقدار اور ڈیٹا کی نئی قسمیں بایو انفارمیشن ماہرین کے لیے نئے مواقع پیدا کرتی ہیں۔ اعداد و شمار میں اکثر کافی تغیرات، یا شور پایا جاتا ہے، اور اس طرح پوشیدہ مارکوف ماڈل اور تبدیلی کے نقطہ تجزیہ کے طریقے تیار کیے جا رہے ہیں تاکہ اصلی کاپی نمبر کی تبدیلیوں کا اندازہ لگایا جا سکے۔   کینسر کے جینوم کے تجزیے میں دو اہم اصول استعمال کیے جا سکتے ہیں بائیو انفارمیٹک طور پر جو کہ exome میں تغیرات کی شناخت سے متعلق ہیں۔ سب سے پہلے، کینسر جینز میں جمع ہونے والے سومیٹک تغیرات کی بیماری ہے۔ دوسرے کینسر میں ڈرائیور کی تبدیلیاں ہوتی ہیں جن کو مسافروں سے الگ کرنے کی ضرورت ہوتی ہے۔   ان کامیابیوں کے ساتھ جو اگلی نسل کی ترتیب دینے والی یہ ٹیکنالوجی بائیو انفارمیٹکس کے شعبے کو فراہم کر رہی ہے، کینسر کی جینومکس بڑی حد تک تبدیل ہو سکتی ہے۔ یہ نئے طریقے اور سافٹ ویئر بائیو انفارمیشن ماہرین کو کینسر کے بہت سے جینوموں کو جلدی اور سستی ترتیب دینے کی اجازت دیتے ہیں۔ یہ جینوم میں کینسر سے چلنے والے تغیرات کے تجزیہ کے ذریعہ کینسر کی اقسام کی درجہ بندی کرنے کے لئے ایک زیادہ لچکدار عمل پیدا کرسکتا ہے۔ مزید برآں، بیماری کے بڑھنے کے دوران مریضوں کا سراغ لگانا مستقبل میں کینسر کے نمونوں کی ترتیب سے ممکن ہو سکتا ہے۔   اعداد و شمار کی ایک اور قسم جس کے لیے نوول انفارمیٹکس ڈیولپمنٹ کی ضرورت ہوتی ہے وہ گھاووں کا تجزیہ ہے جو بہت سے ٹیومر میں بار بار پائے جاتے ہیں۔