ڈی این اے کی ترتیب اسمبلی کیا ہے؟
-
بایو انفارمیٹکس میں، ترتیب اسمبلی سے مراد اصل ترتیب کو دوبارہ تشکیل دینے کے لیے طویل DNA ترتیب سے ٹکڑوں کو سیدھ میں لانا اور ملانا ہے۔ اس کی ضرورت ہے کیونکہ ڈی این اے سیکوینسنگ ٹیکنالوجی ایک بار میں پورے جینوم کو 'پڑھنے' کے قابل نہیں ہوسکتی ہے، بلکہ 20 سے 30،000 بیسز کے چھوٹے چھوٹے ٹکڑوں کو پڑھتی ہے، استعمال شدہ ٹیکنالوجی پر منحصر ہے۔ عام طور پر، مختصر ٹکڑے (پڑھنے) کا نتیجہ شاٹگن کی ترتیب جینومک ڈی این اے، یا جین ٹرانسکرپٹ (ESTs) سے ہوتا ہے۔   ترتیب کو جمع کرنے کے مسئلے کا موازنہ ایک کتاب کی بہت سی کاپیاں لینے، ان میں سے ہر ایک کو مختلف کٹر کے ذریعے ایک شریڈر سے گزرنے، اور صرف کٹے ہوئے ٹکڑوں کو دیکھ کر کتاب کے متن کو ایک ساتھ جوڑنے سے کیا جا سکتا ہے۔ اس کام کی واضح دشواری کے علاوہ، کچھ اضافی عملی مسائل بھی ہیں: اصل میں کئی پیراگراف دہرائے جاسکتے ہیں، اور کچھ ٹکڑوں میں ترمیم کے دوران ٹائپنگ کی غلطیوں کے لیے ترمیم کی جاسکتی ہے۔ کسی اور کتاب کے اقتباسات بھی شامل کیے جاسکتے ہیں، اور کچھ ٹکڑے مکمل طور پر ناقابل شناخت ہوسکتے ہیں۔