Comme la principale menace pour les animaux est la disparition de leur habitat naturel, la première mesure de protection est donc de préserver leur environnement. 
Pour certaines espèces, des programmes ont ainsi déjà fait leurs preuves : en Chine, par exemple, la population de pandas géants a augmenté ces dernières années alors qu’elle était considérée comme « en danger » depuis 1990. 
Des programmes sont ainsi mis en place par différents pays, avec l’aide d’organisations comme le WWF.