À ce moment-là, Pasteur s’intéresse particulièrement aux microbes et il arrive finalement à prouver que ceux-ci sont à l’origine des maladies contagieuses. 
Après quelques années de recherche, il met au point, en 1885, un vaccin contre la rage qui permet de sauver la vie d’un jeune garçon qui venait d’être mordu par un chien.
Ses recherches le conduisent alors à étudier les vaccins, qui ont fait leurs preuves pour prévenir le développement de plusieurs maladies.