ව්‍යුහාත්මක ජාන විද්‍යාව යනු කුමක්ද?
ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව මඟින් ලබා දී ඇති ජෙනෝමයක් මගින් කේතනය කරන ලද සෑම ප්‍රෝටීනයකම ත්‍රිමාන ව්‍යුහය විස්තර කිරීමට උත්සාහ කරයි. මෙම ජෙනෝමය මත පදනම් වූ ප්‍රවේශය පර්යේෂණාත්මක සහ ආකෘති නිර්මාණ ප්‍රවේශයන් වල එකතුවක් මගින් ව්‍යුහය නිර්ණය කිරීමේ ඉහළ ප්‍රතිපල ක්‍රමයක් සඳහා ඉඩ ලබා දේ. ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව සහ සම්ප්‍රදායික ව්‍යුහාත්මක පුරෝකථනය අතර ඇති ප්‍රධාන වෙනස නම් ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව එක් විශේෂිත ප්‍රෝටීනයක් කෙරෙහි අවධානය යොමු කරනවාට වඩා ජෙනෝමය මගින් කේතනය කරන ලද සෑම ප්‍රෝටීනයකම ව්‍යුහය තීරණය කිරීමට උත්සාහ කිරීමයි. සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි අනුක්‍රම සමඟින්, ව්‍යුහය පුරෝකථනය කිරීම පර්යේෂණාත්මක සහ ආකෘති නිර්මාණ ප්‍රවේශයන් වල එකතුවක් හරහා වඩා ඉක්මනින් සිදු කළ හැක, විශේෂයෙන් අනුක්‍රමික ජෙනෝම විශාල සංඛ්‍යාවක් සහ කලින් විසඳන ලද ප්‍රෝටීන් ව්‍යුහයන් තිබීම නිසා විද්‍යාඥයින්ට කලින් විසඳන ලද ව්‍යුහයන් මත ප්‍රෝටීන් ව්‍යුහය ආදර්ශන කිරීමට ඉඩ සලසයි. homologs. ප්‍රෝටීන ව්‍යුහය ප්‍රෝටීන් ක්‍රියාකාරිත්වය සමඟ සමීපව සම්බන්ධ වී ඇති නිසා, ව්‍යුහාත්මක ජාන විද්‍යාවට ප්‍රෝටීන් ක්‍රියාකාරිත්වය පිළිබඳ දැනුම දැනුම් දීමට හැකියාව ඇත. ප්‍රෝටීන් ක්‍රියාකාරකම් පැහැදිලි කිරීමට අමතරව, ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව නව ප්‍රෝටීන් නැමීම් සහ ඖෂධ සොයාගැනීම සඳහා විභව ඉලක්ක හඳුනා ගැනීමට භාවිතා කළ හැක. ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව යනු දන්නා ව්‍යුහයේ ප්‍රෝටීනයකට හෝ රසායනික හා භෞතික මූලධර්ම මත පදනම් වූ ප්‍රෝටීනයකට ප්‍රවේණි අනුපිළිවෙල හෝ ආකෘතිකරණය පදනම් කරගත් පර්යේෂණාත්මක ක්‍රම ඇතුළුව ව්‍යුහ නිර්ණය සඳහා ප්‍රවේශයන් විශාල සංඛ්‍යාවක් ගැනීම ඇතුළත් වේ. දන්නා ඕනෑම ව්යුහයක්. සාම්ප්‍රදායික ව්‍යුහාත්මක ජීව විද්‍යාවට ප්‍රතිවිරුද්ධව, ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යා ප්‍රයත්නයක් හරහා ප්‍රෝටීන ව්‍යුහයක් නිර්ණය කිරීම බොහෝ විට (නමුත් සෑම විටම නොවේ) ප්‍රෝටීන් ක්‍රියාකාරිත්වය සම්බන්ධයෙන් කිසිවක් දැන ගැනීමට පෙර පැමිණේ. මෙය ව්‍යුහාත්මක ජෛව තොරතුරු විද්‍යාවේ නව අභියෝග මතු කරයි, එනම් එහි ත්‍රිමාණ ව්‍යුහයෙන් ප්‍රෝටීන් ක්‍රියාකාරිත්වය තීරණය කිරීම. ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව ප්‍රෝටීන ව්‍යුහයන්ගේ ඉහළ ප්‍රතිදාන නිර්ණය අවධාරණය කරයි. මෙය ව්‍යුහාත්මක ජාන විද්‍යාවේ කැපවූ මධ්‍යස්ථානවල සිදු කෙරේ. බොහෝ ව්‍යුහාත්මක ජීව විද්‍යාඥයන් තනි ප්‍රෝටීන හෝ ප්‍රෝටීන් කාණ්ඩවල ව්‍යුහයන් ලුහුබඳින අතර, ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව පිළිබඳ විශේෂඥයන් ප්‍රෝටීන වල ව්‍යුහයන් පුළුල් ප්‍රවේණික පරිමාණයකින් ලුහුබඳිති. මෙය විශාල පරිමාණ ක්ලෝනකරණය, ප්රකාශනය සහ පිරිසිදු කිරීම අදහස් කරයි. මෙම ප්රවේශයේ එක් ප්රධාන වාසියක් වන්නේ පරිමාණයේ ආර්ථිකයයි. අනෙක් අතට, සමහර ප්‍රතිඵල සහිත ව්‍යුහයන්ගේ විද්‍යාත්මක වටිනාකම විටෙක ප්‍රශ්න කරනු ලැබේ. 2006 ජනවාරි සිට විද්‍යා ලිපියක් ව්‍යුහාත්මක ජාන විද්‍යා ක්ෂේත්‍රය විශ්ලේෂණය කරයි. Protein Structure Initiative වැනි ව්‍යුහාත්මක ජාන විද්‍යාවේ එක් වාසියක් නම් විද්‍යාත්මක ප්‍රජාවට නව ව්‍යුහයන්ට මෙන්ම ක්ලෝන සහ ප්‍රෝටීන වැනි ප්‍රතික්‍රියාකාරක වෙත ක්ෂණික ප්‍රවේශය ලැබීමයි. අවාසියක් නම් මෙම ව්‍යුහයන් බොහොමයක් නොදන්නා ක්‍රියාකාරීත්වයේ ප්‍රෝටීන වලින් සමන්විත වන අතර ඒවාට අනුරූප ප්‍රකාශන නොමැති වීමයි. මේ සඳහා මෙම ව්‍යුහාත්මක තොරතුරු පුළුල් පර්යේෂණ ප්‍රජාව වෙත සන්නිවේදනය කිරීමේ නව ක්‍රම අවශ්‍ය වේ. ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව සඳහා වූ ඒකාබද්ධ මධ්‍යස්ථානයේ (JCSG) ජෛව තොරතුරු කේන්ද්‍රය, ඉහළ කාර්යක්‍ෂම ව්‍යුහාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යා මධ්‍යස්ථානවලින් මතුවන ප්‍රෝටීන් ව්‍යුහයන් විවරණය කිරීම සඳහා විවෘත ප්‍රෝටීන ව්‍යුහ විවරණ ජාලය (TOPSAN) නම් විකි පාදක ප්‍රවේශයක් මෑතකදී සංවර්ධනය කර ඇත.