قد تشارك المنظمات غير الحكومية أيضًا في تمويل أو تنفيذ برامج التطعيم؛ على سبيل المثال ، تساعد مؤسسة بيل وميليندا جيتس الحكومات في باكستان ونيجيريا وأفغانستان في إدارة التطعيم ضد شلل الأطفال.
NGOs also may be involved in funding or implementing vaccination programs; for instance Bill and Melinda Gates Foundation assists governments in Pakistan, Nigeria and Afghanistan with the administration of polio vaccination.
องค์กรพัฒนาเอกชนอาจมีส่วนร่วมในการให้ทุนหรือการดำเนินโครงการวัคซีน ตัวอย่างเช่น มูลนิธิบิลและเมลินดา เกตส์ ช่วยเหลือรัฐบาลในปากีสถาน ไนจีเรีย และอัฟกานิสถานในการบริหารวัคซีนโปลิโอ