细胞空泡毒素（vaculatingcytotoxin，vacA）由vacA基因编码，vacA在pH＜6至pH1.5时强烈被激活，在pH2.0时对胃蛋白酶有极强烈的抵抗力，通过幽门排到肠管，在活化的vacA在未被肠内一些蛋白酶消化前，即引起十二指肠上皮细胞的空泡形成，于是在十二指肠缺乏幽门螺杆菌存在的条件下导致十二指肠溃疡，从而形成了十二指肠溃疡形成机制的漏屋假说（leakingroofhypothesis）。