根据放线菌的生物学、形态学、细胞化学等特性，将放线菌分为9个类群，即放线菌（Actinobacteria）、游动放线菌（Ac-tinolanetes）、马杜拉放线菌（Maduromycetes）、假诺卡菌（Pseudocardiacese）、多腔孢囊菌（Multilocular）、诺卡菌形放线菌（Nocardioformactinomycete）、链霉菌（Streptomycetes）、嗜热单胞菌（Thermomonosporas）及其他类群，每一类群又包括若干个属。