1539
Het jaar 1539 is het 39e jaar in de 16e eeuw volgens de christelijke jaartelling.

Gebeurtenissen 
februari
 17 Het Parlement van Parijs bekrachtigt het besluit van koning Frans I van Frankrijk om graaf Frans I van Nevers te verheffen tot hertog van Nevers en pair van Frankrijk.

maart
 23 - Eerstesteenlegging voor het Kasteel van Boussu in Henegouwen.

april
 17 - De katholieke hertog van Saksen Joris met de Baard sterft en wordt opgevolgd door zijn protestantse broer Hendrik de Vrome, die de Hervorming direct krachtig ter hand neemt.
 27 - De conquistadores Gonzalo Jiménez de Quesada, Sebastián de Belalcázar en Nikolaus Federmann stichten met toestemming van de Spaanse kroon de stad Bogota.

mei
 23 - De Staten van Utrecht erkennen Gunterstein als ridderhofstad.
 25 - Begin van de kerkhervorming in Leipzig door prediking van de hervormers Justus Jonas de Oudere en Maarten Luther in de Nikolaikirche.
augustus
 10 - Met de Ordonnantie van Villers-Cotterêts legt koning Frans I van Frankrijk het Frans op voor alle officiële documenten van bestuur en rechtspraak. Andere talen, zoals het Occitaans en het Nederlands, worden hiermee tweederangs talen in Frankrijk.

november
 1 - Joachim II van Brandenburg neemt in de Nikolaikirche van Spandau deel aan het Avondmaal. Zijn overgang naar het protestantisme, en die van zijn land, is daarmee een feit.

december
 29 - De Haagse Sint-Jacobskerk wordt door brand zwaar beschadigd. Oorzaak is blikseminslag.
 december - Karel V onderdrukt in Gent en rond Kortrijk een volksopstand.

zonder datum
 Keizer Karel V verblijft korte tijd op het kasteel van Heusden.
Ter gelegenheid van haar bruiloft met Cosimo I de' Medici maakt Agnolo Bronzino een portret van Eleonora van Toledo.
 Alarchus van Amsterdam brengt een bloemlezing uit de geschriften van Rudolf Agricola onder de titel "Rudolphi Agricolae lucubrationes" ("Rudolph Agricola's nachtelijke arbeid").
 Margaretha Pole, een van de laatste Plantagenets in directe lijn, wordt in de Tower opgesloten.
 De Zweedse wetenschapper Olaus Magnus laat in Venetië de Carta Marina vervaardigen, de eerste "moderne" cartografische voorstelling van Scandinavië door een Scandinaviër en voor een Europees publiek.

Literatuur
 De inventione dialectica ("Over de dialectische denkmethode") een boek in drie delen van Rudolf Agricola
 Haecastus (Latijnse bewerking van het Middelnederlandse Elckerlijc), het meesterwerk van de Utrechtse schoolrector Georgius Macropedius

Beeldende kunst

Bouwkunst

Geboren 
december
 5 - Faustus Socinus, theoloog

Overleden 
februari
 13 - Isabella d'Este, marchesa en regent van Mantua
april
 17 - Joris met de Baard
mei
 1 - Isabella van Portugal (36), koningin van Spanje
 7 - Goeroe Nanak (गुरु नानक)
december
 20 - Johannes Lupi (33 ?), Nederlandse polyfonist