1546
Het jaar 1546 is het 46e jaar in de 16e eeuw volgens de christelijke jaartelling.

Gebeurtenissen 
maart
1 - De Schotse kardinaal Beaton laat George Wishart, een van de belangrijkste protestantse predikers en leermeester van John Knox, op de brandstapel ombrengen op het terrein voor St Andrews Castle. 
 12 - De doopsgezinde Edammers Dirk Pietersz Smuel en Jacob de Geldersman worden vanwege hun geloofsopvattingen gearresteerd. Ze bekennen geen geloof te hechten aan het katholieke sacrament van de eucharistie.
mei
 24 - De doopsgezinde Edammers Dirk Pietersz Smuel en Jacob de Geldersman worden op de Dam in Amsterdam als ketters verbrand. 
29 - Een groep Schotse protestanten gaat vermomd St Andrews Castle binnen, vermoordt kardinaal Beaton en hangt zijn lichaam aan de kasteelmuur.

juni
 30 - De Index van Leuven krijgt kracht van wet door keizerlijk edict, waarvan de eerste bepaling de theologiefaculteit machtigt om boeken "te reproberen, doemen en suspect te verklaren".  

juli
 20 - Begin van de Schmalkaldische Oorlog (1546-1552).
augustus
 6 - De ontploffing van een kruitmagazijn in de Zandpoort te Mechelen eist meer dan 200 slachtoffers.
november
 3 -  Keizer Karel V confisqueert na de eerste nederlagen van het Schmalkaldisch Verbond het graafschap Tecklenburg inclusief Lingen, en beleent er zijn stadhouder Maximiliaan van Egmont mee.
zonder datum
 Basra wordt door de Turken ingenomen.
 Michelangelo start de bouwwerken aan de koepel van de Sint-Pietersbasiliek te Rome.
 Het begrip fossiel wordt voor de eerste keer gebruikt, als aanduiding voor versteende resten van dieren en planten, door Georgius Agricola.

Bouwkunst

Geboren 
december
 14 - Tycho Brahe, Deens astronoom

Overleden 
februari
 18 - Maarten Luther (62), Duits Theoloog en kerkhervormer
juni
 na 8 - Maria Emanuela van Portugal, echtgenote van Filips II van Spanje, sterft in het kraambed