Microbioom
Het microbioom is het geheel aan micro-organismen dat zich in een bepaalde omgeving bevindt. De term wordt meestal gebruikt om te verwijzen naar alle micro-organismen die van nature samenleven met een plant of dier. Bekende voorbeelden van microbiomen zijn de darmflora in het menselijk lichaam, of de rhizosfeer rond het wortelstelsel van een plant. Een microbioom is zeer complex en bestaat uit diverse levensvormen, zoals bacteriën, archaea, schimmels en kleine protisten.

De lichamen van dieren en planten zijn de woonplaats van miljarden micro-organismen. Slechts een klein deel hiervan is ziekteverwekkend (pathogeen); de overgrote meerderheid leeft ongemerkt mee in of op de organen van de gastheer (commensalisme). De microben vervullen belangrijke functies, zoals de vertering van voedsel, productie van vitaminen en bescherming tegen kolonisatie van echte ziekteverwekkers. In het menselijk lichaam bevinden veruit de meeste microben zich in de dikke darm, maar ook rond de genitaliën en bepaalde delen van de huid.

Het microbioom is een belangrijk onderzoeksthema in de geneeskunde. Er zijn verbanden gevonden tussen de compositie (samenstelling) van het microbioom en bepaalde aandoeningen, zoals darmziekten en overgewicht. Er is nog veel onduidelijk over hoe het microbioom de gezondheid beïnvloedt. Met behulp van moderne sequencing-technieken is men erachter gekomen dat de compositie dynamisch is: het kan snel veranderen onder invloed van omgevingsfactoren als beweging, voeding en medicatie.

Zie ook
 Metagenomica

Ecologie
Symbiose