text: T63566-1273_Uitvoeren van next en third generation sequencing_JR
  Uitvoeren van next en third generation sequencing t.b.v. de NVWA
  De raamovereenkomst met de huidige leverancier, voor het uitvoeren van NGS en TGS, loopt naar verwachting in het tweede kwartaal 2024 af, omdat de contractwaarde dan is bereikt.
  Het doel van deze Europese aanbesteding is het sluiten van een Raamovereenkomst met één Opdrachtnemer voor het ‘Uitvoeren van next- en third generation sequencing’.
  De betreffende dienstverlening is ten behoeve van de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit (NVWA). 
  
  De opdracht betreft:
  Library preparatie:
  voor DNA;
  voor RNA incl. plant rRNA depletie en poly-A selectie.
  Next Generation Sequencing; DNA en RNA:
  voor paired-end short reads (<500 nt) gebruik makend van:
  Illumina Novaseq 6000, X of X plus, of;
  Illumina Nextseq 550, 1000, 2000, of;
  Illumina MiSeq;
  
  Third Generation Sequencing; DNA;
  voor long reads (>500 nt) gebruik makend van:
  PacBio Sequel II, of;
  Oxford Nanopore.
  Als uitvloeisel van het Uitvoeringsprogramma Compacte Rijksdienst is het RIVM eind 2012 aangewezen als een inkoopuitvoeringscentrum (IUC) van de Rijksoverheid. Een van de taken van het IUC-RIVM vormt de uitvoering van de Rijksinkoopcategorie Laboratorium. Doelstellingen van categoriemanagement zijn o.a. kennisbundeling en inkoopsamenwerking per productgroep. Deelnemers van deze inkoopsamenwerking zijn Nederlandse Voedsel en Warenautoriteit (NVWA), Nederlands Forensisch Instituut (NFI), Belastingdienst/Douanelaboratorium, Rijksdienst voor het Cultureel Erfgoed (RCE), Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM), Rijkswaterstaat / Waterdienst, Defensie (diverse laboratoria). Deze aanbesteding wordt uitgevoerd in het kader van de categorie Laboratorium door het IUC-RIVM. Nadere informatie over inkopen door het Rijk:
  https://www.rijksoverheid.nl/onderwerpen/zakendoen-met-het-rijk/hoe-het-rijk-inkoopt
  https://www.rijksoverheid.nl/onderwerpen/zakendoen-met-het-rijk/inkoopcategorieen/categorie-laboratorium
  services
  2000000
  71600000
  71620000
  Zie documentatie
  anyw-cou
  NLD
  LOT-0000
  no-eu-funds
  poi-exa
  200
  quality
  K1 – Logistiek proces
  Doelstelling
  Met dit gunningscriterium willen wij inzicht verkrijgen in het gehele logistieke proces, en de borging hiervan.
   Vraagstelling en opdracht
  Geef een beschrijving van de logistieke verwerking van de monsters vanaf het moment dat de monsters arriveren bij de Opdrachtnemer. Benoem hier het primaire proces minimaal aan de hand van onderstaande onderwerpen en het programma van eisen.
  1. Illumina 150 paired-end DNAseq, procesomschrijving
  2. Illumina 150 paired-end total RNAseq with rRNA reductie, procesomschrijving
  3. PacBio sequencing en/of Oxford Nanopore Technology, procesomschrijving
  4. Spoedmonster, procesbeschrijving
  5. Gevraagde input, welke eisen/wensen worden gesteld aan de aanlevering
  6. Autorisatie van uitkomsten, voldoet aan kwaliteitseisen
  7. Afval verwerking: hoe vind de afvoer van monsters en derivaten daarvan plaats
  
  Aandachtspunten
  Volledigheid van de processen
  Efficiency
  Kwaliteitsborging
  Service
  poi-exa
  100
  quality
  K2 – Innovatie op gebied van NGS en TGS
  Opdrachtgever wil gebruik kunnen maken van ‘state of the art’ technologie en ontwikkelingen op het gebied van NGS en TGS gedurende de looptijd van de raamovereenkomst, wanneer dit past binnen de behoefte van Opdrachtgever.
  Het is dus van belang dat Opdrachtnemer innoveert. Anders kan Opdrachtgever hier geen gebruik van maken, en mist Opdrachtgever verbetering in kwaliteit en snelheid, in het kader van het voorkomen van en verdere verspreiding van plantenziekten en -plagen, invasieve planten en vectoren.
  Doelstelling
  Het doel is om inzicht te krijgen in mogelijke innovaties, en indien passend binnen de behoefte van Opdrachtgever, mee te gaan in kwaliteits-en snelheidsverbeteringen.
  Vraagstelling en opdracht
  Beschrijf welke innovatie(s) u ziet en van welke technologie zowel Opdrachtgever als Opdrachtnemer gedurende de looptijd van de raamovereenkomst baat bij hebben. Beargumenteer dit.
  Aandachtspunten
  Beschrijf één of meerdere voor Opdrachtgever relevante innovaties. Geef aan waarom dit relevant kan zijn voor Opdrachtgever.
  Welke innovatie(s) u verwacht te implementeren gedurende de raamovereenkomst (tegen marktconforme tarieven), en onderbouw dit. (Het is aan Opdrachtgever te bepalen of hier wel/geen gebruik van gemaakt gaat worden).
   poi-exa
  300
  quality
  K3 – Doorlooptijd reguliere monsters
  Met ‘doorlooptijd’ bedoelt Opdrachtgever het aantal dagen tussen het moment van ontvangst van een monster door de Opdrachtnemer tot aan het moment van ontvangst van de gegenereerde data door Opdrachtgever. Het gaat hier om het generen van 2 Gbase Illumina PE150 data
  
  NVWA heeft baat bij een korte doorlooptijd. Dit is van belang, omdat NVWA haar acties, binnen haar projecten en/of opdrachten, dan snel kan uitzetten.
  Doelstelling
  Het doel van dit gunningscriterium is om vast te stellen welke doorlooptijd de Opdrachtnemer kan bieden, beter dan gesteld in het ‘Programma van eisen’.
  Vraagstelling en opdracht
  Geef aan welke doorlooptijd u kan bieden, in gestelde dagen voor reguliere monsters.
  Ga hierbij uit van het maximale aantal dagen (zaterdagen en zondagen meegeteld) rekening houdend dat de Opdrachtgever monsters kan aanleveren op iedere werkdag, behalve vrijdag en dat deze pas aan het eind van de dag aangeleverd worden, waardoor er pas op de eerste volgende beschikbare werkdag begonnen kan worden aan het sequencing proces. Als het sequencen van RNA monsters een dag langer duurt dan DNA sequencen, ga dan uit van de doorlooptijd van RNA sequencen.
  poi-exa
  100
  quality
  K4 – Doorlooptijd spoed monsters
  Met ‘doorlooptijd’ bedoelt Opdrachtgever het aantal werkdagen (zater- en zondagen niet meegeteld) tussen het moment van ontvangst van een monster door de Opdrachtnemer tot aan het moment van ontvangst van de gegenereerde data door Opdrachtgever. Het gaat hier om het generen van 2 Gbase Illumina PE150 data
  
  NVWA heeft baat bij een korte doorlooptijd. Dit is van belang, omdat NVWA haar acties, binnen haar projecten en/of opdrachten, dan snel kan uitzetten.
  Doelstelling
  Het doel van dit gunningscriterium is om vast te stellen welke doorlooptijd de Opdrachtnemer kan bieden, beter dan gesteld in het ‘Programma van eisen’.
   Vraagstelling en opdracht
  Geef aan welke doorlooptijd u kan bieden, in gestelde werkdagen voor spoed monsters.
  Ga hierbij uit van het maximale aantal dagen (zater- en zondagen niet meegeteld) rekening houdend dat de Opdrachtgever monsters kan aanleveren op iedere werkdag en dat deze pas aan het eind van de dag aangeleverd worden, waardoor er pas op de eerste volgende beschikbare werkdag begonnen kan worden aan het sequencing proces. Als het sequencen van RNA monsters een dag langer duurt dan DNA sequencen, ga dan uit van de doorlooptijd van RNA sequencen.
  poi-exa
  300
  price
  Prijs
  Totaalprijs
  ORG-0002
  true
  false
  none
  fa-wo-rc
  T63566-1273_Uitvoeren van next en third generation sequencing_JR
  Uitvoeren van next en third generation sequencing t.b.v. de NVWA
  De raamovereenkomst met de huidige leverancier, voor het uitvoeren van NGS en TGS, loopt naar verwachting in het tweede kwartaal 2024 af, omdat de contractwaarde dan is bereikt.
  Het doel van deze Europese aanbesteding is het sluiten van een Raamovereenkomst met één Opdrachtnemer voor het ‘Uitvoeren van next- en third generation sequencing’.
  De betreffende dienstverlening is ten behoeve van de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit (NVWA). 
  
  De opdracht betreft:
  Library preparatie:
  voor DNA;
  voor RNA incl. plant rRNA depletie en poly-A selectie.
  Next Generation Sequencing; DNA en RNA:
  voor paired-end short reads (<500 nt) gebruik makend van:
  Illumina Novaseq 6000, X of X plus, of;
  Illumina Nextseq 550, 1000, 2000, of;
  Illumina MiSeq;
  
  Third Generation Sequencing; DNA;
  voor long reads (>500 nt) gebruik makend van:
  PacBio Sequel II, of;
  Oxford Nanopore.
   Als uitvloeisel van het Uitvoeringsprogramma Compacte Rijksdienst is het RIVM eind 2012 aangewezen als een inkoopuitvoeringscentrum (IUC) van de Rijksoverheid. Een van de taken van het IUC-RIVM vormt de uitvoering van de Rijksinkoopcategorie Laboratorium. Doelstellingen van categoriemanagement zijn o.a. kennisbundeling en inkoopsamenwerking per productgroep. Deelnemers van deze inkoopsamenwerking zijn Nederlandse Voedsel en Warenautoriteit (NVWA), Nederlands Forensisch Instituut (NFI), Belastingdienst/Douanelaboratorium, Rijksdienst voor het Cultureel Erfgoed (RCE), Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM), Rijkswaterstaat / Waterdienst, Defensie (diverse laboratoria). Deze aanbesteding wordt uitgevoerd in het kader van de categorie Laboratorium door het IUC-RIVM. Nadere informatie over inkopen door het Rijk:
  https://www.rijksoverheid.nl/onderwerpen/zakendoen-met-het-rijk/hoe-het-rijk-inkoopt
  https://www.rijksoverheid.nl/onderwerpen/zakendoen-met-het-rijk/inkoopcategorieen/categorie-laboratorium
  services
  2000000
  71600000
  71620000
  Zie documentatie
  anyw-cou
  NLD.
  