La velocidad a la que se mueve dicha mosca depende del cuadro de referencia que uno considere. Ahora, dentro de la suposición de que el ser inteligente esta observando dicho evento desde la galaxia Andrómeda -la cual se encuentra a 2.537 millones de años luz-, obviaré dos consideraciones:
- El hecho que la galaxia Andrómeda se encuentre a 2.5 millones de años luz implica que cualquier evento que suceda desde la Tierra tardará 2.5 millones de años en ser visible dado que la luz tardará ese tiempo en llegar hasta allá.
- Dada la distancia astronómica a la que se encuentra el observador del evento, este último es insignificantemente pequeño para el observador. Prácticamente indistinguible a esa distancia.

Obviando estas dos consideraciones, dado que el marco de referencia es externo al vehiculo moviéndose, la velocidad a la que el ser inteligente observaría a la mosca serían los 100 km/h del vehículo más la velocidad a la que vuele la mosca dentro del vehículo. 

Espero te haya quedado claro el concepto de marco de referencia. Si tienes alguna duda, no dudes en preguntar ;).
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