El consumo de alimentos picantes en exceso puede provocar que se dañe la mucosa del tracto gastrointestinal. Esto puede derivar en dolores y náuseas, además de otros problemas más persistentes como úlceras y hemorroides. Aunque todavía no es algo confirmado, algunos estudios han relacionado el consumo excesivo de capsaicina, un nutriente contenido en los chiles picantes, con el cáncer de estómago. 

Sin embargo, existen estudios que documentan que la ingesta de comida picante de forma esporádica no genera daños demostrables en la mucosa gastroduodenal. 
Por otro lado, existen estudios que proponen la capsaicina como un potencial fármaco para enfermedades autoinmunes.
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