En la época de San Sebastián no existía el proceso de canonización, pero después de su muerte los cristianos comenzaron a venerarlo como santo.

Existia la creencia de que San Sebastián era una defensa contra la peste durante el medievo, lo que explica en gran medida el enorme aumento de su importancia en la Baja Edad Media.

San Sebastián es patrón de arqueros, soldados y atletas. También lo es de una larga lista de ciudades entre ellas San Sebastian/Donostia en España, Rio de Janeiro en Brasil y Negombo en Sri Lanka.
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