Son dos enfoques diferentes para la predicción de estructuras de proteínas.El modelado por homología se basa en la comparación de la secuencia de una proteína objetivo con la secuencia de proteínas estructuralmente conocidas. Si la secuencia es similar, se puede inferir que la proteína objetivo tendrá una estructura similar a la proteína conocida. Sin embargo, esto no siempre es posible, ya que no todas las proteínas tienen homólogos estructuralmente conocidos.

Por otro lado, el algoritmo utilizado por el programa AlphaFold se basa en la combinación de diferentes técnicas, incluyendo el modelado por homología, el modelado de fragmentos y el aprendizaje automático. El enfoque principal de AlphaFold es predecir la estructura de proteínas a partir de su secuencia utilizando redes neuronales.

Una de las principales diferencias entre estos dos enfoques es la precisión de las predicciones. AlphaFold ha demostrado ser muy preciso en la predicción de la estructura de proteínas, con resultados muy cercanos a las estructuras experimentales. Además, AlphaFold es capaz de predecir estructuras para proteínas que no tienen homólogos estructuralmente conocidos.
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