بیشتر باکتری هایی که وارد کانال گوارش می شوند توسط لیزوزیم، دفنسین، HCl یا آنزیم های هضم کننده پروتئین کشته می شوند. با این حال، تریلیون ها باکتری در داخل روده بزرگ زندگی می کنند و به عنوان فلور باکتریایی شناخته می شوند. بیشتر بیش از 700 گونه از این باکتری ها ارگانیسم های غیر بیماری زا هستند که تا زمانی که در لامین روده باقی می مانند، هیچ آسیبی نمی رسانند. در واقع، بسیاری از آنها هضم و جذب مواد شیمیایی را تسهیل می کنند و برخی ویتامین های خاص، به ویژه بیوتین، اسید پانتوتیک و ویتامین K را سنتز می کنند. برخی از آنها با افزایش پاسخ ایمنی مرتبط هستند. یک سیستم تصفیه شده مانع از عبور این باکتری ها از مانع مخاطی می شود. ابتدا، فلور گلیکوپتیک، یک دیواره سلولی باکتریایی، آزادسازی مواد شیمیایی توسط سلول های مخاطی اپیتز، به ویژه سلول های ایمنی، که به سلول های لامپوتین، سلول های لامپوتین، سلول های لامپوتین، سلول های لامپوتین، سلول های لامپوتین، سلول های لامپوتین، سلول های لامپوتین، و سلول های لامپوتین می شوند.
باکتری ها