. متن داده‌شده را خلاصه کن

متن: ایده درخت زندگی از متن‌های باستانی، از یک فرایند نردبانی از پایین‌ترین تا بالاترین نوع حیات (مانند یک زنجیر آفرینش) گرفته شده‌است. اولین درخت‌های منشعب‌کننده تبارزایی (فیلوژنتیک) شامل یک نمودار دیرینه شناسی می‌شد که ارتباطات زمین‌شناسی میان گیاهان و جانوران را نشان می‌داد و در کتاب «زمین‌شناسی مقدماتی» نوشته ادوارد هیچکاک (چاپ اول ۱۸۴۰) آمده بود. چارلز داروین یکی از اولین و محبوب‌ترین تصاویر از مفهوم درخت تکامل را در کتاب اصلی خود، «منشا انواع» به تصویر کشیده است. در طول قرن بعد، زیست شناسان تکاملی هنوز از نمودار درخت برای نمایش تکامل استفاده می‌کردند، زیرا این نمودارها به خوبی مفهوم گونه زایی را بیان می‌کنند. در طول زمان، دسته‌بندی گونه‌ها کمتر ایستا و بیشتر پویا شد. درخت فیلوژنتیک ریشه‌دار یک گراف جهت‌دار است با یک گره منحصر به فرد متناظر با نزدیک‌ترین جد مشترک از همه موجودات که در برگ‌های درخت هستند. روش معمول ریشه‌دار کردن درخت استفاده از outgroup است. درختان بدون ریشه ارتباط گره‌های برگ را بدون هیچ فرضی در مورد اصل و نسب‌شان نشان می‌دهند. در حالی که درختان بدون ریشه به سادگی با حذف ریشه‌ها از درختان ریشه‌دار تولید می‌شوند، از یک درخت بدون ریشه نمی‌توان بدون استفاده از شناسایی اصل و نسب، ریشه را نتیجه گرفت. به‌طور معمول ریشه‌دار کردن یک درخت با اضافه کردن outgroup در داده‌های ورودی یا معرفی مفروضات بیشتری در مورد انجام سرعت نسبی تکامل در هر شاخه، مانند فرضیه ساعت مولکولی انجام می‌شود. شکل ۱ یک درخت تکامل نژادی بدون ریشه را برای پروتئین اصلی عضله نشان می‌دهد. هر دو نوع درختان تکامل نژادی ریشه‌دار و بدون ریشه می‌توانند یک قسمتی (bifurcating) یا چند قسمتی (multifurcating)، یا برچسب دار و بدون برچسب باشند. هر یک از گره‌های داخلی در یک درخت یک قسمتی ریشه‌دار دقیقا دارای دو فرزند است (شبیه یک درخت دودویی)، و یک درخت یک قسمتی بدون ریشه یک درخت دودویی است ولی هر گره داخلی دقیقا سه همسایه دارد. در مقابل، یک درخت چند قسمتی ریشه‌دار ممکن است بیشتر از دو فرزند در برخی از گره هاداشته باشد و یک درخت چند قسمتی بدون ریشه ممکن است بیش از سه همسایه در برخی از گره‌ها داشته باشد. در یک درخت برچسب دار به هر یک از برگ‌ها ارزش‌های خاصی اختصاص می‌یابد، در حالی که یک درخت بدون برچسب فقط یک توپولوژی …
خلاصه:
درخت تبارزایی ، درخت فیلوژنتیک ، درخت تکامل نژادی یا درخت تکاملی (به انگلیسی : phylogenetic tree) یک نمودار انشعابی است (که اصطلاحا درخت (گراف) نامیده می‌شود) و روابط تکاملی در میان گونه‌های مختلف زیستی یا حتی اشخاص را بر اساس شباهت‌ها و تفاوت‌های فیزیکی (فیلوژنتیک) یا خصوصیات ژنتیک نشان می‌دهد . واحدهایی که به هم در درخت متصل هستند ، از یک جد مشترک جدا شده‌اند . در یک درخت تکامل نژادی ریشه‌دار ، هر گره نشان دهنده جد مشترکی برای فرزندان آن گره می‌باشد ، و طول یال‌ها در برخی از درختان نشان دهندهٔ تخمین زمان است . هر گره یک واحد آرایه‌ای (taxonomic) نامیده می‌شود .