Genomoviridae
# Genomoviridae

Genomoviridae :

Schemazeichnung eines Genomoviridae-Virions (SsHADV-1) :

Systematik :

Taxonomische Merkmale :

Wissenschaftlicher Name :

Genomoviridae :

Links :

Genomoviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Einzelstrang-DNA-Viren im Phylum Cressdnaviricota (CRESS-DNA-Viren). Die Mitglieder der Familie haben ein kleines, zirkuläres Genom von etwa 2,2–2,4 kb (Kilobasen). Wie bei allen CRESS-DNA-Viren kodiert das Genom (unter anderen) für des Initiationsprotein Rep der Rolling-Circle-Replikation, sowie für familienspezifische Kapsidproteine. In Rep-basierten Phylogenien bilden die Genomoviridae eine Schwesterklade zu dem Pflanzenviren der Familie Geminiviridae innerhalb der Ordnung Geplafuvirales. Derzeit (Stand 5. April 2021) sind vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) neun Gattungen in dieser Familie anerkannt, darunter die Gattung Gemycircularvirus

Der Familienname Genomoviridae ist ein Akronym, abgeleitet von geminivirus-like, no movement protein und der Endung -viridae für Virusfamilien.

Der Gattungsname Gemycircularvirus steht für Gemini-like myco-infecting circular virus.

Die Der Referenzstamm Sklerotinia sclerotiorum hypovirulence associated DNA virus 1 (SsHADV-1) der Typusart Sclerotinia-Gemycircularvirus 1 (offiziell Gemycircularvirus sclero1) der Gattung Gemycircularvirus ist derzeit (Stand 2016) das einzige kultivierte Mitglied der Familie. Die anderen Genomoviren sind nicht kultiviert und wurden mit Hilfe von Metagenomik-Techniken entdeckt.

## Beschreibung

Die Virionen (Virusteilchen) der Genomoviridae haben eine ikosaedrische Symmetrie mit Triangulationszahl T=1.

Die Genomoviridae-Virionen haben ein Genom der Länge von 2,1–2,2 kb (Kilobasen). Es kodiert für zwei Proteine: neben dem Replikatorprotein Rep noch für ein Kapsidprotein CAP (oder CP). Zwei intergenische Regionen (Zwischen-Gen-Regionen, intergenic regions) trennen diese beiden Offene Leserahmen (open reading frames, ORFs): Die kürzere SIR und die längere LIR. Die Transkription startet bidirektional von der langen intergenischen Region (LIR), die zwei divergente Promotoren enthält. Die kurze intergenische Region enthält bidirektionale Polyadenylierungssignale.

Das Rep-Protein hat eine gewisse Homologie mit dem Rep-Protein der Geminiviridae; das CP-Protein hat im Gegensatz dazu keine bekannte Homologe.

Da SsHADV-1, ein Mykovirus (Pilzvirus), der bisher (s. o.) einzige kultivierte Vertreter ist, sind Pilze die die einzig nachgewiesenen natürlichen Wirte der Genomoviridae. Wenn Genomoviridae mit anderen Eukaryoten assoziiert (vergesellschaftet) sind, kann dies auch daran liegen, dass sie deren Symbionten parasitieren, nicht diese selbst. Für Viren aus der Metagenomik konnte bisher nur ein Einzelfällen ohne Isolierung ein vermutlicher Wirt (Biologie) vorgeschlagen werden.

## Gattung Gemytripvirus

Gemytripvirus fugra1 (veraltet Fusarium graminearum gemytripvirus 1, FgGMTV1) ist eine Spezies von Mykoviren mit Wirtsspezies Fusarium graminearum. Diese haben abweichend ein dreisegmentiges Genom (tripartit); jedes Segment ist dabei ein zirkuläres ssDNA-Molekül mit CRESS-DNA-Viren-Architektur (Haarnadelstruktur, stem loop etc.). Das Replikations-Initiator-Protein (REP) dieser Viren wird auf Segment DNA-A kodiert, das Kapsidprotein (CP) auf DNA-B (der ORF p26 auf DNA-C hat keine offensichtlichen Ähnlichkeiten zu anderen bekannten Sequenzen). Man nimmt an, dass diese Viren sich aus Vorfahren der Genomoviridae mit dem üblichen unsegmentierten Genom entwickelt haben. Für diese Klade wurde 2021 die Gattung Gemytripvirus eingerichtet.

## Systematik

Das ICTV hat mit der bisher (Stand 22. Juni 2021) letzten Master Species List #36 folgende Gattungen und Spezies in der Familie bestätigt, ergänzt um einige Stämme nach NCBI:

Familie: Genomoviridae

* Gattung: Gemycircularvirus – 126 Spezies

   * Spezies Gemycircularvirus abati1

   * Spezies Gemycircularvirus alces1

   * Spezies Gemycircularvirus alces2

   * Spezies Gemycircularvirus ansal1

   * Spezies Gemycircularvirus aspar1

   * Spezies Gemycircularvirus austro1

   * Spezies Gemycircularvirus austro2

   * Spezies Gemycircularvirus austro3

   * Spezies Gemycircularvirus austro4

   * Spezies Gemycircularvirus austro5

   * Spezies Gemycircularvirus austro6

   * Spezies Gemycircularvirus bemta1

   * Spezies Gemycircularvirus blabi1 (alias Blackbird associated gemycircularvirus 1) mit Faecal-associated gemycircularvirus 1c

   * Spezies Gemycircularvirus bovas1 (alias Bovine associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 22

   * Spezies Gemycircularvirus bromas1 (alias Bromus associated gemycircularvirus 1) mit Bromus-associated circular DNA virus 3

   * Spezies Gemycircularvirus canlup1

   * Spezies Gemycircularvirus cassa1 (alias Cassava associated gemycircularvirus 1) mit Cassava associated cicular DNA virus

   * Spezies Gemycircularvirus chicas1 (alias Chicken associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 20

   * Spezies Gemycircularvirus chicas2 (alias Chicken associated gemycircularvirus 2) mit Faeces associated gemycircularvirus 17

   * Spezies Gemycircularvirus chickad1 (alias Chickadee associated gemycircularvirus 1) mit Poecile atricapillus GI tract-associated gemycircularvirus

   * Spezies Gemycircularvirus citas1

   * Spezies Gemycircularvirus cybusi1

   * Spezies Gemycircularvirus denbre1

   * Spezies Gemycircularvirus denbre2

   * Spezies Gemycircularvirus denbre3

   * Spezies Gemycircularvirus denbre4

   * Spezies Gemycircularvirus denpo1

   * Spezies Gemycircularvirus derva1

   * Spezies Gemycircularvirus dichism1

   * Spezies Gemycircularvirus draga1 (alias Dragonfly associated gemycircularvirus 1) mit Dragonfly-associated circular virus 2

   * Spezies Gemycircularvirus echiam1

   * Spezies Gemycircularvirus equas1 (alias Equine associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 18

   * Spezies Gemycircularvirus erati1

   * Spezies Gemycircularvirus euhet1

   * Spezies Gemycircularvirus furse1 (alias Fur seal associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 4

   * Spezies Gemycircularvirus geras1 (alias Gerygone associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 6

   * Spezies Gemycircularvirus geras2 (alias Gerygone associated gemycircularvirus 2) mit Faeces associated gemycircularvirus 5

   * Spezies Gemycircularvirus geras3 (alias Gerygone associated gemycircularvirus 3) mit Faeces associated gemycircularvirus 3

   * Spezies Gemycircularvirus giapa1

   * Spezies Gemycircularvirus giapa2

   * Spezies Gemycircularvirus giapa3

   * Spezies Gemycircularvirus giapa4

   * Spezies Gemycircularvirus giapa5

   * Spezies Gemycircularvirus giapa6

   * Spezies Gemycircularvirus giapa7

   * Spezies Gemycircularvirus giapa8

   * Spezies Gemycircularvirus gopha1

   * Spezies Gemycircularvirus gopha2

   * Spezies Gemycircularvirus gopha3

   * Spezies Gemycircularvirus hadtis1

   * Spezies Gemycircularvirus haeme1

   * Spezies Gemycircularvirus haeme2

   * Spezies Gemycircularvirus hydro1

   * Spezies Gemycircularvirus hypas1 (alias Hypericum associated gemycircularvirus 1) mit Hypericum japonicum associated circular DNA virus

   * Spezies Gemycircularvirus ixode1

   * Spezies Gemycircularvirus lamas1 (alias Lama associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 21

   * Spezies Gemycircularvirus lebec1

   * Spezies Gemycircularvirus legle1

   * Spezies Gemycircularvirus lepa2

   * Spezies Gemycircularvirus lepam1

   * Spezies Gemycircularvirus lepam2

   * Spezies Gemycircularvirus lepam3

   * Spezies Gemycircularvirus lynca1

   * Spezies Gemycircularvirus lynca2

   * Spezies Gemycircularvirus lynca3

   * Spezies Gemycircularvirus lynca4

   * Spezies Gemycircularvirus malas1 (alias Mallard associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 7

   * Spezies Gemycircularvirus minio1 (alias Miniopterus associated gemycircularvirus 1)

   * Spezies Gemycircularvirus miniti1

   * Spezies Gemycircularvirus miniti2

   * Spezies Gemycircularvirus miniti3

   * Spezies Gemycircularvirus miniti4

   * Spezies Gemycircularvirus minti6

   * Spezies Gemycircularvirus mocha1

   * Spezies Gemycircularvirus monas1 (alias Mongoose associated gemycircularvirus 1) mit Mongoose feces-associated gemycircularvirus d

   * Spezies Gemycircularvirus mosqi1 (alias Mosquito associated gemycircularvirus 1) mit Mosquito VEM virus SDBVL G

   * Spezies Gemycircularvirus mouti1

   * Spezies Gemycircularvirus mouti2

   * Spezies Gemycircularvirus mouti3

   * Spezies Gemycircularvirus mouti4

   * Spezies Gemycircularvirus mouti5

   * Spezies Gemycircularvirus mouti6

   * Spezies Gemycircularvirus mouti7

   * Spezies Gemycircularvirus mouti8

   * Spezies Gemycircularvirus mouti9

   * Spezies Gemycircularvirus mouti10

   * Spezies Gemycircularvirus mouti11

   * Spezies Gemycircularvirus mouti12

   * Spezies Gemycircularvirus odona1 (alias Odonata associated gemycircularvirus 1) mit Odonata associated gemycircularvirus-1

   * Spezies Gemycircularvirus odona2 (alias Odonata associated gemycircularvirus 2) mit Odonata associated gemycircularvirus-2

   * Spezies Gemycircularvirus oltre1

   * Spezies Gemycircularvirus opunt1

   * Spezies Gemycircularvirus oxcor1

   * Spezies Gemycircularvirus pleca1

   * Spezies Gemycircularvirus poass1 (alias Poaceae associated gemycircularvirus 1) mit Poaceae-associated gemycircularvirus 1

   * Spezies Gemycircularvirus porci1 (alias Porcine associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 19

   * Spezies Gemycircularvirus porci2 (alias Porcine associated gemycircularvirus 2) mit Faeces associated gemycircularvirus 2

   * Spezies Gemycircularvirus ptero1 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 1) mit Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-10

   * Spezies Gemycircularvirus ptero2 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 2) mit Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-2

   * Spezies Gemycircularvirus ptero3 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 3)

   * Spezies Gemycircularvirus ptero4 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 4)

   * Spezies Gemycircularvirus ptero5 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 5)

   * Spezies Gemycircularvirus ptero6 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 6)

   * Spezies Gemycircularvirus ptero7 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 7)

   * Spezies Gemycircularvirus ptero8 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 8)

   * Spezies Gemycircularvirus ptero9 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 9)

   * Spezies Gemycircularvirus ptero10 (alias Pteropus associated gemycircularvirus 10)

   * Spezies Gemycircularvirus raski1

   * Spezies Gemycircularvirus ratas1 (alias Rat associated gemycircularvirus 1) mit Gemycircularvirus gemy-ch-rat1

   * Spezies Gemycircularvirus rebac1

   * Spezies Gemycircularvirus recro1

   * Spezies Gemycircularvirus sarpe1

   * Spezies Gemycircularvirus sclero1 (alias Sclerotinia gemycircularvirus 1, de. Sclerotinia-Gemycircularvirus 1) mit Sclerotinia sclerotiorum hypovirulence-associated DNA virus 1 (SsHADV-1)

   * Spezies Gemycircularvirus sewopo1 (alias Sewage derived gemycircularvirus 1)

   * Spezies Gemycircularvirus sewopo2 (alias Sewage derived gemycircularvirus 2)

   * Spezies Gemycircularvirus sewopo3 (alias Sewage derived gemycircularvirus 3) mit Sewage-associated gemycircularvirus 6

   * Spezies Gemycircularvirus sewopo4 (alias Sewage derived gemycircularvirus 4) mit Sewage-associated gemycircularvirus-7b

   * Spezies Gemycircularvirus sewopo5 (alias Sewage derived gemycircularvirus 5) mit Sewage-associated gemycircularvirus 9

   * Spezies Gemycircularvirus sheas1 (alias Sheep associated gemycircularvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 16

   * Spezies Gemycircularvirus siedo1

   * Spezies Gemycircularvirus solas1

   * Spezies Gemycircularvirus soybe1 (alias Soybean associated gemycircularvirus 1) mit Soybean leaf-associated gemycircularvirus 1

   * Spezies Gemycircularvirus termi1

   * Spezies Gemycircularvirus trilo1

   * Spezies Gemycircularvirus turti1

   * Spezies Gemycircularvirus willde1

   * Species „Mosquito-associated virus Barbados“ (MaVBRB) – vorgeschlagen
* Gattung: Gemyduguivirus – 12 Spezies

   * Spezies Gemyduguivirus arteca1

   * Spezies Gemyduguivirus austo1

   * Spezies Gemyduguivirus bemta1

   * Spezies Gemyduguivirus draga1 (alias Dragonfly associated gemyduguivirus 1) mit Dragonfly-associated circular virus 3

   * Spezies Gemyduguivirus hydro1

   * Spezies Gemyduguivirus hydro2

   * Spezies Gemyduguivirus hydro3

   * Spezies Gemyduguivirus macra1

   * Spezies Gemyduguivirus merre1

   * Spezies Gemyduguivirus minti1

   * Spezies Gemyduguivirus minti2

   * Spezies Gemyduguivirus recro1
* Gattung: Gemygorvirus – 8 Spezies

   * Spezies Gemygorvirus cania1 (alias Canine associated gemygorvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 15

   * Spezies Gemygorvirus hydro1

   * Spezies Gemygorvirus malas1 (alias Mallard associated gemygorvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 14 und Meles meles fecal virus

   * Spezies Gemygorvirus opunt1

   * Spezies Gemygorvirus poaspe1

   * Spezies Gemygorvirus ptero1 (alias Pteropus associated gemygorvirus 1) mit Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-1

   * Spezies Gemygorvirus sewopo1 (alias Sewage derived gemygorvirus 1) mit Human genital-associated circular DNA virus-1 und Sewage-associated gemycircularvirus 5

   * Spezies Gemygorvirus stara1 (alias Starling associated gemygorvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 10
* Gattung: Gemykibivirus – 50 Spezies

   * Spezies Gemykibivirus abati1

   * Spezies Gemykibivirus abati2

   * Spezies Gemykibivirus anima1

   * Spezies Gemykibivirus badas1 (alias Badger associated gemykibivirus 1)

   * Spezies Gemykibivirus bemta1

   * Spezies Gemykibivirus blabi1 (alias Blackbird associated gemykibivirus 1)

   * Spezies Gemykibivirus blaro1 (alias Black robin associated gemykibivirus 1)

   * Spezies Gemykibivirus bovas1 (alias Bovine associated gemykibivirus 1) mit HCBI8.215 virus

   * Spezies Gemykibivirus canfam1

   * Spezies Gemykibivirus cowchi1

   * Spezies Gemykibivirus cybusi1

   * Spezies Gemykibivirus cynas1

   * Spezies Gemykibivirus draga1 (alias Dragonfly associated gemykibivirus 1)

   * Spezies Gemykibivirus echi1

   * Spezies Gemykibivirus galga1

   * Spezies Gemykibivirus galga2

   * Spezies Gemykibivirus galga3

   * Spezies Gemykibivirus giapa1

   * Spezies Gemykibivirus hadtis1

   * Spezies Gemykibivirus haeme1

   * Spezies Gemykibivirus haeme2

   * Spezies Gemykibivirus haeme3

   * Spezies Gemykibivirus haeme4

   * Spezies Gemykibivirus haeme5

   * Spezies Gemykibivirus hipla1

   * Spezies Gemykibivirus humas1 (alias Human associated gemykibivirus 1) mit MSSI2.225 virus, Sewage-associated gemycircularvirus-10a und Sewage-associated gemycircularvirus-10b

   * Spezies Gemykibivirus humas2 (alias Human associated gemykibivirus 2) mit Gemycircularvirus BZ1, Gemycircularvirus BZ2, Gemycircularvirus NP, Gemycircularvirus SL1, Gemycircularvirus SL2 und Gemycircularvirus SL3

   * Spezies Gemykibivirus humas3 (alias Human associated gemykibivirus 3) mit Gemycircularvirus C1c und Mongoose feces-associated gemycircularvirus c

   * Spezies Gemykibivirus humas4 (alias Human associated gemykibivirus 4) mit Human gemycircularvirus GeTz1

   * Spezies Gemykibivirus humas5 (alias Human associated gemykibivirus 5) mit Gemycircularvirus HV-GcV2

   * Spezies Gemykibivirus hydro1

   * Spezies Gemykibivirus hydro2

   * Spezies Gemykibivirus hydro3

   * Spezies Gemykibivirus minti1

   * Spezies Gemykibivirus monas1 (alias Mongoose associated gemykibivirus 1) mit Mongoose feces-associated gemycircularvirus b

   * Spezies Gemykibivirus mouti1

   * Spezies Gemykibivirus mouti2

   * Spezies Gemykibivirus pitis1

   * Spezies Gemykibivirus pitis2

   * Spezies Gemykibivirus planta1

   * Spezies Gemykibivirus planta2

   * Spezies Gemykibivirus ptero1 (alias Pteropus associated gemykibivirus 1) mit Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-12

   * Spezies Gemykibivirus raski1

   * Spezies Gemykibivirus rhina1 (alias Rhinolophus associated gemykibivirus 1) mit Mongoose feces-associated gemycircularvirus a

   * Spezies Gemykibivirus rhina2 (alias Rhinolophus associated gemykibivirus 2)

   * Spezies Gemykibivirus sewopo1 (alias Sewage derived gemykibivirus 1) mit Sewage associated gemycircularvirus 3

   * Spezies Gemykibivirus sewopo2 (alias Sewage derived gemykibivirus 2) mit Sewage-associated gemycircularvirus 2

   * Spezies Gemykibivirus turti1

   * Spezies Gemykibivirus waste1

   * Spezies Gemykibivirus womot1
* Gattung: Gemykolovirus – 16 Spezies

   * Spezies Gemykolovirus abati1

   * Spezies Gemykolovirus citas1

   * Spezies Gemykolovirus derva1

   * Spezies Gemykolovirus easlu1

   * Spezies Gemykolovirus echia1

   * Spezies Gemykolovirus gopha1

   * Spezies Gemykolovirus gopha2

   * Spezies Gemykolovirus hadtis1

   * Spezies Gemykolovirus heris1

   * Spezies Gemykolovirus lepam1

   * Spezies Gemykolovirus poaspe1

   * Spezies Gemykolovirus prupe1

   * Spezies Gemykolovirus ptero1 (alias Pteropus associated gemykolovirus 1) mit Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-6

   * Spezies Gemykolovirus ptero2 (alias Pteropus associated gemykolovirus 2) mit Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-7

   * Spezies Gemykolovirus segpa1

   * Spezies Gemykolovirus troti1
* Gattung: Gemykrogvirus – 13 Spezies

   * Spezies Gemykrogvirus abati1

   * Spezies Gemykrogvirus apime1

   * Spezies Gemykrogvirus bovas1 (alias Bovine associated gemykrogvirus 1) mit HCBI9.212 virus

   * Spezies Gemykrogvirus carib1 (alias Caribou associated gemykrogvirus 1) mit Caribou feces-associated gemycircularvirus

   * Spezies Gemykrogvirus galga1

   * Spezies Gemykrogvirus galga2

   * Spezies Gemykrogvirus galga3

   * Spezies Gemykrogvirus galga4

   * Spezies Gemykrogvirus galga5

   * Spezies Gemykrogvirus giapa1

   * Spezies Gemykrogvirus hadtis1

   * Spezies Gemykrogvirus humas1

   * Spezies Gemykrogvirus sewopo1 (alias Sewage derived gemykrogvirus 1) mit Sewage-associated gemycircularvirus 4
* Gattung: Gemykroznavirus – 7 Spezies

   * Spezies Gemykroznavirus anima1

   * Spezies Gemykroznavirus haeme1

   * Spezies Gemykroznavirus hydro1

   * Spezies Gemykroznavirus poaspe1

   * Spezies Gemykroznavirus rabas1 (alias Rabbit associated gemykroznavirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 11

   * Spezies Gemykroznavirus solas1

   * Spezies Gemykroznavirus zizan1
* Gattung: Gemytondvirus – 1 Spezies

   * Spezies Gemytondvirus ostri1 (alias Ostrich associated gemytondvirus 1) mit Faeces associated gemycircularvirus 12
* Gattung: Gemytripvirus – 1 Spezies (Genom hat 3 Segmente)

   * Spezies Gemytripvirus fugra1 (veraltet Fusarium graminearum gemytripvirus 1, FgGMTV1)
* Gattung: Gemyvongvirus – 3 Spezies

   * Spezies Gemyvongvirus humas1 (alias Human associated gemyvongvirus 1) mit Human plasma-associated gemycircularvirus

   * Spezies Gemyvongvirus minit1

   * Spezies Gemyvongvirus minit2
* Gattung „Gemydayravirus“ ? (vermutet wegen Namensgebung der vorgeschlagenen Spezies)

   * Spezies „Botrytis gemydayravirus 1“ – vorgeschlagen
