Archaeoglobaceae
# Archaeoglobaceae

Archaeoglobaceae bezeichnet eine Familie von Archaeen im Phylum Euryarchaeota. Alle bekannten Gattungen der Archaeoglobaceae sind hyperthermophil (extrem hitzeliebend) und kommen in der Nähe von Hydrothermalquellen im Meer vor. In der gegenwärtig akzeptieren Taxonomie sind die Archaeoglobaceae die einzige Familie in der Ordnung Archaeoglobales, die wiederum die einzige Ordnung in der Klasse Archaeoglobi ist. Metagenomik-Daten legen jedoch die Existenz weiterer Mitglieder in der Ordnung und der Klasse nahe.

## Metabolismus

Auch wenn sie alle phylogenetisch miteinander verwandt sind, unterscheiden sich die Gattungen der Archaeoglobaceae in Einzelheiten ihres Stoffwechsels. Die Archaeen der Gattung Archaeoglobus sind chemoorganotrophe und sulfatreduzierend. Sie sind die einzigen bekannten Vertreter der Archaeen, die über diese Art des Stoffwechsels verfügen (Stand 2005). Die Mitglieder der Gattung Ferroglobus sind hingegen chemolithotrophe Organismen und verbinden die Oxidation von Eisen mit der Reduktion von Nitrat. Die Vertreter der Gattung Geoglobus sind eisenreduzierende Archaeen, die Wasserstoffgas oder organische Verbindungen als Energiequelle nutzen.

## Systematik

Die hier angegebene Taxonomie basiert auf folgenden Quellen:

* (L) – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)
* (N) – National Center for Biotechnology Information (NCBI)
* (G) – Genome Taxonomy Database (GTDB).

Die unter Einbeziehung von Metagenomik-Daten erstellte GTDB teilt etliche der Gattungen und Spezies aus der herkömmlichen Systematik auf, einschließlich des Geoglobus-Stammes SBH6.

Referenzstämme sind durch ein hochgestelltes T (englisch type) gekennzeichnet, die Typ-Taxa sind fett wiedergegeben. Stand: Anfang März 2023.

Klasse Archaeoglobi Garrity & Holt $2002^{(G,L,N)}$

* Ordnung Archaeoglobales Huber & Stetter $2002^{(G,L,N)}$
   * Familie Archaeoglobaceae Huber & Stetter $2002^{(G,L,N)}$
      * Gattung Archaeoglobus Stetter $1988^{(G,L,N)}$
         * Spezies Archaeoglobus fulgidus Stetter 1988 $(Typusart)^{(G,L,N)}$ mit $VC-16^T$ alias $ATCC:49558^T,$ $DSM:4304^T,$ $JCM:9628^T^{(G,L,N)}$ oder $NBRC:100126^T^{(G,N)}$ und $DSM:8774^{(G,N)}$ – Fundort: Italien, bei Insel Vulcano Habitat: Raucher (Hydrothermie) und Thermalquellen weltweit bzw. Nordsee, marines $Ölfeld^{(N)}$
         * Spezies Archaeoglobus $fulgidus_A^{(G)}$ mit $SpSt-87^T^{(G,N)}$ – Fundort: Nevada, Great Boiling $Spring^{(N)}$
         * Spezies Archaeoglobus infectus Mori et al. $2008^{(L,N)}$ [Archaeoglobus sp. $Arc51^{(N)}]$ mit $Arc5^T$ alias $DSM:18877^T^{(L,N)}$ – Fundort: Nordwestpazifik, Izu-Bonin-Bogen, Suiyo-Seamount, Tiefsee-Hydrothermalfeld
         * Spezies Archaeoglobus neptunius Slobodkina et al. $2021^{(L,N)}$ [Archaeoglobus $sp016757965,^{(G)}$ Archaeoglobus sp. $SE56^{(N)}]$ mit $SE56^T^{(L,G,N)}$ alias $DSM:110954^T^{(L,N)}$ – Fundort: Mittelatlantischer Rücken, $TAG-Hydrothermalfeld^{(N)}$
         * Spezies Archaeoglobus lithotrophicus Stetter et al. $1993^{(L,N)}$ mit $TF2^T^{(L,N)}$ – Fundort: Nordsee, Thistle-Ölfeld
      * Gattung $Archaeoglobus_A^{(G)}$
         * Spezies Archaeoglobus_A $sulfaticallidus^{(G)}$ [Archaeoglobus sulfaticallidus Steinsbu et al. $2010^{(L,N)}]$ mit $PM70-1^T^{(L,G,N)}$ alias $DSM:19444^T^{(L,N)}$ – Fundort: Pazifik, Ostflanke des Juan-de-Fuca-Rückens
         * Spezies Archaeoglobus_A $sp002010195^{(G)}$ [Archaeoglobus sp. $JdFR-32^{(N)}]$ – Fundort: Pazifik, Bodenfluide des Juan-de-Fuca-Rückens
      * Gattung $Archaeoglobus_B^{(G)}$
         * Spezies Archaeoglobus_B $profundus^{(G)}$ [Archaeoglobus profundus Burggraf et al. $1990^{(L,N)}]$ mit $AV1^T^{(L,N)}$ alias $DSM:5631^T^{(L,G,N)}$ – Fundort: Golf von Kalifornien, $Guaymas-Becken^{(N)}$
         * Spezies Archaeoglobus_B $sp003663025^{(G)}$ mit Archaeoglobales archaeon isolate $B35_G2^T^{(G,N)}$ – Fundort: Golf von Kalifornien, Guaymas Basin
      * Gattung $Archaeoglobus_C^{(G)}$
         * Spezies Archaeoglobus_C $veneficus^{(G)}$ [Archaeoglobus veneficus Huber et al. $1998^{(L,N)}]$ mit $SNP6^T^{(L,G,N)}$ alias $DSM:11195^T^{(L,N)}$ – Fundort: Mittelatlantischer Rücken, Snake Pit Hydrothermalfeld
         * Spezies Archaeoglobus_C $sp003663055^{(G)}$ mit Archaeoglobales archaeon isolate $B10_G2^T^{(G,N)}$ – Fundort: Golf von Kalifornien, Guaymas Basin
      * Gattung Ferroglobus Hafenbradl et al. $1997^{(L,G,N)}$
         * Spezies Ferroglobus placidus Hafenbradl et al. $1997^{(L,G,N)}$ mit $AEDII12DO^T^{(L,N)}$ alias $DSM:10642^T^{(L,G,N)}$ – Fundort: Italien, Hydrothermalfeld vor Insel $Vulcano^{(N)}$
         * Spezies Ferroglobus $sp015520115^{(G)}$ mit Ferroglobus sp. isolate $S146_9^T^{(G,N)}$ – Fundort: Pazifik, Brothers Volcano
      * Gattung Geoglobus Kashefi et al. $2002^{(L,G,N)}$
         * Spezies Geoglobus acetivorans Slobodkina et al. $2009^{(L,G,N)}$ [Geoglobus sp. $SBH6^{(N)}]$ mit $SBH6^T^{(L,G,N)}$ (ASM78925v1, $SAMN03070125)^{(G)}$ alias $DSM:21716^{(N)}$ – Fundort: Mittelatlantischer Rücken, Ashadze-Hydrothremalfeld
         * Spezies Geoglobus $acetivorans_A^{(G)}$ mit $SBH6:LDL_001^T^{(G)}$ (ASM1516348v1, SAMN16077771, Probenname: LDL_001) – Fundort: Mittelatlantischer Rücken, Ashadze-Hydrothremalfeld
         * Spezies Geoglobus ahangari Kashefi et al. $2002^{(L,G,N)}$ [Hyperthermophile str. $234^{(N)}]$ mit $234^T^{(L,G,N)}$ alias $ATCC:BAA-425^T^{(L,N)}$ – Fundort: Golf von Kalifornien, $Guaymas-Becken^{(N)}$
         * Spezies Geoglobus $ahangari_A^{(G)}$ mit $SpSt-97^T^{(G,N)}$ – Fundort: Nevada, Great Boiling $Spring^{(N)}$
      * Gattung „Candidatus Methanomixotrophus“ corrig. Liu et al. $2020^{(L)}$ [„Ca. Methanomixophus“ Liu et al. $2020^{(L)}]$
         * Spezies „Ca. Methanomixotrophus dualis“ corrig. Liu et al. $2020^{(L)}$ [„Ca. Methanomixophus dualitatem“ Liu et al. $2020^{(L)}]$ mit $WYZ-LMO1^T,$ kurz $LMO1^T$ (und [WYZ-]LMO3) – Fundort: Yellowstone-Nationalpark, Washburn Spring (bzw. Obsidian Pool)
         * Spezies „Ca. Methanomixotrophus hydrogenitrophicus“ corrig. Liu et al. $2020^{(L)}$ [„Ca. Methanomixotrophus hydrogenitrophicum“ Liu et al. $2020^{(L)}]$ mit $Bin16^T$ – Fundort: China, Jiangsu Erdölreservoir
      * Gattung „Candidatus Methanoproducendum“ Hua et al. 2019
         * Spezies „Ca. Methanoproducendum senex“ Hua et al. 2019 mit GMQP $bin_32^T$ – Fundort: China, Tengchong, Heiße Quelle GuMingQuan
   * Familie $JdFR-42^{(G)}$
      * Gattung $JdFR-42^{(G)}$
         * Spezies JdFR-42 $sp002010305^{(G)}$ [Archaeoglobi archaeon $JdFR-42^{(N)}]$ mit $JdFR-42^T^{(G,N)}$ – Fundort: Pazifik, Fluide in der basaltischen Flanke des $Juan-de-Fuca-Rückens^{(N)}$
   * Mitglieder der Ordnung Archaeoglobales incertae sedis
   *   * Spezies Archaeoglobales archaeon $ex4484_92^{(N)}$ mit $ex4484_92^T^{(G,N)}$ (GTDB:Failed Quality Check) – Fundort: Golf von Kalifornien, Guaymas $Basin^{(N)}$
* Ordnung $JdFR-21^{(G)}$
   * Familie $JdFR-21^{(G)}$
      * Gattung $JdFR-21^{(G)}$
         * Spezies JdFR-21 $sp002011165^{(G)}$ [Euryarchaeota archaeon $JdFR-21^{(N)}]$ mit $JdFR-21^T^{(G,N)}$ – Fundort: Pazifik, Bodenfluide des $Juan-de-Fuca-Rückens^{(N)}$

Da Archaeoglobus infectus in der GTDB nicht repräsentiert ist, bleibt die genaue Zuordnung dieser Art zu einer Gattung nach dem dort vorgenommenen Split unsicher.

## Phylogenie

| 16S-rRNA-basiert LTP_01_2022 | auf 53 Markerproteinen basiert GTDB 07-RS207 |
| - | - |
| $^​$   $^​$  Archaeoglobus infectus   Archaeoglobus[_A] sulfaticallidus  $^​$   $Geoglobus^​$  G. acetivorans   G. ahangari  $^​$   $Archaeoglobus^​$  A. fulgidus (Typus)   A. neptunius  $^​$  Archaeoglobus[_C] veneficus  $^​$  Ferroglobus placidus   Archaeoglobus[_B] profundus Vorlage:Klade/Wartung/Style | $^​$   $^​$   Ferroglobus  F. placidus  $Geoglobus^​$  G. acetivorans   G. ahangari  $Archaeoglobus^​$  Archeoglobus[_B] profundus  $^​$  Archeoglobus fulgidus (Typus)  $^​$  Archaeoglobus[_C] veneficus   Archaeoglobus[_A] sulfaticallidus Vorlage:Klade/Wartung/Style |

In eckigen Klammern ist vermerkt, in welchen Gattungen sich die Archaeoglobus-Arten nach dem in der GTDB vorgenommenen Split wiederfinden.

