Chloroflexota
# Chloroflexota
## Introdução

Chloroflexaceae ou Chloroflexi são bactérias verdes não sulfurosas. Obtêm energia mediante fotossíntese. A sua denominação deve-se ao fato de possuírem um pigmento verde, que se encontra geralmente associado a estruturas membranosas internas chamadas clorossomas.
As bactérias deste grupo são tipicamente filamentosas e movem-se mediante deslizamento sobre superfícies. São aeróbios facultativas, mas não produzem oxigênio durante a fotossíntese; realizam fotossíntese anoxigénica. A sua via de fixação de carbono também difere da de outras bactérias fotossintéticas.
Bactérias do filo Chloroflexi, são comuns e abundantes em comunidades microbianas de vida livre [1] [2] [3] [4]. Uma razão para seu sucesso é sua diversidade metabólica; cepas cultivadas do filo incluem podem ser aeróbios termófilos, fotossintetizantes anoxígenos (apesar do nome “não sulfurosa”, essas bactérias usam H2S na fotossíntese), ou ainda crescer anaerobicamente utilizando compostos halógenos como fonte de energia [5].
Os representantes cultivados do filo são classificados em quatro classes pelo banco de dados de taxonomia do genoma [6], pela Cloroflexia e Ktedonobacteria principalmente aeróbias e pelas anaeróbias Anaerolineae e Dehalococcoidia [5].
Um dos principais representantes, Chloroflexus, é filamentoso, termofílico e cresce em associação com cianobactérias, dando origem à cor laranja-avermelhada de fontes termais.

## História

Em 1987, Carl Woese dividiu as Eubactérias baseado na sequencia de RNA ribossomal 16S e agrupou os gêneros Chloroflexus , Herpetosiphon e Thermomicrobium em "bactérias e parentes verdes não-enxofre" [28][29], que foi temporariamente renomeada como "Chloroflexi" no primeiro volume do Manual de Bacteriologia Sistemática de Bergey [30].
Sendo um filo ramificação profunda, a sua classificação foi analisada no primeiro volume do Manual de Bacteriologia Sistemática de Bergey e incluiu uma única classe com o mesmo nome, a classe Chloroflexi [30]. Desde 2001 no entanto, novas classes foram criadas graças a espécies recém-descobertas, sendo o filo Chloroflexi é dividido em [31]:
* Chloroflexi Gupta et al. 2012
* Thermomicrobia Hugenholtz & Stackebrandt de 2004
* "Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt de 2004
* Anaerolineae Yamada et al., 2006
* Caldilineae Yamada et al., 2006
* Ktedonobacteria Cavaletti et al., 2007 emenda. Yabe et al., 2010
Em relação à classe "Dehalococcoidetes ", o nome do marcador foi determinado por Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 [32], depois de "Dehalococcoides ethenogenes", uma espécie parcialmente descrita em 1997 [33], sendo que a primeira espécie totalmente descrita foi a Dehalogenimonas lykanthroporepellens por Moe et al. 2009 [34].

## Etimologia

O nome "Chloroflexi" é um Neolatin plural de "Chloroflexus", que é o nome do primeiro gênero descrito. O substantivo é uma combinação do grego chloros (χλωρός) [6], que significa "amarelo-esverdeado" e o latim flexus (do flecto) [7], que significa "dobrado" para significar "uma flexão verde" [8]. Deve ser, portanto, notar-se que a etiologia não é devida ao cloro, um elemento (ar ácido muriático deflogisticado) que foi confirmada como tal em 1810 por Humphry Davy e nomeado após a sua cor verde pálido. Outra filo com a mesma raiz é Chlorobi , enquanto Cyanobacteria tem as raízes cianobactérias (κύανος) que significa "azul-verde".

## Taxonomia

A análise genômica comparativa refinou a taxonomia da classe Cloroflexia, dividindo os Chloroflexales na subordem Chloroflexineae, consistindo das famílias Oscillachloridaceae e Chloroflexaceae, e da subordem Roseiflexineae, família Roseiflexaceae [9]. A taxonomia revisada foi baseada na identificação de um número de indels de assinatura conservada (CSIs) que servem como marcadores moleculares altamente confiáveis ​​de ancestralidade compartilhada [9] [10] [11]. Apoio adicional para a divisão dos Chloroflexales em duas subordens são as diferenças observadas nas características fisiológicas, onde cada subordem é caracterizada por carotenóides distintos, quinonas e perfis de ácidos graxos que estão consistentemente ausentes na outra subordem [10] [11]. Além de demarcar fileiras taxonômicas, os CSIs podem desempenhar um papel nas características únicas dos membros dentro do clado. Em particular, uma inserção de quatro aminoácidos na proteína piruvato flavodoxina / ferredoxina oxidoredutase, uma proteína que desempenha um papel importante em organismos fotossintéticos, foi encontrada exclusivamente entre todos os membros do gênero Chloroflexus, e acredita-se que desempenhe um importante papel funcional [14].
Atualmente, taxonomia aceita segue a lista abaixo [20, 21, 22]:
* Ordem Chloroflexales
** Subordem Chloroflexineae
*** Família Chloroflexaceae Trüper 1976 emend. Gupta et al. 2013
**** Gênero Chloroflexus Pierson and Castenholz 1974
***** C. aggregans Hanada et al. 1995
***** C. aurantiacus Pierson and Castenholz 1974
*** Família Oscillochloridaceae Keppen 2000 emend. Gupta et al. 2013
**** Gênero Oscillochloris Gorlenko and Pivovarova 1989 emend. Keppen et al. 2000
***** O. chrysea Gorlenko and Pivovarova 1989
***** O. trichoides (ex Szafer) Gorlenko and Korotkov1989 emend. Keppen et al. 2000
**** Gênero Chloronema Dubinina and Gorlenko 1975
***** Chloronema giganteum Dubinina and Gorlenko 1975
** Subordem Roseiflexineae
*** Família Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
**** Gênero Roseiflexus Hanada et al. 2002
***** Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002
**** Gênero Heliothrix Pierson et al. 1986
***** Heliothrix oregonensis Pierson et al. 1986
* Ordem "Herpetosiphonales"
** Família "Herpetosiphonaceae"
*** Gênero Herpetosiphon Holt and Lewin 1968
**** H. aurantiacus Holt and Lewin 1968
**** H. geysericola (Copeland 1936) Lewin 1970

## Curiosidades

* Estima-se que o Chloroflexi dominará a comunidade microbiana de alguns sedimentos de fundos marinhos e também podem constituir 12% e 16% da comunidade de pastagens temperadas e prados alpinos, respectivamente. Muitos dos Chloroflexi presentes nestes ambientes formam linhagens muito ramificadas não relacionadas a quaisquer cepas isoladas de Chloroflexi [23].
* Membros do gênero Dehalococcoides foram encontrados para "desclorar" uma ampla gama de contaminantes orgânicos persistentes e, como parte de consórcios mistos, acredita-se que espécies semelhantes a Dehalococcoides sejam promissoras para aplicações de biorremediação [24, 25, 26].
* Filo Chloroflexi isolado Anaerolineae bactéria HOT-439 é dependente de uma cepa auxiliar para o crescimento. Com 12 dias de crescimento: (a) com e (b) sem listras cruzadas F. nucleatum (Figura 1.) [27].