Euryarchaeota
# Euryarchaeota

Euryarchaeota (do grego: εὐρύς eurús, "largo") é um reino do domínio Archaea que inclui um grupo muito diverso de formas termofílicas e halofílicas, aeróbicas e anaeróbicas. As arqueias do agrupamento Euryarchaeota são altamente diversas e incluem as espécies metanogénicas (as arqueias metanogénicas), frequentemente encontrados nos intestinos de mamíferos, as espécies conhecidas por halobactérias, que sobrevivem em concentrações extremas de sal, e alguns organismos extremamente termofílicos, aeróbios e anaeróbios, que geralmente vivem em temperaturas entre 41 °C e 122 °C. Diferem dos outros arqueanos com base principalmente nas sequências rRNA e na sua DNA polimerase de estrutura única.

## Descrição

Os Euryarchaeota são diversos em aparência e propriedades metabólicas. O filo contém organismos com uma grande variedade de formas, incluindo bastonetes e cocos. Euryarchaeota pode aparecer gram-positivo ou gram-negativo dependendo se pseudomureína está presente na parede celular. Os Euryarchaeota também demonstram estilos de vida diversos, incluindo organismos metanogénicos, halófilos, redutores de sulfato e termófilos extremos. Outros vivem no oceano, suspensos na coluna de água com plâncton e bactérias. Embora esses Euryarchaeota marinhos sejam difíceis de cultivar e estudar em laboratório, o sequenciamento genómico sugere que eles são heterotróficos móveis.
Embora se pensasse anteriormente que os euryarchaeota viviam apenas em ambientes extremos (em termos de temperatura, teor de sal e/ou pH), um artigo publicado em janeiro de 2019 mostrou que os Euryarchaeota também vivem em ambientes moderados, como baixa temperatura e ambientes ácidos. Em alguns casos, Euryarchaeota superou em número as bactérias presentes.
Euryarchaeota também foram encontrados em outros ambientes moderados, como nascentes de água, pântanos, solo e rizosfera. Alguns Euryarchaeota são altamente adaptáveis; os membros da ordem Halobacteriales são geralmente encontrados em ambientes extremamente salgados e ricos em enxofre, mas também podem crescer em concentrações de sal tão baixas quanto a da água do mar a 2,5%.Nas rizosferas, a presença de Euryarchaeota parece ser dependente de micorrizas produzidas por fungos; uma maior população fúngica foi correlacionada com maior frequência e diversidade Euryarchaeota, enquanto a ausência de fungos micorrízicos foi correlacionada com a ausência de Euryarchaeota.

## Filogenia

A taxonomia atualmente mais consensual é baseada na List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) and National Center for Biotechnology Information (NCBI):
| baseado em 16S rRNA em LTP_12_2021. | Dombrowski et al., 2019, Jordan et al., 2017 e Cavalier-Smith, 2020. |
| Archaea   Methanopyri     TACK   Nitrososphaerota     Thermoproteota     Euryarchaeota       Methanococci     Thermoplasmata         Archaeoglobi     Thermococci           Methanobacteria         Methanonatronarchaeia     Methanomicrobia       Halobacteria | Outras análises filogenéticas sugeriram que as Archaea do clado DPANN também podem pertencer a Euryarchaeota e que podem até ser um grupo polifilético ocupando diferentes posições filogenéticas dentro de Euryarchaeota. Também é debatido se o filo Altiarchaeota deve ser classificado em DPANN ou Euryarchaeota. Um cladograma resumindo esta proposta é apresentado graficamente abaixo. Os grupos marcados entre aspas são linhagens atribuídas ao DPANN, mas separadas filogeneticamente das demais. Archaea Euryarchaeota     Thermococci       Hadesarchaea         Methanobacteria       Methanopyri     Methanococci             Thermoplasmata       Archaeoglobi       Methanomicrobia       "Nanohaloarchaeota"     Haloarchaea               "Altiarchaeota"   DPANN     Diapherotrites     Micrarchaeota         Undinarchaeota       Aenigmarchaeota         Nanoarchaeota     Parvarchaeota         Mamarchaeota       Pacearchaeota     Woesearchaeota                           Proteoarchaeota   TACK   Asgard     Lokiarchaeota       Odinarchaeota     Thorarchaeota           Heimdallarchaeota   (+α─Proteobacteria) Eukaryota |
Por sua vez, a GTDB 08-RS214, com base em 53 marcadores proteícos, apresenta a seguinte árvore filogenética:
| Archaea "Undinarchaeota"  "Huberarchaeaota"  "Aenigmarchaeota"  "Nanohalarchaeota"  "Nanoarchaeota"  "Altarchaeota"  "Iainarchaeota"  "Micrarchaeota"  "Hadarchaeota" "Hadarchaeia"  Methanobacteriota_B Thermococci  "Methanomada" "Hydrothermarchaeota" "Hydrothermarchaeia"  "Methanobacteriota" Methanopyri  Methanococci  Methanobacteria  "Neoeuryarchaeota" "Thermoplasmatota" "Izemarchaea" (MBG-D, E2)  "Poseidoniia" (MGII & MGIII)  Thermoplasmata  "Halobacteriota" Archaeoglobia  "Methanoliparia"  "Syntropharchaeia"  "Methanocellia"  "Methanosarcinia"  Methanosarcinia_A  Methanomicrobia  Methanonatronarchaeia  Halobacteria  "Proteoarchaeota" "Asgardaeota" Thermoproteota | DPANN Euryarchaeota s.s. |

## Sistemática

A nomenclatura atualmente mais consensual é baseada na List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) e no National Center for Biotechnology Information (NCBI), com base nas sequência do gene 16S rRNA.
* Grupo Methanomada (NCBI)
** Methanobacteria Boone 2002
*** Methanobacteriales Bach & Wolfe 1981
**** Methanothermobacter
** Methanococci Boone 2002
*** Methanococcales
**** Methanocaldococcaceae
**** Methanococcaceae
* Grupo Stenosarchaea (NCBI)
** Halobacteria Grant et al. 2002
*** Halobacteriales
**** Haloarculaceae
***** Halapricum
***** Haloarcula
**** Halobacteriaceae
***** Halobacterium
***** Natronococcus
**** Halococcaceae
***** Halococcus
*** Haloferacales
**** Haloferacaceae
***** Haloquadratum
**** Halorubraceae
***** Halorubrum
** „Methanofastidiosa“ Nobu et al. 2016 (früher: ASA2/Arcl)
** „Methanomicrobia“ Garrity et al. 2003
*** Methanocellales (anteriormente RC-I)
**** Methanocellaceae
***** Methanocella
*** Methanomicrobiales
**** Methanocorpusculaceae
**** Methanomicrobiaceae
***** Methanomicrobium
***** Methanoculleus
**** Methanospirillaceae
***** Methanospirillum
*** Methanosarcinales
**** Methanosaetaceae
***** Methanothrix
**** Methanosarcinaceae
***** Methanosarcina
***** Methanohalophilus
**** Methermicoccaceae
** Nanohaloarchaea
* outros
** Archaeoglobi Garrity & Holt 2002
*** Archaeoglobales
**** Archaeoglobaceae
***** Archaeoglobus
***** Ferroglobus
** „Methanoliparia“ Borrel et al. 2019
** „Methanonatronarchaeia“ Sorokin et al. 2017
** Methanopyri Garrity & Holt 2002
*** Methanopyrales
**** Methanopyraceae
***** Methanopyrus kandleri
** Thermococci Zillig & Reysenbach 2002
*** Thermococcales
**** Thermococcaceae
** Outros géneros não atribuídos a nenhuma ordem ou família (em incertae sedis)
* Não atribuído a nenhum grupo ou classe/atribuição incerta (em incertae sedis)
** „Thalassoarchaea“ Martin-Cuadrado et al. 2015 (NCBI: para Thermoplasmatota)
** Thermoplasmata Reysenbach 2002 (NCBI: para Thermoplasmatota)
*** Thermoplasmatales
**** Ferroplasmataceae
**** Picrophilaceae
**** Thermoplasmataceae
***** Thermoplasma
** „Altiarchaeales“ Probst et al. 2014 (sin. Altiarchaea, antes: SM1; NCBI: zu Altiarchaeota in DPANN)
* Agrupamentos não atribuídas no LPSN, mas listadas como Euryarchaeota na taxonomia do NCBI:
** „Theionarchaea“ Lazar et al. 2017 (parcialmente atribuído a Theinoarchaea; antes: Z7ME43)
** „Hadesarchaea“ Baker et al. 2015 (sin. „Hadarchaeia“ Chuvochina et al.; antes SAGMEG: South-African Goldmine Miscellaneous Euryarchaeal Group). O Genome Taxonomy Database (GTDB) representa a classe Hadesarcheia junto com a tribo Archaea B88_G9 (origem: bacia Guaymas, Golfo da CAlifórnia) num filo Hadarchaeota.
** Candidate division MSBL1 (MSBL-1, Mediterranean Seafloor Brine Lake Group 1) van der Wielen et al. 2005 (syn. „Persephonarchaeia“ corrig. Mwirichia et al. 2016) Die Vertreter der MSBL1 werden bislang (Stand 20. Februar 2023) in der GTDB nicht berücksichtigt, da die Genomdaten keine ausreichende Qualität haben. Adam et al. (2017) sehen die MSBL1-Archaeen zusammen mit den Hadesarchaea in einer gemeinsamen Klade mit vorgeschlagener Bezeichnung „Stygia“.
Um número de grupos anteriormente atribuídos ao Euryarchaeota foram deslocados para o superfilo Archaea DPANN de acordo com descobertas mais recentes:
* Grupo Micrarchaeota-Diapherotrites, antes MEG-Cluster
* Aenigmarchaeota, antes DSEG-Cluster
* Grupo Woesearchaeota-Pacearchaeota, antes DHVEG-6-Cluster

### Cladograma

Notas: ♠ Taxon nur bei NCBI, nicht auf der LPSN. Die Hadesarchaea werden alternativ als eigenständiges Phylum Hadesarchaeota geführt. Die Nanohaloarchaea werden alternativ als Nanohaloarchaeota der Archaeen-Supergruppe DPANN, einem Schwestertaxon der Euryarchaeota, zugeordnet.
Kladogramm der Euryarchaeota nach Spang et al. (2017)
Notas: Predefinição:FNZ ● Klassifizierung mariner Archaeen 0 As arqueias marinhas podem ser classificadas da seguinte forma:
* Marine Group I (MG-I oder MGI): marine Thaumarchaeota, Ordnung Nitrosopumilales mit Untergruppen Ia (alias I.a) bis Id
* Marine Group II (MG-II): marine Euryarchaeota, Ordnung Poseidoniales (alias Poseidoniia/Thalassoarchaea) mit Untergruppen IIa bis IId (IIa entspricht Poseidoniaceae, IIb entspricht Thalassarchaceae) Viren, die MGII parasitieren, werden als Magroviren bezeichnet.
* Marine Group III (MG-III): alias Marine Benthic Group D (MBG-D), ebenfalls marine Euryarchaeota
* Marine Group IV (MG-IV): ebenfalls marine Euryarchaeota
* Undinarchaeales (englisch marine MAGs) – MHVG (Marine Hydrothermal Vent Group): zu Undinarchaeota (DPANN)
● Acrónimos de outros grupos:
* SAGMEG – South-African Gold Mine Miscellaneous Euryarchaeal Group
* MSBL – Mediterranean Sea Brine Lakes
* DHVE – deep-sea hydrothermal vent euryarchaeota
* MBGD – Marine Benthic Group D
* ANME – anaerobic methane oxidizing euryarchaeota