Straboviridae
# Straboviridae

Straboviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes), die Bakterien infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen genannt). Die Familie wurde im März/April 2022 vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) eingerichtet.

## Forschungsgeschichte

Diese Familie wurde vom ICTV eingerichtet, um alle T4-ähnlichen Phagen, die histotrophe Bakterien infizieren, zusammenzufassen – einschließlich der bestehenden Unterfamilien Tevenvirinae, Emmerichvirinae und Twarogvirinae. Um Monophylie herzustellen, wurden gleichzeitig die folgenden Gattungen aus der Unterfamilie Tevenvirinae ausgegliedert: Schizotequatrovirus, Slopekvirus, Pseudotevenvirus und Krischvirus . Die T4-ähnlichen Cyanophagen wurden dagegen in der Familie Kyanoviridae zusammengefasst. Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den damals neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae.

## Beschreibung

Die Viruspartikel (Virionen) der Straboviridae haben die für Mitglieder der Caudoviricetes typische Kopf-Schwanz-Struktur, das Kapsid des Kopfes hat keine Hülle. Der längliche ist 120 nm lang und 86 nm breit. Das Kapsid hat eine längliche (d. h. nicht-isometrische) ikosaedrische Symmetrie T=13 Q=21 und besteht aus 152 Kapsomeren. Der Schwanz ist kontraktil und hat 6 lange Endfasern, dazu 6 kurze Stacheln (Spikes) und eine kleine Grundplatte.

## Genom und Proteom

Die Straboviridae haben ein lineares dsDNA-Genom mit einer Länge von etwa 169 kbp (Kilobasenpaaren), das für etwa 300 Proteine kodiert. Die Gene werden von Operons transkribiert. Sie kodieren u. a. für folgende Gene:
* Desoxyadenosin-Methylase (DNA-Adenin-Methylase) [P04392]
* (DNA-abhängige) DNA-Polymerase [P04415]
* DNA-Topoisomerase [P09176]
* DNA-Primase [P04520]
* Serin-Protease (Peptidase S77) [P06807]
* ADP-Ribosyl-Transferase [P39423, P39421]
* NAD(+)-Arginin ADP-Ribosyl-Transferase [P12726]
* DNA-Ligase [P00970]
* RNA-Ligase [P32277]
* Exonuklease [P04521]
* Endonuklease [P04418, P07059, P39250]
* Terminase [P17312]
* Desoxycytidin-Desaminase [P16006]
* Polynucleotid-Kinase [P06855]
* Ribonucleosid-Diphosphat-Reduktase [P32282]
* Desoxynukleotid-Monophosphat-Kinase [P04531]
* Dihydrofolatreduktase [P04382]
* Thymidylat-Synthase [P00471]
* Thymidinkinase [P13300]
* Ribonuklease H [P13319]
* Exo-Desoxyribonuklease [P04536]
* Endolysin [P09176]

## Replikation

Die Replikation der Straboviridae findet im Zytoplasma der Wirtszellen statt. Die einzelnen Schritte sind wie folgt:
* Adsorption: Die Viruspartikel der Phagen heften sich über ihre Schwanzfasern an die Zielzelle an.
* Das Virus-Exolysin (Murein-Hydrolase) baut die Zellwand lokal ab.
* Injektion der Virus-DNA in das Zytoplasma der Wirtszelle durch Kontraktion der Schwanzscheide.
* Transkription und Translation von „frühen“ Genen.
* Replikation des DNA-Genoms. Transkription und Translation von „späten“ Genen.
* Assembly: Aufbau eines leeren Prokapsids und Verpackung des Genoms.
* Zusammenbau der Virusschwanzfasern und des Virusschwanzes.
* Die reifen Virionen werden durch Lyse aus der Zelle freigesetzt.

## Etymologie

Die Bezeichnung der Familie Straboviridae verweist auf den griechischen Philosophen Strabon; der Suffix ‚-viridae‘ steht für Virusfamilien.

## Systematik

Innere Systematik der Familie Straboviridae gemäß International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), Stand Mai/Juni 2024:
Familie Straboviridae (36 Gattungen)
* Unterfamilie Emmerichvirinae
** Gattung Ceceduovirus
*** Spezies Ceceduovirus assw, mit Aeromonas phage AS-sw
*** Spezies Ceceduovirus aszj, mit Aeromonas phage AS-zj
*** Spezies Ceceduovirus cc2, mit Aeromonas phage CC2
** Gattung Ishigurovirus
*** Spezies Ishigurovirus osborne (Aeromonas-Virus 65), mit Aeromonas phage 65
* Unterfamilie Tevenvirinae mit Tequatrovirus (T. T2, T. T4 und T. T6), Details siehe dort
* Unterfamilie Twarogvirinae
** Gattung Acajnonavirus
*** Spezies Acajnonavirus acj9, mit Acinetobacter phage Acj9
** Gattung Hadassahvirus
*** Spezies Hadassahvirus azbtza1, mit Acinetobacter phage AbTZA1
*** Spezies Hadassahvirus pht2, mit Acinetobacter phage vB_AbaM_PhT2
** Gattung Lasallevirus
*** Spezies Acinetobacter virus Acj61, mit Acinetobacter phage Acj61
** Gattung Lazarusvirus
*** Spezies Lazarusvirus am101, mit Acinetobacter phage AM101
*** Spezies Lazarusvirus apostate, mit Acinetobacter phage vB_AbaM_Apostate
*** Spezies Lazarusvirus berthold, mit Acinetobacter phage vB_AbaM_Berthold
*** Spezies Lazarusvirus fhyacithree, mit Acinetobacter phage vB_ApiM_fHyAci03
*** Spezies Lazarusvirus karl, mit Acinetobacter phage KARL-1
*** Spezies Lazarusvirus kimel, mit Acinetobacter phage vB_AbaM_Kimel
*** Spezies Lazarusvirus kronadin, mit Acinetobacter phage vB_AbaM_Konradin
*** Spezies Lazarusvirus lazarus, mit Acinetobacter phage vB_AbaM_Lazarus
** Gattung Zedzedvirus
*** Spezies Zedzedvirus zz1 (Acinetobacter-Virus ZZ), mit Acinetobacter phage ZZ1
* ohne Unterfamilienzuweisung
** Gattung Angelvirus
*** Spezies Angelvirus px29, mit Aeromonas phage PX29
** Gattung Biquartavirus
*** Spezies Biquartavirus 44RR2, mit Aeromonas phage 44RR2.8t
** Gattung Bragavirus
*** Spezies Bragavirus p43, mit Proteus phage phiP4-3
*** Spezies Bragavirus pm2, mit Proteus phage PM2
*** Spezies Bragavirus pm5461, mit Proteus phage vB_PmiM_Pm5461
** Gattung Carettavirus
*** Spezies Carettavirus e142, mit Escherichia phage phiE142
** Gattung Chrysonvirus
*** Spezies Chrysonvirus as5, mit Aeromonas phage phiAS5
** Gattung Cinqassovirus
*** Spezies Cinqassovirus aeh1 (Aeromonas-Virus Aeh1), mit Aeromonas phage Aeh1
*** Spezies Cinqassovirus ah1, mit Aeromonas phage ah1
** Gattung Gualtarvirus
*** Spezies Gualtarvirus mp1, mit Morganella phage vB_MmoM_MP1
** Gattung Jiangsuvirus
*** Spezies Jiangsuvirus pspyzu05, mit Pseudomonas phage PspYZU05
** Gattung Krischvirus (früher Rb49virus; früher zu Tevenvirinae)
*** Spezies Krischvirus ecd7 (Escherichia-Virus ECD7), mit Escherichia phage ECD7
*** Spezies Krischvirus gec3s (Escherichia-Virus GEC3S), mit Enterobacteria phage GEC-3S
*** Spezies Krischvirus georgiaone (Escherichia-Virus phi1), mit Escherichia phage Phi1
*** Spezies Krischvirus jse (Escherichia-Virus JSE), mit Escherichia phage JSE
*** Spezies Krischvirus kfsec, mit Escherichia virus KFS-EC
*** Spezies Krischvirus RB49 (Escherichia-Virus RB49), mit Escherichia phage RB49
** Gattung Mylasvirus (ausgegliedert aus Schizotequatrovirus)
*** Spezies Mylasvirus persius (Vibrio-Virus nt1), mit Vibrio phage nt-1 (Vibrio-Phage nt-1)
** Gattung Nanhuvirus
*** Spezies Nanhuvirus LPCS28, mit Cronobacter phage LPCS28 (Cronobacter-Phage LPCS28)
** Gattung Pseudotevenvirus
*** Spezies Pseudotevenvirus gap161, mit Cronobacter phage vB_CsaM_GAP161
*** Spezies Pseudotevenvirus imecf2, mit Citrobacter phage IME-CF2
*** Spezies Pseudotevenvirus leb, mit Cronobacter phage vB_CsaM_leB
*** Spezies Pseudotevenvirus lee, mit Cronobacter phage vB_CsaM_leE
*** Spezies Pseudotevenvirus lw1, mit Escherichia phage Lw1
*** Spezies Pseudotevenvirus margaery, mit Citrobacter phage Margaery
*** Spezies Pseudotevenvirus miller, mit Citrobacter phage Miller
*** Spezies Pseudotevenvirus RB16 (Escherichia-Virus RB16), mit Escherichia phage RB16
*** Spezies Pseudotevenvirus RB43 (Escherichia-Virus RB43), mit Escherichia phage RB43
** Schemazeichnung von Vibrio-Phage KVP40 (Spezies Schizotequatrovirus KVP40)EinVirion der Gattung Schizo­tequatro­virusVirionen des Stammes Vibriophage ϕpp2 der Spezies Schizo­tequatro­virus KVP40Gattung: Schizotequatrovirus (früher Schizot4virus, Schizot4likevirus; früher zu Tevenvirinae)
*** Spezies Schizotequatrovirus KVP40 (Vibrio-Virus KVP40), mit
    Vibrio phage KVP40 (Vibrio-Phage KVP40) – Referenz („Exemplar“)
    Vibrio-Phage phi-pp2 alias Vibriophage ϕpp2
*** Spezies Schizotequatrovirus valkk3 (Vibrio-Virus ValKK3), mit Vibrio phage ValKK3 (Vibrio-Phage ValKK3)
*** Spezies Schizotequatrovirus vh7d (Vibrio-Virus VH7D), mit Vibrio phage VH7D (Vibrio-Phage VH7D)
** Gattung Slopekvirus (früher Kp15virus, 5 Spezies)
*** Spezies Slopekvirus eap3 (Enterobacter-Virus Eap3), mit Enterobacter phage phiEap-3
*** Spezies Slopekvirus kp15 (Klebsiella-Virus KP15, ehem. Typus), mit Klebsiella phage KP15
*** Spezies Slopekvirus kp27 (Klebsiella-Virus KP27), mit Klebsiella phage KP27
*** Spezies Slopekvirus matisse (Klebsiella-Virus Matisse), mit Klebsiella phage Matisse
*** Spezies Slopekvirus pht4A, mit Escherichia phage phT4A
*** Spezies „Klebsiella virus Miro“ („Klebsiella-Virus Miro“, nicht mehr ICTV-gelistet), mit
    Klebsiella phage Miro
    Klebsiella phage vB_KpnM-VAC66
*** Spezies „Klebsiella virus PMBT1“ („Klebsiella-Virus PMBT1“, nicht mehr ICTV-gelistet), mit
    Klebsiella phage P-KP2 (Klebsiella-Phage P-KP2)
    Klebsiella phage PMBT1 (Klebsiella-Phage PMBT1)
    Klebsiella phage vB_KpnM_M1 (Klebsiella-Phage vB_KpnM_M1) alias Phage vB_Kp M1
** Gattung Tulanevirus (früher Secunda5virus)
*** Spezies Tuaanevirus ime13, mit Stenotrophomonas phage IME13
*** Spezies Tulanevirus 50ahydr13pp, mit Aeromonas phage 50AhydR13PP
*** Spezies Tulanevirus 60ahydrpp, mit Aeromonas phage 60AhydR15PP
*** Spezies Tulanevirus aes12, mit Aeromonas phage Aes012
*** Spezies Tulanevirus aes508, mit Aeromonas phage Aes508
*** Spezies Tulanevirus as4, mit Aeromonas phage phiAS4
*** Spezies Tulanevirus asgz, mit Aeromonas phage AS-gz
*** Spezies Tulanevirus bteighttwo (Aeromonas-Virus 25), mit Aeromonas phage 25 (Aeromonas-Phage 25)

## Wirtsspektrum

Die Wirte der Straboviridae sind Gammaproteobakterien, hauptsächlich aus der Ordnung Enterobacterales, sowie einiger anderer. Dazu gehören:
* Enterobacterales (Citrobacter, Cronobacter, Erwinia, Escherichia, Klebsiella, Pectobacterium, Salmonella, Serratia, Shigella, Yersinia)
* Moraxellales (Acinetobacter)
* Vibrionales (Vibrio)
* Aeromonadales (Aeromonas)