Nexus (Bioinformatik)
# Nexus (Bioinformatik)

Das Nexus-Format ist ein in der systematischen Biologie und Bioinformatik weit verbreitetes Dateiformat, das in mehreren Computerprogrammen zur Stammbaumanalyse Anwendung findet.

## Syntax

Nexus-Dateien sind Textdateien, die ein modulares Format aufweisen: Neben obligatorischen Blöcken können optionale Blöcke Informationen und Befehle für bestimmte Anwendungen enthalten. Jeder Block beginnt mit der Zeile BEGIN BlockName; und endet mit der Zeile END;. Sinnabschnitte innerhalb eines Blocks werden mit ; getrennt. Text zwischen eckigen Klammern wird als Kommentar aufgefasst und damit ignoriert. Die erste Zeile muss #NEXUS lauten.
Ein Beispiel für eine einfache Nexus-Datei mit einem Sequenzalignment ist:

## Quellen

* D. R. Maddison, D. L. Swofford, W. P. Maddison: NEXUS: An extensible file format for systematic information. In: Systematic Biology. Band 46, Nr. 4, 1997, S. 590–621, doi:10.1093/sysbio/46.4.590.
* Detaillierter Artikel über das NEXUS-Format mit einer Liste von Schlüsselwörtern (englisch)