La sous-direction des affaires opérationnelles et industrielles :
   - définit la politique d'acquisition, de stockage et d'utilisation des rechanges du service et organise sa mise en oeuvre ;
   - définit les structures et les méthodes appropriées pour la conduite et la gestion de l'activité du service ; elle en conduit la mise en application ;
   - définit la politique de sous-traitance et en contrôle l'application ;
   - établit les prévisions d'activités et de ressources et en propose la répartition entre les établissements ;
   - prépare le plan d'investissements pluriannuel du service et les dossiers d'investissements correspondants et veille à leur réalisation ;
   - anime la démarche de qualité interne de la direction ;
   - assure la mise en oeuvre du contrôle de gestion et du système d'information de la direction ;
   - traite des actions relevant de la sécurité de défense et de la sécurité générale.