Un comité d'orientation scientifique, placé auprès du département des analyses, donne des avis à caractère scientifique sur les questions intéressant ce département.
   Il comprend :
   - neuf membres, dont le président, désignés par le président de l'agence après avis du collège, choisis en raison de leurs compétences scientifiques, médicales ou pharmaceutiques ;
   - un représentant de l'organisme international chargé de la lutte contre le dopage reconnu par le Comité international olympique, mentionné au I de l'article L. 232-5 du code du sport ;
   - un membre désigné par le ministre chargé des sports ;
   - un membre désigné par le ministre chargé de la santé ;
   - un membre désigné par le ministre chargé de la recherche.
   Le mandat des membres est de trois ans renouvelable. Ils exercent leur fonction à titre gratuit.
   Le président de l'agence, le secrétaire général et le directeur du département des analyses participent de droit aux travaux du comité.
   Le président du comité peut convier aux réunions toute personne qu'il juge utile. Le président de l'agence peut autoriser tout agent de l'agence, en raison de ses missions, à participer aux travaux du comité.
   Le comité d'orientation scientifique est réuni au moins deux fois par an.