Le président du Conseil national de la chirurgie institué par l'arrêté du 15 octobre 2004 susvisé, son vice-président conseiller d'Etat, ses trois vice-présidents et son secrétaire général sont nommés par arrêté du ministre chargé de la santé et du ministre chargé de l'enseignement supérieur. 
Un rapporteur du Conseil national de la chirurgie auprès du           directeur général de l'offre de soins  du ministère chargé de la santé est nommé par le même arrêté. 
Le Conseil national de la chirurgie peut désigner en son sein un secrétaire général adjoint.