Le délégué à l'aménagement du territoire et à l'action régionale, le secrétaire général du Gouvernement et le Commissaire général à la stratégie et à la prospective participent aux réunions du comité. Le délégué en prépare l'ordre du jour, en liaison avec les ministères concernés, et met en oeuvre ses décisions. 
Le secrétaire général du Gouvernement assure le secrétariat du comité.