Si les conditions d'équipement et de fonctionnement sont jugées conformes aux conditions fixées en annexe V, l'agrément est accordé par le préfet, sur proposition du   directeur chargé de la protection des populations. 
Il donne lieu à la délivrance d'un numéro d'agrément. 
L'agrément est accordé pour une durée de quatre ans renouvelable sur demande expresse. 
Lorsqu'il est constaté qu'une ou plusieurs obligations auxquelles l'agrément est lié ne sont plus respectées, et après mise en demeure, la suspension ou le retrait de l'agrément sont prononcés. 
Le centre bénéficiaire est soumis à des contrôles vétérinaires réguliers par un vétérinaire officiel.