La direction centrale du service de soutien de la flotte comprend les sous-directions suivantes : 
1. La sous-direction des plans et méthodes ; 
2. La sous-direction technique ; 
3. La sous-direction logistique ; 
4. La sous-direction de l'administration générale. 
Leurs attributions sont détaillées au titre Ier. 
Un bureau de contrôle de gestion     et un bureau des ressources humaines, dont les attributions sont détaillées au titre II, sont directement rattachés au directeur central. 
Celui-ci dispose, en outre, de chargés de missions.