Le conseil d'administration comprend dix-neuf membres : 
1° Le président de l'établissement ; 
2° Quatre représentants de l'Etat : 
a) Le directeur des musées de France ou son représentant ; 
b) Le directeur de l'architecture et du patrimoine ou son représentant ; 
c)      le secrétaire général du ministère chargé de la culture ou son représentant ; 
d) Le directeur du budget au ministère chargé du budget ou son représentant ; 
3° L'administrateur général de la Réunion des musées nationaux ou son représentant ; 
4° Sept personnalités choisies en raison de leur compétence ou de leurs fonctions, dont deux en raison de leur connaissance des publics des musées nationaux, désignées par arrêté du ministre chargé de la culture ; 
5° Trois membres des corps des conservateurs généraux ou des conservateurs du patrimoine élus pour trois ans dans des conditions fixées par arrêté du ministre chargé de la culture ; 
6° Trois représentants du personnel élus pour trois ans dans des conditions fixées par arrêté du ministre chargé de la culture.