Les missions dévolues à la sous-direction des établissements et services déconcentrés sont définies comme suit :
   Elle coordonne les actions des services ;
   Elle assure la cohérence de l'affectation annuelle des moyens avec les missions confiées aux services et établissements et gère leurs crédits de fonctionnement et d'investissement ;
   Elle a en charge la gestion des personnels affectés dans les services déconcentrés ainsi que leur formation et procède au recrutement des personnels d'inspection, techniques et pédagogiques.