Il est institué auprès du secrétaire général, de chaque directeur général, de certains directeurs et chefs de service d'administration centrale un comité technique paritaire spécial.
Les comités techniques paritaires spéciaux sont mis en place pour :
- le secrétariat général ;
- la direction générale de l'alimentation ;
- la direction générale de l'enseignement et de la recherche ;
- la direction générale des politiques agricole, agroalimentaire et des territoires ; 
- la direction des pêches maritimes et de l'aquaculture ;
- les services directement rattachés au ministre (cabinet, bureau du cabinet, Conseil général de l'agriculture, de l'alimentation et des espaces ruraux, mission défense, contrôle financier) ;
- les services centraux de Toulouse-Auzeville.
La composition de ces comités techniques paritaires spéciaux est fixée selon les règles établies à l'article 18.