Ces commissions ont compétence dans les domaines d'activité suivants :
 Commission interdisciplinaire A : santé et société ;
 Commission interdisciplinaire B : modélisation des systèmes biologiques, bioinformatique ;
 Commission interdisciplinaire C : cognition, langage, traitement de l'information : systèmes naturels et artificiels ;
 Commission interdisciplinaire D : risques environnementaux et société ;
 Commission interdisciplinaire E : impacts sociaux du développement des nanotechnologies ;
 Commission interdisciplinaire F : astroparticules.