Le comité directeur de la réserve comprend, sous la présidence du préfet de la Savoie, préfet coordinateur, ou de son représentant :
   - le préfet de la Haute-Savoie ou son représentant ;
   - le sous-directeur de la chasse, de la faune et de la flore sauvages au ministère de l'environnement ou son représentant ;
   - le directeur général de l'Office national des forêts ou son représentant ;
   - le directeur de l'Office national de la chasse ou son représentant ;
   - le président de la région cynégétique Alpes-Jura ;
   - le directeur départemental de l'agriculture et de la forêt de la Savoie ;
   - le directeur départemental de l'agriculture et de la forêt de la Haute-Savoie ;
   - le président de la fédération départementale des chasseurs de la Savoie ;
   - le président de la fédération départementale des chasseurs de la Haute-Savoie ;
   - le maire d'Ecole-en-Bauges (Savoie) ;
   - le maire de Chevaline (Haute-Savoie).
   Le comité directeur s'adjoindra à titre consultatif :
   - un représentant du conseil général de la Savoie ;
   - un représentant du conseil général de la Haute-Savoie ;
   - le directeur du Parc national de la Vanoise ;
   - le président du groupement d'intérêt cynégétique des Bauges ;
   - le professeur Philippe Lebreton, université Claude-Bernard, Lyon-I ;
   - le président de l'association pour la création du parc naturel régional des Bauges.