Le centre, dont la mission principale est l'expertise du personnel navigant militaire, doit prendre vis-à-vis du personnel navigant de l'aviation civile des dispositions de nature à permettre un fonctionnement distinct, notamment pour ce qui concerne :
   a) Le respect des normes d'aptitude des visites médicales ;
   b) La mise à jour des dossiers médicaux et leur confidentialité.