La sous-direction de la formation, des compétences et des qualifications : 
- sur la base des besoins en formation formulés par les services chargés de mettre en œuvre les politiques portées par le ministère, et sur la base des orientations définies à l'article 2.6.3, élabore le plan national de formation et le document d'orientation à moyen terme de la formation professionnelle, et les met en œuvre ; 
- met en œuvre la politique de formation professionnelle des personnels du ministère et conduit les actions de reconversion ; 
- anime la politique de développement des compétences et des qualifications ; 
- assure l'évaluation de l'activité de formation des maîtrises d'ouvrage métier et veille à leur professionnalisation ; 
- assure l'animation des instances nationales de concertation en matière de formation. 
Elle comprend : 
- le bureau du budget, de la réglementation et des statistiques de la formation ; 
- le bureau du pilotage du plan national de formation ; 
- le bureau de l'animation des services de la formation ; 
Le centre ministériel de valorisation des ressources humaines, service à compétence national, lui est rattaché.