La sous-direction des gens de mer exerce les attributions suivantes :
― suivi de la santé au travail des marins ;

― animation de la prévention des risques professionnels maritimes ;

― détermination de l'aptitude médicale à la navigation des gens de mer ;

― contribution à l'organisation de la téléconsultation médicale maritime ;

― pilotage et animation des médecins et infirmiers des gens de mer affectés en service déconcentrés ;

― encadrement des personnels militaires médecins et infirmiers du service de santé des armées mis à disposition ;
― élaboration et mise en œuvre de la politique en matière d'éducation et de formation professionnelle maritime et de délivrance des titres professionnels maritimes ;
― tutelle des lycées professionnels maritimes et de l'école nationale supérieure maritime ;
― élaboration et mise en œuvre des normes juridiques relatives aux titres de navigation maritime, à l'emploi et au travail maritimes, à la certification sociale, à la profession de marin, à la santé et la sécurité au travail des gens de mer, à l'aptitude médicale à la navigation et à la prévention des risques professionnels maritimes et aux conditions sociales de l'Etat d'accueil ;
― participation aux travaux des instances européennes et internationales compétentes dans ses domaines d'attribution ;
― préparation des textes législatifs et réglementaires relatifs à la protection sociale des marins ;
― tutelle de l'Etablissement national des invalides de la marine.