La sous-direction de la modernisation élabore la stratégie de modernisation, d'évolution et d'organisation de l'ensemble des services du ministère, et coordonne sa mise en œuvre. Elle veille à ce titre à la cohérence de l'ensemble des réformes concernant l'organisation des services centraux et territoriaux du ministère ainsi que de ses établissements publics.Dans le cadre de la transformation numérique, elle coordonne et accompagne le déploiement de la culture et des usages du numérique en veillant à la coordination et à la cohérence avec la politique des données. Elle promeut les démarches qualité au sein des services du ministère.
Elle comprend :
― le bureau de modernisation et de la simplification ;
― le bureau de l'évolution structurelle des services ;
― le bureau de la transformation numérique.