Conformément aux dispositions de l'article 14 du décret du 12 septembre 2008 susvisé, le service de santé des armées est dirigé par un directeur central, médecin général des armées.
 Sont directement placés sous l'autorité du directeur central :
 a) L'inspection du service de santé des armées ;
 b) Le cabinet ;
 c) Le bureau chancellerie et officiers généraux ;
 d) Le bureau de la communication et de l'information.