Le président du conseil d'administration est assisté par un directeur général, nommé par décret en conseil des ministres, pour trois ans, sur proposition du ministre chargé de la recherche et du ministre chargé de la coopération et du développement, après avis du président. Les fonctions du directeur général sont renouvelables.
   Le directeur général assure la direction scientifique, administrative et financière du centre et notamment :
   a) Il élabore les projets de programmes généraux de recherche et de développement avec le concours du conseil scientifique ;
   b) Il prépare les délibérations du conseil d'administration et en assure l'exécution ;
   c) Il est l'ordonnateur principal des recettes et des dépenses; il peut nommer des ordonnateurs secondaires après accord du conseil d'administration ;
   d) Il recrute, gère et licencie le personnel ;
   e) Il passe tous actes, contrats ou marchés, et notamment les contrats avec des partenaires étrangers. Il procède à toutes acquisitions, tous dépôts ou cessions de brevets ou licences.