La décision précise : 
En cas de refus, la motivation de celui-ci ; 
En cas d'octroi d'une dérogation et, en tant que de besoin, en fonction de la nature de l'opération projetée, les conditions de celle-ci, notamment :
-indications relatives à l'identité du bénéficiaire ;
-nom scientifique et nom commun des espèces concernées ;
-nombre et sexe des spécimens sur lesquels porte la dérogation ;
-période ou dates d'intervention ;
-lieux d'intervention ;
-s'il y a lieu, mesures d'atténuation ou de compensation mises en oeuvre, ayant des conséquences bénéfiques pour les espèces concernées ;
-qualification des personnes amenées à intervenir ;
-description du protocole des interventions ;
-modalités de compte rendu des interventions ;
-durée de validité de la dérogation ;
-conditions particulières qui peuvent être imposées en application de l'article R. 411-11 du code de l'environnement. Pour les opérations d'inventaire de populations d'espèces animales ou végétales, l'octroi de la dérogation peut être conditionné au versement des données recueillies à des bases de données et selon un format déterminé.