La Fédération nationale des courses hippiques est administrée par un conseil d'administration composé : 
De trois membres du comité de la société mère des courses au trot, dont son président ; 
De trois membres du comité de la société mère des courses au galop, dont son président ; 
Des quatre représentants des sociétés de courses régionales membres des comités des sociétés mères ; 
De deux représentants des autres sociétés de courses, soit un au titre de chacune des deux spécialités, désignés par et parmi les présidents et vice-présidents des fédérations régionales des courses. 
Participent en outre au conseil d'administration avec voix consultative : 
Le directeur compétent au ministère chargé de l'agriculture ou son représentant ;
Le membre du corps du contrôle général économique et financier, désigné en application de l'article 35 ci-après. 
La présidence du conseil d'administration est assurée, à tour de rôle pour un an, par le président de la société mère des courses au trot ou le président de la société mère des courses au galop. Le président a voix prépondérante en cas de partage.