Le Commissariat général au développement durable comprend, outre un cabinet :
 ― la direction de la recherche et de l'innovation ;
 ― le service de l'observation et des statistiques ;
 ― le service de l'économie, de l'évaluation et de l'intégration du développement durable ;
 ― la délégation au développement durable ;
 ― la sous-direction des affaires générales.
 Le commissaire général assure le secrétariat du comité stratégique présidé par le ministre d'Etat, composé du vice-président du Conseil général de l'environnement et du développement durable, du secrétaire général et des directeurs généraux.