L'institut est administré par un conseil d'administration, présidé par une personnalité scientifique nommé pour une période de trois ans renouvelable, par décret pris sur proposition du ministre chargé de la recherche et du ministre chargé de l'industrie. 
Outre son président, le conseil d'administration comprend : 
1-Deux membres de droit : 
Le directeur général du Centre national de la recherche scientifique ; 
Le président de l'agence de l'informatique. 
2-Sept représentants de l'Etat désignés respectivement par les ministres chargés de la recherche, de l'industrie, du budget, de l'éducation nationale, de la défense, des relations extérieures et des postes et télécommunications. 
3-Huit personnalités : 
Deux personnalités de l'industrie de l'informatique et de l'automatique désignées par le ministre chargé de l'industrie ; 
Deux personnalités scientifiques désignées par le ministre chargé de la recherche ; 
Deux personnalités représentatives du monde du travail dont l'une désignée par le ministre chargé de la recherche et l'autre par le ministre chargé de l'industrie ; 
Deux personnalités choisies parmi les utilisateurs de l'informatique et de l'automatique désignées par le ministre chargé de l'industrie. 
4-Quatre représentants du personnel de l'institut dont deux chercheurs, élus pour trois ans, selon des modalités fixées par arrêté du ministre chargé de la recherche et du ministre chargé de l'industrie. 
Les membres du conseil d'administration désignés conformément aux 2 et 3 ci-dessus sont nommés pour trois ans par arrêté conjoint du ministre chargé de la recherche et du ministre chargé de l'industrie. 
Le président du conseil scientifique, le contrôleur financier et l'agent comptable assistent aux séances du conseil d'administration avec voix consultative. 
Le président du conseil d'administration peut également appeler à participer aux séances, avec voix consultative, toute personne, dont il juge la présence utile. 
Le mandat des membres du conseil d'administration est renouvelable. 
Les membres démissionnaires ou décédés ou qui n'exercent plus les fonctions au titre desquelles ils avaient été désignés ou élus doivent être remplacés. Dans ce cas, le mandat des nouveaux membres expire à la date à laquelle aurait normalement pris fin celui des membres qu'ils remplacent. 
Les fonctions de membre du conseil d'administration sont gratuites. Elles ouvrent droit aux indemnités de déplacement et de séjour prévues par le décret du 10 août 1966 susvisé.