La gestion administrative de l'école est confiée, sous l'autorité du directeur général de l'institut français du pétrole, à un directeur assisté d'un conseil de perfectionnement.
Ce directeur est nommé, par arrêté du ministre de l'industrie et du commerce, pour une durée de six ans, sur proposition du directeur général de l'institut français du pétrole, après consultation du conseil de perfectionnement.
Le conseil de perfectionnement est constitué par le directeur des carburants, président, le directeur général de l'institut français du pétrole, les membres du conseil scientifique de l'institut français du pétrole et les présidents des comités consultatifs industriels de ce même établissement. Il nomme dans son sein un vice-président.
Le conseil de perfectionnement émet sur toutes les questions concernant l'organisation générale et le perfectionnement des programmes d'enseignement et des méthodes pédagogiques de l'école des avis qui sont exprimés au directeur général de l'institut français du pétrole.