Le directeur dirige l'agence. A ce titre :
   1° Il prépare les délibérations du conseil d'administration et en assure l'exécution ;
   2° Il a autorité sur l'ensemble des personnels de l'agence et en assure la gestion. Il recrute les personnels contractuels et nomme à toutes les fonctions ;
   3° Il est ordonnateur des recettes et des dépenses de l'agence ;
   4° Il conclut les conventions et marchés se rapportant aux missions de l'agence ;
   5° Il représente l'agence en justice et dans les actes de la vie civile ;
   6° Il établit chaque année le rapport d'activité scientifique, administratif et financier et prépare le contrat d'établissement mentionné à l'article 3 ;
   7° Il rend compte de sa gestion au conseil d'administration.
   Il peut déléguer sa signature aux chefs de service de l'agence. Ceux-ci, dans la limite des délégations qui leur sont consenties, peuvent subdéléguer leur signature dans les conditions fixées par décision du directeur.