Le centre historique des archives est organisé en départements :
― département de la collecte et des recherches administratives ;
― département du réseau territorial ;
― département des fonds d'archives ;
― département des services au public.
Au sein du centre historique des archives, constituent des organismes extérieurs : 
 1° Le département du réseau territorial ; 
 2° La division des archives intermédiaires de la gendarmerie nationale du département de la collecte et des recherches administratives.