La sous-direction du pilotage, de la performance et de la synthèse : 
 - élabore, en s'appuyant notamment sur les orientations stratégiques mentionnées à l'article 2.6.3, le plan national de gestion prévisionnelle des effectifs, des emplois et des compétences et en coordonne la mise en œuvre ; 
 - élabore et diffuse les méthodes et référentiels nécessaires à la gestion prévisionnelle des effectifs, des emplois et des compétences ; 
 - élabore le budget de personnel du ministère, en effectifs et en crédits, et en assure la mise en œuvre ; 
 - porte le volet ressources humaines dans le cadre du dialogue de gestion ministériel ; 
 - pilote et gère les effectifs et les crédits de masse salariale pour le ministère ; 
 - conduit et valorise les études en matière d'effectifs et de dépenses de personnel ; 
 - coordonne la mise en place des engagements contractuels avec les responsables de zone de gouvernance ; 
 - élabore et met en œuvre le volet ressources humaines du contrôle de gestion ministériel ; 
 - anime la fonction ressources humaines en région ; 
 - pilote le processus paye pour le ministère, à l'exclusion de la direction générale de l'aviation civile ; 
 - assure le suivi des données et questions relatives aux ressources humaines dans les établissements publics du ministère. 
 Elle comprend : 
 - le bureau des effectifs ; 
 - le bureau du budget de personnel ; 
 - le bureau de la prévision, de l'animation et de la performance.