La commission centrale des chemins de fer, compétente pour l'ensemble du territoire métropolitain, dispose de commissions subordonnées, mises en place au moment du besoin, à l'initiative du chef d'état-major de l'armée de terre, en accord avec le directeur des transports par fer ;
Au niveau de chaque zone de défense : une commission de zone des chemins de fer ;
Au siège de chaque région de la société nationale des chemins de fer français : une commission régionale des chemins de fer ;
Dans les principales gares ou complexes ferroviaires importants une commission de gare.
En outre, des commissions particulières peuvent être constituées partout où la nécessité en serait reconnue.
La commission de zone des chemins de fer, subordonnée à la commission centrale, coordonne l'activité des commissions régionales des chemins de fer ayant leur siège sur le territoire de la zone de défense.
La commission régionale des chemins de fer a autorité sur les commissions de gare situées dans sa zone d'action.