Les marchés et accords-cadres de Voies navigables de France sont passés conformément aux dispositions du code des marchés publics. 
 Un règlement adopté par le conseil d'administration sur proposition du directeur général fixe notamment : 
 - la composition et les modalités de fonctionnement de la commission d'appel d'offres de Voies navigables de France ; 
 - les modalités de constitution et de fonctionnement d'une commission consultative des marchés exerçant, pour Voies navigables de France, les missions de la commission des marchés publics de l'Etat ; 
 - les règles de publicité et de mise en concurrence des marchés passés selon la procédure adaptée. 
 Le règlement est soumis à l'approbation du ministre chargé des transports et du ministre chargé du budget.L'approbation est réputée acquise, à défaut d'opposition de leur part, dans un délai de deux mois à compter de la date de leur saisine.