Thế đối đầu Nam-Bắc Triều chấm dứt đã giúp người dân trong thiên hạ đỡ khốn khổ phần nào và giúp mảnh đất Đại Việt được 1 khoảng thời gian yên bình.
Thế đối đầu Nam-Bắc triều chấm dứt khi Trịnh Tùng tiến chiếm được thành Thăng Long, và bắt giết được Mạc Mậu Hợp vào cuối năm 1592, họ Mạc chạy lên Cao Bằng.