Nguyễn Phúc Nguyên là con trai của vị vua đầu tiên của triều đại Nguyễn tại Việt Nam, là Nguyễn Phúc Tần (1613 - 1648).
Năm 1613, Nguyễn Hoàng qua đời. Con là Nguyễn Phúc Nguyên lên thay. Nguyễn Phúc Nguyên tiếp tục ý chí của cha, tăng cường sức mạnh kinh tế, quân sự, mở rộng lãnh thổ về phía Nam và khuyến khích di dân lập ấp.