Given the abstract 对‘华仲12号’杜仲的幼嫩叶片(绿色)和成熟叶片(红色)及‘华仲11号’杜仲成熟叶片(绿色)进行转录组测序,进行测序数据的拼接和组装,且对转录组获得的基因(Unigenes)进行SSR分析.研究得到54517条平均长度为806.90bp的Unigenes,其中25993条Unigenes在Nr、Swiss-Prot、KEGG和COG蛋白数据库获得功能注释,占所有Unigenes的47.68％.参照KEGG数据库,可将注释到的6910条Unigenes划分到122个代谢途径分支,其中花色苷代谢途径相关酶基因39个,类黄酮代谢途径38个,类胡萝卜素合成途径34个.54517条Uni-genes中共包含17010个完整型SSR位点,占总SSR位点的96.28％.完整型SSR位点共包含67种重复基元,其,中出现频率最高的重复基元类型为单核苷酸重复中的A/T(7747个),其次是AG/CT(5039个)和AT/AT(850个)从花色苷代谢途径、类黄酮代谢途径及类胡萝卜素代谢途径中共找到13个SSR位点.为今后杜仲遗传多样性分析、遗传图谱构建及杜仲红叶性状分子标记开发等方面奠定了分子基础., list out 4 keywords for it.
微卫星, 杜仲, 红叶, 转录组