Boehner a été chef de la minorité de la Chambre de 2007 à 2011, et chef de la majorité de la Chambre de 2006 à 2007.
Boehner a été président de plusieurs commissions importantes avant de devenir Leader de la minorité en 2006. Bien que dirigeant minoritaire, Boehner était l'un des principaux critiques du président Obama.