Avec le Lawrence Berkeley National Laboratory -LRB- anciennement le Radiation Lab -RRB-, Berkeley est maintenant partenaire dans la gestion de deux autres laboratoires, le Los Alamos National Laboratory -LRB- 1943 -RRB- et le Lawrence Livermore National Laboratory -LRB- 1952 -RRB-.
Les physiciens de Berkeley ont travaillé sur le projet Manhattan pendant la Seconde Guerre mondiale et l'université gère maintenant les deux principaux laboratoires d'armes nucléaires du pays : le Lawrence Berkeley National Laboratory et le Los Alamos National Laboratory.