L'Académie des sciences de l'URSS a créé le Prix Vavilov - LRB- 1965 -RRB- et la Médaille Vavilov - LRB- 1968 -RRB-.
Aujourd'hui, le nom de Vavilov est élevé : l'Institut Vavilov de l'industrie végétale de Saint-Pétersbourg porte son nom.