Les Oignons jouent un rôle vital dans la reproduction de Pikmin : Lorsqu'un aliment, comme des proies ou des boulettes, est livré à un Onion, il se propage aux graines, qui poussent et sont ensuite arrachées du sol en tant que Pikmin entièrement développées. Un oignon sert aussi d'incubateur pour tous les Pikmin de sa couleur, abritant potentiellement des centaines de Pikmin.
Olimar obtient Pikmin en amenant des granulés, un type de nourriture, et des méchants à un Onion, qui est le bateau de Pikmin.