Selon le U.S. Census Bureau, le comté a une superficie totale de 804 s, dont 768 s sont des terres et 37 s -LRB- 4,54 % -RRB - est de l'eau.
Le comté de Juneau a une superficie de 804 milles carrés, dont 37 est de l'eau, selon le Bureau du recensement des États-Unis.