Le service et la croissance à l'aéroport international de Los Angeles, à l'aéroport international Bob Hope Burbank et à l'aéroport international de Long Beach demeurent au centre des préoccupations de la compagnie aérienne.
En 2001, JetBlue a lancé une opération de ville-cible à Long Beach, dans le comté de Los Angeles, en Californie, et une autre à l'aéroport international Logan, à Boston, en 2004, ainsi qu'à Fort Lauderdale, à l'aéroport international d'Oakland et à Washington-Dulles, ainsi qu'à l'aéroport international d'Orlando.