Lorsque l'identité sexuelle d'une personne fait d'elles un sexe, mais que leurs organes génitaux suggèrent un sexe différent, elles connaîtront probablement ce que l'on appelle la dysphorie du genre. Certaines personnes ne croient pas que leur identité sexuelle correspond à leur sexe biologique, y compris les transsexuels, les transsexuels et de nombreuses personnes intersexuelles.
Certaines personnes peuvent avoir une identité sexuelle différente de leur sexe.