Avant le développement de la vallée de San Joaquin, qui a commencé dans les années 1850 par les colons américains, la rivière San Joaquin et ses affluents avaient tendance à inonder la vallée pendant les mois d'hiver.
Avant que les humains ne commencent à développer la vallée centrale dans les années 1850, la rivière San Joaquin et les terres avoisinantes constituaient l'un des habitats biologiques les plus riches de la Californie.