Le contrôle de l'ASC sur le territoire revendiqué s'est progressivement réduit au cours de la guerre, l'Union ayant pris le contrôle d'une grande partie du littoral et des voies navigables intérieures.
Il a été créé en 1861 par sept États du sud où l'esclavage était légal, après qu'Abraham Lincoln eut été élu président, mais avant son entrée en fonction.