La ville se trouve à une altitude moyenne de 1 161 m au-dessus du niveau de la mer et jouit d'un climat stable tout au long de l'année, avec une température moyenne de 25 ° C -LRB- 77oF -RRB- et des précipitations annuelles de 1800 mm, dont plus de 90 % tombent pendant la saison des pluies, de mai à novembre.
San José se trouve à une altitude moyenne de 1,161 m au-dessus du niveau de la mer.