Le nom Aphex est dérivé d'Aphex Systems Limited, une marque de matériel de traitement de signaux audio -LRB- elle-même dérivée des "effets analogiques" -RRB-.
Son nom est une combinaison d'Aphex Systems Limited, une marque de matériel de traitement de signaux audio et le mot Twin pour se souvenir de son frère jumeau.