Le Houston Air Route Traffic Control Center se trouve sur le terrain de l'aéroport intercontinental George Bush. Le deuxième aéroport commercial en importance est l'aéroport William P. Hobby - qui porte le nom de Houston International Airport jusqu'en 1967 - RRB-, qui exploite principalement des vols intérieurs de petite à moyenne distance.
L'aéroport intercontinental George Bush est le principal aéroport de Houston.