Bien qu'ils soient classifiés comme eucaryotes, les noyaux dinoflagellés ne sont pas typiquement eucaryotes, car ils manquent d'histones, de nucléosomes et maintiennent des chromosomes continuellement condensés durant la mitose.
Bien qu'ils soient classifiés comme eucaryotes, les noyaux dinoflagellés ne possèdent pas certaines caractéristiques clés des noyaux eucaryotes.