Comme les autres villes, elle maintient son propre gouvernement municipal, mais ses résidents votent à l'élection de la mairie de Jacksonville et sont représentés au conseil municipal de Jacksonville.
Lorsque la majorité des collectivités du comté de Duval se sont jointes à Jacksonville, en Floride, en 1968, Atlantic Beach, ainsi que Jacksonville Beach, Neptune Beach, Ponte Vedra Beach et Baldwin, en Floride, sont demeurées quasi indépendantes.