Baresi a regretté que sa première carrière internationale ait coïncidé avec le pic de la carrière de Gaetano Scirea comme premier balayeur de choix de l'Italie, et Baresi a été continuellement laissé pour compte dans le froid, à sa grande frustration, et il a refusé de jouer pour le côté national alors que Bearzot était en charge -LRB- expliquant ainsi le manque relatif de casquettes de Baresi avant le tournoi de 1990 -RRB-.
Il a fait partie de l'équipe nationale italienne.