Néanmoins, il a appuyé l'effort de guerre après Pearl Harbor et a effectué de nombreuses missions de combat dans le théâtre du Pacifique de la Deuxième Guerre mondiale en tant que consultant civil, même si le président Franklin D. Roosevelt avait refusé de réintégrer la commission du colonel du Corps d'aviation de l'Armée de terre qu'il avait démissionné au début de 1939.
En avril 1923, alors qu'il rendait visite à des amis à Lake Village, en Arkansas, Lindbergh a effectué son premier vol au-dessus du lac Village et du lac Chicot.