La nef principale est courte et étroite - LRB- comme c'est le cas avec d'autres églises de mission -RRB-, mais à San Luis Obispo il y a une nef secondaire de taille presque égale situé à la droite de l'autel, ce qui en fait la seule église de mission "L" "parmi toutes les missions californiennes.
C'est la seule église de mission en "L" dans toutes les missions californiennes.