Thomas Weelkes fut alors réintégré à la cathédrale de Chichester, mais il semblait passer beaucoup de temps à Londres, mort à Londres en 1623, dans la maison d'un ami, presque certainement le 30 novembre et enterré le 1er décembre 1623 à la rue Fleet de St Bride.
Thomas Weelkes meurt à Londres en 1623, un an après la mort de sa femme.