Les données moléculaires utilisées pour de tels calculs sont habituellement des séquences de nucléotides pour des séquences d'ADN ou d'acides aminés pour les protéines.
Les données moléculaires utilisées pour de tels calculs sont souvent des séquences de nucléotides dans l'analyse génomique ou des séquences d'acides aminés pour des protéines telles que l'hémoglobine.