Le nom Hydra a été annoncé le 21 juin 2006 dans la circulaire 8723 de l'UAI, la circulaire no 8723 de l'UAI désignant les lunes ainsi que la désignation officielle Pluto III.
Le nom Hydra a été annoncé le 21 juin 2006 dans la circulaire 8723IAU de l'UAI, circulaire no 8723, nommant les lunes, ainsi que la désignation officielle Pluto III.