Un casse-tête Sudoku en trois dimensions a été inventé par Dion Church et publié dans le Daily Telegraph en mai 2005. Il existe une version Sudoku du Cube de Rubik, Sudoku Cube.
Jigsaw Sudoku -LRB- aussi appelé Squiggly Sudoku ou Odd Sudoku -RRB- est juste comme un puzzle Sudoku régulier, sauf qu'au lieu que les lignes soient parfaites, elles sont différentes.