L'Organisation XIII contrôle les Nobodies, les corps laissés par lorsqu'une personne avec un cœur fort est transformée en un sans coeur.
Au fur et à mesure qu'ils le recherchent, ils rencontrent les autres membres de l'Organisation XIII et apprennent qu'il s'agit d'êtres appelés Nobodies, et lorsqu'un sans-abri vole le cœur de quelqu'un, cette personne devient aussi sans cœur, mais si son cœur est fort, son corps devient un Nobody.