Il a fait l'objet d'une enquête par un grand jury fédéral concernant son témoignage dans l'affaire BALCO et a été inculpé de parjure et d'entrave au bon fonctionnement de la justice le 15 novembre 2007.
Le 15 novembre 2007, Bonds a été accusé de parjure -LRB- lying -RRB- et d'entrave à la justice dans une enquête de grand jury relative aux stéroïdes.