С момента своего создания операционные расходы TWAS в значительной степени покрывались за счет щедрых взносов итальянского правительства; с 1991 г. ЮНЕСКО отвечает за управление финансами и персоналом TWAS на основании соглашения, подписанного генеральным директором ЮНЕСКО и президентом TWAS.
Генеральный директор ЮНЕСКО и президент TWAS подписали соглашение. ЮНЕСКО управляет финансами и персоналом TWAS с 1991 года.