Генетический анализ с 1990-х годов выявил афротерию как одну из четырех основных групп внутри инфракласса Eutheria (содержащего плацентарных млекопитающих).
В ходе экспериментов 1990-х годов афротерия была названа одной из четырех основных групп в группе Eutheria (содержащей плацентарных млекопитающих).