Он умер без наследства в 1638 году, и территории Саксен-Гота и Саксен-Эйзенах были разделены между Саксен-Веймаром и Саксен-Альтенбургом (который сам был отделен от Саксен-Веймара в 1603 году).
В 1633 году линия Веттинов вымерла, и Иоганн Эрнст унаследовал ее, но он умер без наследства в 1638 году, и территории Саксен-Гота и Саксен-Эйзенах были разделены между Саксен-Веймаром и Саксен-Альтенбургом.