С обретением Намибией независимости от администрации Южной Африки в 1990 году Виндхук был признан столицей Юго-Западной Африки, находящейся в ведении правительства Южной Африки.
Во время Первой мировой войны Виндхук был захвачен Южной Африкой. Он был столицей Юго-Западной Африки (Намибия) под контролем Южной Африки до обретения Намибией независимости в 1990 году.