До развития долины Сан-Хоакин, которое началось в 1850-х годах американскими поселенцами, река Сан-Хоакин и ее притоки имели тенденцию затоплять долину в зимние месяцы.
До того, как люди начали осваивать Центральную долину в 1850-х годах, река Сан-Хоакин и прилегающие к ней земли были одной из самых богатых биологических сред обитания в Калифорнии. Зимой река затапливала долину, оставляя после себя заболоченные места.