Эндопаразиты могут существовать в одной из двух форм: межклеточной (населяя пространства в теле хозяина) или внутриклеточной (населяя клетки в теле хозяина).
Внутриклеточные паразиты живут внутри клеток; Межклеточные паразиты живут в промежутках между клетками.