Окаменелости цианобактериальных матов (строматолитов, которые сыграли важную роль в создании свободного кислорода в атмосфере) обнаруживаются по всему архею и становятся особенно распространенными в конце эона, в то время как некоторые вероятные окаменелости бактерий известны из кремнистых пластов.
Ископаемые бактериальные маты, называемые строматолитами, обнаруживаются на всей территории архея примерно через 3500 млн лет назад.