Поскольку эти симптомы не специфичны для свиного гриппа, дифференциальный диагноз вероятного свиного гриппа требует не только симптомов, но и высокой вероятности свиного гриппа из-за недавнего анамнеза человека.
Нынешний штамм свиного гриппа может адаптироваться к людям и распространяться более эффективно, чем известные ранее штаммы свиного гриппа H1N1. Более того, совместная инфекция свиного гриппа H1N1 и сезонного гриппа H1N1, устойчивого к осельтамивиру, может привести к приобретению мутации H274Y свиным гриппом посредством рекомбинации или реассортации.