Сами транспозоны относятся к одному из двух классов в соответствии с их механизмом транспозиции, который можно описать как «копировать и вставить» (класс I) или «вырезать и вставить» (класс II).
Сами транспозоны бывают двух типов в зависимости от их механизма, которые могут быть либо «копировать и вставлять» (класс I), либо «вырезать и вставлять» (класс II).