В тектоническом плане они расположены на плите Хальмахера в зоне столкновения с Молуккским морем.
В 1999 году регентства Северный Малуку (Малуку Утара) и Халмахера Тенгах (Центральная Халмахера) были выделены в отдельную провинцию.