Хотя ядра динофлагеллат классифицируются как эукариоты, ядра динофлагеллят не являются типично эукариотическими, поскольку в них отсутствуют гистоны, нуклеосомы и они сохраняют постоянно конденсированные хромосомы во время митоза.
Хотя ядра динофлагеллат классифицируются как эукариоты, у них отсутствуют некоторые ключевые особенности ядер эукариот.