Но активность была замедлена из-за быстро формирующегося явления Эль-Ниньо в 2006 году, присутствия Сахарного воздушного слоя над тропической Атлантикой и устойчивого присутствия устойчивой зоны вторичного высокого давления к Азорским горам с центром вокруг Бермудских островов. После 2 октября тропических циклонов не было.
Однако явление Эль-Ниньо в сочетании с наличием воздушного слоя Сахары над тропическим Атлантическим океаном способствовало замедлению сезона и вынудило все тропические циклоны исчезнуть после 2 октября.