Команда почти вылетела в сезоне 2003–04, но в следующем сезоне восстановилась и финишировала 4-й, но не попала в Лигу чемпионов после того, как в последний день сыграла вничью с «Ганновером 96», в котором «Вердер» проиграл возьмите их на место в последний день.
Герта не попала в Лигу чемпионов только после того, как в последний день сыграла вничью с «Ганновером 96», в результате чего «Вердер» выиграл у них место в последний день.