После Второй мировой войны, во время которой его отец умер естественной смертью, Шолти был музыкальным руководителем Баварского государственного оркестра в Мюнхене (где он дал немецкую премьеру оперы Пауля Хиндемита «Матис дер Малер», запрещенной нацистами. режима) и Франкфуртской оперы (где он дал немецкую премьеру оперы Альбана Берга "Лулу").
После Второй мировой войны Шолти стал музыкальным руководителем Баварского государственного оркестра в Мюнхене (где он впервые в Германии представил оперу Пауля Хиндемита «Матис дер Малер», запрещенную во время правления нацистов. Он дирижировал Франкфуртской оперой). где он впервые в Германии исполнил оперу Альбана Берга «Лулу».