На вершине командной структуры находится главнокомандующий, который является правящим канадским монархом Елизаветой II, представленной генерал-губернатором.
Это единственное учреждение состоит из трех основных ветвей: морского командования (MARCOM), командования сухопутных войск (LFC) и воздушного командования (AIRCOM), которые все вместе находятся под контролем Совета вооруженных сил под председательством начальника штаба обороны.