Повзрослев, Атауальпа стал императором, победив своего старшего сводного брата Хью Шрам в гражданской войне, вызванной смертью их отца, Инки Хуайна Капака, от инфекционного заболевания, которым могла быть оспа.
Он стал императором после победы над своим младшим сводным братом Хуэ Шрамом в гражданской войне, последовавшей за смертью их отца, Инки Хуайна Капака, от инфекционного заболевания (возможно, малярии или оспы).