Эрик Патрик Клэптон родился в Рипли, графство Суррей, Англия, в семье 16-летней Патрисии Молли Клэптон (род. 7 января 1929 г.) и Эдварда Уолтера Фрайера (21 марта 1920 г. - 15 мая 1985 г.), 24-летнего солдата из Монреаль, Квебек . Фрайер отправился на войну до рождения Клэптона, а затем вернулся в Канаду.
Клэптон был сыном шестнадцатилетней Патриции Клэптон и Эдварда Фрайера, канадского солдата, дислоцированного в Англии.