Город расположен в месте слияния рек Сакраменто и Американ-Ривер, и имеет глубоководный порт, соединенный с заливом Сан-Франциско каналом через дельту реки Сакраменто.
Сакраменто находится недалеко от места впадения Американской реки в реку Сакраменто.