Фердинанд родился в Сос-дель-Рей Католико Арагон и был сыном Иоанна II Арагонского (чья семья была кадетской ветвью Дома Трастамара) от его второй жены, Хуаны Энрикес.
В ноябре 1511 года Фердинанд и его зять Генрих VIII из Англии подписали Вестминстерский договор, пообещав взаимопомощь между ними против Франции.