Величайшим врагом Малдера был Курильщик, который, несмотря на его очевидные злые намерения, казалось, относился к Малдеру с особым вниманием. Хотя он и насмехался над Малдером в лицо за его глупость и тщетность своих поисков, в «Двух отцах» он сказал своему сыну Джеффри Спендеру: «Ты бледнешь для Фокса Малдера. ''
У Малдера есть сестра по имени Саманта Малдер.