Важные города, расположенные в Сахаре, включают Нуакшот (столица Мавритании), Таманрассет, Уаргла, Бечар, Хасси-Мессауд, Гардая и Эль-Уэд (Алжир), Тимбукту (Мали), Агадес (Нигер), Гат (Ливия), а также как Файя-Ларджо (Чад).
Другие важные города - Таманрассет в Алжире и Себха и Гхат в Ливии.