В 1999 году Гергиев женился на музыканте Наталье Дебисовой, которая на 27 лет младше его, тоже коренная осетинка, и у них трое детей: два мальчика и девочка.
В 1999 году Гергиев женился на музыканте Наталье Дебисовой, у них трое детей.