С экологической точки зрения морские остракоды могут быть частью зоопланктона или (чаще всего) частью бентоса, живя на или внутри верхнего слоя морского дна.
Морские остракоды обитают в зоопланктоне. Другие обитают в бентосе, на или в верхнем слое морского дна.