Он родился в Королевском замке в Фонтенбло, сыне Генриха II, короля Франции (31 марта 1519 г. - 10 июля 1559 г.) и Екатерины Медичи (13 апреля 1519 г. - 5 января 1589 г.).
Франциск был женат на Марии I Шотландской 24 апреля 1558 года.