Некоторые этапы предлагают Йоши возможность на короткое время превращаться в транспортные средства. DS, как и оригинальный Yoshi's Island, отличается от многих платформеров тем, что у Yoshi нет шкалы жизни; когда Йоши получают удар, ребенок, которого он несет, падает со спины, и Йоши должен поднять его / ее до того, как истечет таймер.
Игрок перемещает Йоши через множество этапов.