В Северной Америке это была первая часть Metroid, выпущенная после выхода Super Metroid в 1994 году; на всех остальных рынках он был выпущен после Metroid Fusion.
У нее было два сиквела под названием Metroid Prime 2: Echoes и Metroid Prime 3: Corruption, побочная игра под названием Metroid Prime Hunters и побочный продукт под названием Metroid Prime Pinball. Действие происходит после Metroid, но до Metroid II: Return of Samus.