Командующий подводным флотом 1 октября 1939 года Дёниц стал контр-адмиралом (Konteradmiral) и «командиром подводных лодок» (Befehlshaber der Unterseeboote, BdU, немецкий эквивалент ComSubPac или ComSubLant); 1 сентября следующего года он был назначен вице-адмиралом (визеадмиралом).
Он служил командиром подводных лодок (Befehlshaber der Unterseeboote, B.d.U.).