Став членом Общества Иисуса в возрасте восемнадцати лет, он изучал богословие в Коимбре, а затем стал профессором университета Эворы в Португалии.
В возрасте восемнадцати лет Молина стал членом Общества Иисуса. Он изучал богословие в Коимбре.