Широко известный в Индонезии под своим инициалом «SBY», он был приведен к присяге 20 октября 2004 года вместе с Юсуфом Каллой в качестве вице-президента и 20 октября 2009 года вместе с Боедионо в качестве вице-президента.
Юдхойоно стал президентом 20 октября 2004 года.