Реабилитация Фокса как историка началась только в 1940 году, когда Дж. Ф. Мозли опубликовал Джона Фокса и его Книгу, что вызвало споры, которые продолжаются и по сей день. Недавно возобновившийся интерес к Фоксу как к основополагающей фигуре в исследованиях раннего Нового времени вызвал спрос на новое критическое издание «Актов и памятников», «Книга мучеников Variorum» Фокса.
Фокс начал публиковать труды, посвященные религиозным спорам, и работал над новым мартирологом, который впоследствии стал Книгой мучеников Фокса.