Чтобы сохранить игру, игроки входили в специальные порталы, которые с тех пор появлялись в каждой игре Metroid. Metroid II - единственная игра в серии, в которой показаны все стадии цикла развития существа Metroid; стадии эволюции, которые они проходят: Исходная, Альфа, Гамма, Дзета, Омега и Королева.
Это вторая игра из серии Metroid.