Среди братьев и сестер Маргариты были: Фердинандо II Медичи, великий герцог Тосканы, кардинал Джан Карло Медичи, кардинал Леопольдо де Медичи и Анна, жена Фердинанда Карла, эрцгерцога Дальней Австрии.
Среди братьев и сестер Маргариты были Фердинандо II Медичи, великий герцог Тосканы, кардинал Джан Карло де Медичи, кардинал Леопольдо Медичи и Анна, жена Фердинанда Карла, эрцгерцога Дальней Австрии.