После ухода участника-основателя Сида Барретта в марте 1968 года Уотерс стал основным автором текстов и идейным лидером группы до своего ухода из группы в 1985 году.
В 2005 году он выпустил признанную критиками оперу a Ira, которая вошла в топ классических чартов Америки и Великобритании, а также вместе с Ником Мейсоном, Ричардом Райтом и Дэвидом Гилмором в историческом выступлении на Live 8 2 июля 2005 года. Концерт в Лондонском Гайд-парке, Pink Floyds - первое публичное выступление с Роджером за 24 года.