Округ был назван в честь героя войны за независимость Элайджи Кларка и включал в себя 250 квадратных миль (640 км²) земли, которая изначально была частью округа Джексон.
Графство Кларк было образовано 5 декабря 1801 года и названо в честь героя Войны за независимость Элайджи Кларка.