Его вера в паранормальные явления проистекает из длительного опыта, который начался с похищения его сестры Саманты Малдер инопланетянами, когда Малдеру было 12 лет. Похищение его сестры является движущей силой в карьере Малдера на протяжении большей части сериала.
В сериале есть сюжет о сестре Малдера, Саманте Малдер.