Истоки Миссури находятся в Скалистых горах на юго-западе Монтаны, недалеко от небольшого городка Три-Форкс, берущего начало в реках Джефферсон, Мэдисон и Галлатин.
Исток реки Миссури находится в Скалистых горах в штате Монтана.