В 1942 году он стал столицей Португальской Гвинеи. После провозглашения независимости антиколониальными партизанами ПАИГК в 1973 году столицей де-факто независимых территорий была объявлена Медина-ду-Боэ, но Бисау оставался столицей регионов, оккупированных Португалией, а де-юре столица всей Португальской Гвинеи.
Он стал столицей Португальской Гвинеи в 1942 году и был столицей с момента провозглашения независимости, за исключением короткого периода в 1973 и 1974 годах, когда столица находилась в Боэ.