Среди множества агентств Министерства обороны США можно выделить Агентство противоракетной обороны, Агентство перспективных оборонных исследовательских проектов (DARPA), Агентство защиты сил Пентагона (PFPA), Агентство военной разведки (DIA), Национальное агентство геопространственной разведки (NGA) и Агентство национальной безопасности (АНБ).
Министерство обороны состоит из Министерства армии, Военно-морского флота, Военно-воздушных сил, Агентства национальной безопасности и Управления военной разведки.