В 1520 году Рафаэль также умер в возрасте 37 лет, и его преемник Бальдассаре Перуцци поддержал изменения, которые Рафаэль предложил во внутреннем устройстве трех главных апсид, но в остальном вернулся к плану Греческого креста и другим особенностям Браманте.
Рафаэль также умер, когда ему было за 30, в 1520 году, прежде чем в здании могли быть внесены какие-либо важные изменения. Следующим архитектором был Перуцци, которому нравились некоторые идеи Рафаэля, но не нравился план Латинского креста.