Марио, Луиджи и Йоши намеревались спасти принцессу Поганку и друзей-динозавров Йоши, исследуя Страну динозавров для Боузера и его коопалингов.
В этой игре Баузер похитил принцессу Поганку после того, как она, Марио и Луиджи отдыхали в Стране динозавров. Марио и Луиджи должны спасти ее и семь яиц Йоши от Баузера и его Копалингов.