Два с половиной года спустя в Части II Какаши преобразовывает Команду 7 с Наруто, Сакурой, Саем и Ямато. Он помогает и возглавляет новую Команду 7 в их постоянных попытках найти и вернуть Саске, но с каждой попыткой Саске ускользнул от них.
После того, как Саске уходит, Команда 7 получает Сай в качестве замены.