Стегозаврия находится в пределах тиреофора, или бронированных динозавров, подотряда, который также включает более разнообразные анкилозавры.
Классификация Стегозавр был членом Thyreophora, или бронированных динозавров, семейства динозавров, в которое входят анкилозавры.