Kanotix включает около 1200 программных пакетов: KDE, среду рабочего стола по умолчанию, включая Konqueror, IceWM, Beryl (позволяет получить доступ к среде рабочего стола 3D).
Kanotix использует KDE в качестве среды рабочего стола по умолчанию.