Прямой потомок революционного американского офицера Уильяма Прескотта, Уильям Х. Прескотт провел свое детство и юность в Бостоне, штат Массачусетс.
Дедом Прескотта был Уильям Прескотт, солдат, сражавшийся на стороне Соединенных Штатов в Американской войне за независимость. Прескотт вырос в Бостоне, штат Массачусетс, городе на восточном побережье Соединенных Штатов.