Джинна был непоседливым учеником, учился в нескольких школах: в Синд-медресе-тул-ислам в Карачи; ненадолго в начальной школе Гокал Дас Тедж в Бомбее; и, наконец, в средней школе христианского миссионерского общества в Карачи, где в возрасте шестнадцати лет он сдал экзамен на зачисление в университет Бомбея.
Его последняя школа была названа Высшей школой христианского миссионерского общества в Карачи.