24 апреля 1558 года четырнадцатилетний Дофин был женат на королеве Шотландии в союзе, который мог дать будущим королям Франции трон Шотландии, а также претендовать на престол Англии через великую Марию. дед, король Англии Генрих VII. Однако Мэри и Фрэнсис не должны были иметь детей во время их недолгого брака, возможно, из-за болезни Фрэнсиса или его неопущенных яичек.
Франциск был женат на Марии, королеве Шотландии, 24 апреля 1558 года.