Недавний кладистический анализ предполагает, что Confuciusornis - самая примитивная птица-пигостилиец; у нее более примитивный череп, чем у археоптерикса, но это первая известная птица, которая лишилась длинного хвоста археоптерикса и развила сросшиеся хвостовые позвонки (пигостиль).
Это также первая известная птица, которая потеряла длинный хвост археоптерикса и развила сросшиеся хвостовые позвонки (пигостиль).