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L'épidémie du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) qui a débuté en Chine en 2002 a été causée par un coronavirus précédemment non caractérisé qui pouvait être identifié par une amplification spécifique par RT-PCR. Les efforts visant à contrôler les futures épidémies de SRAS dépendent de l'identification précise et précoce des patients infectés par le SRAS-CoV. Un test de diagnostic quantitatif du SRAS basé sur la région non codante 3' (3'-NCR) du génome du SRAS-CoV a été développé sous la forme d'une RT-PCR fluorogénique en temps réel. L'efficacité d'amplification idéale d'un test de RT-PCR sensible au SRAS-CoV devrait donner une valeur E (augmentation de la concentration du produit de PCR par cycle d'amplification) égale à 2,0. Il a été démontré que les réactions de RT-PCR basées sur la région 3'-NCR du SRAS-CoV pouvaient être formulées pour atteindre d'excellentes valeurs E de 1,81, soit une efficacité d'amplification de 91%. Les préparations d'ADNc du SRAS-CoV dérivées d'extraits d'ARN viral et du plasmide recombinant cloné présentent toutes deux les mêmes caractéristiques d'amplification, c'est-à-dire une efficacité d'amplification utilisant la même formulation de PCR développée dans cette étude. La copie génomique virale (ou équivalences génomiques, GE) par unité infectieuse (GE/pfu) du SRAS-CoV utilisée dans cette étude a également été établie à environ 1200-1600:1. La sensibilité de détection du test pouvait atteindre 0,005 pfu ou 6-8 GE par test. Il a été démontré de manière préliminaire que le test pouvait détecter efficacement le SRAS-CoV à partir d'échantillons cliniques de patients probables et suspects de SRAS identifiés à Taïwan. Le test du SRAS basé sur la région 3'-NCR a démontré une spécificité diagnostique de 100% lors des tests d'échantillons de patients atteints de maladies respiratoires aiguës provenant d'une région non épidémique de SRAS
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Voici un titre pour ce paragraphe :
Développement et évaluation d'un test de RT-PCR du coronavirus du SRAS (SRAS-CoV) basé sur la région non codante 3' (3'-NCR) pour la détection du SRAS-CoV.