ऐसा लगता है कि महामारी मस्तिष्क ज्वर तुलनात्मक रूप से एक नया तथ्य है। पहला प्रमुख प्रकोप जो दर्ज किया गया था वह  में जेनेवा में था। यूरोप तथा यूनाइटेड स्टेट्स में इसके तुरंत बाद कई अन्य महामारियां बतायी गयीं और अफ्रीका में किसी महामारी की पहली रिपोर्ट  में जारी हुयी। अफ्रीकी महामारी वीं शताब्दी में अधिक आम हो गयी जिसमें - में नाइजीरिया और घाना में फैली महामारी से शुरुआत हुयी।