çalışma modları için verilen isimler değişse de waflar temelde üç farklı şekilde kullanılmaktadır nss labsa göre kullanım seçenekleri şeffaf köprü şeffaf ters vekil sunucu ve ters vekil sunucudur şeffaf http trafiğinin doğrudan web uygulamasına gönderildiğini ifade etmektedir bu yüzden waf istemci ile sunucu arasında şeffaftır bu durum wafın ters vekil sunucu olarak çalıştığı ve istemci trafiğinin doğrudan wafa gönderildiği ters vekil sunucu kullanıma aykırıdır waf sonrasında filtrelenmiş trafiği ayrı bir şekilde web uygulamalarına göndermektedir bu ip maskeleme gibi ilave faydalar sağlayabilir ancak performans gecikmesi gibi dezavantajlar da getirebilmektedir