يتفاوت هطول الأمطار في يلوستون بدرجة كبيرة ويتراوح من  بوصة  مم سنويا بالقرب من ينابيع الماموث الساخنة إلى  بوصة  ملم في جنوب غرب أقسام الحديقة ويتأثر هطول الأمطار في من يلوستون إلى حد كبير من قبل قناة الرطوبة التي شكلها شكلتها نهر الأفعى إلى الغرب التي شكلتها يلوستون نفسها فيسقط الثلج في أي شهر من شهور السنة وفي المتوسط  بوصة  ملم سنويا حول بحيرة يلوستون إلى الضعف ارتفاعا