केन्द्रीय विद्यालयों के प्रमुख चार मिशन इस प्रकार है-  केन्द्रीय सरकार के स्थानांतरणीय कर्मचारियों जिनमें रक्षा तथा अर्धसैनिक बलों के कर्मी भी शामिल हैं  के बच्चों को शिक्षा के सामान्य कार्यक्रम के तहत शिक्षा प्रदान कर उनकी शैक्षिक अवश्यकताओं को पूरा करना ।  विद्यालयी शिक्षा के क्षेत्र में श्रेष्ठता और गति निर्धारित करना ।  केन्द्रीय माध्यमिक षिक्षा बोर्ड सीबीएससी राष्ट्रीय शैक्षिक अनुसंधान एवं प्रशिक्षण परिषद् एनसीईआरटी इत्यादि जैसे अन्य निकायों के सहयोग से शिक्षा के क्षेत्र में नए-नए प्रयोग तथा नवाचार को सम्मिलित करना ।  बच्चों में राष्ट्रीय एकता और ’भारतीयता’ की भावना का विकास करना ।