한때 그의 죽음과 관련하여 당시 일본에 체류중이던 방정환이 헌병대에 체포되어 취조를 받고 풀려나기도 했다 도쿄에 와서 스테이션 호텔에 묵고 있던 중 민원식이 자객에 의해 살해된 사건에 천도교 청년회가 말려 든 것이다 민원식 살해 사건으로 천도교 청년회 도쿄 지회의 방정환 박달성 외 임원들이 이 사건에 관련된 것이 아닌가 하고 연행 구금되어  여일의 취조를 받게 된다