در بهمن  خورشیدی فوریهٔ  میلادی به‌دنبال شایعاتی مبنی بر اسکان آوارگان ارمنی در شهر دوشنبه مردم اعتراض کردند و در نتیجهٔ درگیری آنان و نیروهای پلیس عده‌ای زخمی یا کشته شدند مردم در تظاهرات خود خواستار اصلاحات اقتصادی و سیاسی بازگشایی مساجد و احیای فرهنگ ملی خود بودند به‌دنبال این درگیری‌ها فعالیت حزب رستاخیز و حزب دموکراتیک تاجیکستان و حزب نهضت اسلامی غیرقانونی اعلام شد در نوامبر  میلادی قهار محکموف به ریاست جمهوری برگزیده شد در  اوت  محکموف که با کودتای نظامیان بر ضد گورباچف مخالفت نکرده‌بود به‌دنبال تظاهرات گستردهٔ مردم مجبور به استعفا شد در نهم سپتامبر شورای عالی تاجیکستان به استقلال تاجیکستان رأی داد قدرالدین اصلانف رئیس شورای عالی و کفیل ریاست جمهوری فعالیت حزب کمونیست را ممنوع و دارایی آن را ملی کرد اما شورای عالی ــ که اکثر نمایندگان آن کمونیست بودند ــ اصلانف را برکنار و نبی‌اف را جانشین وی کرد و ممنوعیت فعالیت حزب کمونیست را لغو نمود در ششم اکتبر شورای عالی در نتیجهٔ فشار مخالفان فعالیت حزب کمونیست را به حال تعلیق درآورد و فعالیت حزب نهضت اسلامی را آزاد اعلام کرد نبی‌اف بلافاصله پس از آن از کفالت ریاست جمهوری استعفا کرد تا زمینهٔ برگزاری انتخابات فراهم شود انتخابات ریاست جمهوری سرانجام در  نوامبر  برگزار و نبی‌اف با ٪ آرا رئیس جمهور شد رقیب اصلی وی دولت خدانظروف که از پشتیبانی احزاب اصلی مخالف کمونیست‌های پیشین برخوردار بود ٪ آرا را به دست آورد هرچند که مخالفان