از آن پس تا  سال بعد قبایل مختلفی از جمله جغتایی‌ها بر آسیای مرکزی مسلط بودند تا اینکه تیمور در  قمری دولت مستقل خود را در این منطقه بنا نهاد و از جمله تاجیکستان کنونی را به تصرف درآورد دورهٔ تیموریان از دوره‌های رونق اقتصادی و مدنی ماوراءالنهر است در این دوره عمارت‌های عظیم و فاخری بنا شد که مخصوصاً سمرقند شهرت جهانی خود را مدیون آن‌هاست اما در تاجیکستان نیز آثار فراوانی از عهد تیموری برجای مانده‌است که از نظر تاریخ معماری دامنه‌اش تا دورهٔ شیبانیان کشیده می‌شود و عموماً تابع سبک معماری سمرقندی است؛ از آن جمله است بارگاه امیر سید علی همدانی پیشوای بزرگ تصوف در سدهٔ  قمری در کولاب از دیگر آثار کولاب مقبرهٔ یارمحمد ولی در روستای بخارک و مسجد و مقبرهٔ شاه خاموش در لنگر کلان است مسجد و مزار مولانا یعقوب چرخی در نزدیکی شهر دوشنبه و مقبرهٔ منسوب به عبدالقادر گیلانی نیز بر رونق بازار تصوف در آن روزگار گواه است مجموعهٔ موسوم به شیخ مصلح‌الدین دارای بناهایی از سده‌های – قمری و دیدنی‌ترین یادگار شهر خجند است نمازگاه‌های نوگلیم و عبدالله خان در اسفره و مسجد کوک گنبد و مزار بابا طغا و مجتمع سرمزار در اوراتپه نیز از آثار سده‌های –ق به شمار می‌آیدسده‌های– قمری – میلادی عصر بالندگی معماری ماوراءالنهر است و تاجیکستان هم از آثار این دوره بی‌بهره نیست؛ بیشتر این آثار آرام