In its work the Center cooperates with the Council of Ministers of Internal Affairs of the States CIS Members, the Council of Ministers of Defense of the States CIS Members, the Coordination Council of the Prosecutors General of the States CIS Members, the Council of Commanders of Frontier Troops, their working bodies, as well as the Bureau for Coordination of Fight against the Organized Crime and Other Dangerous Crimes on the Territories of the States CIS Members.
У своїй роботі Центр взаємодіє з Радою міністрів внутрішніх справ держав-учасниць СНД, Радою міністрів оборони держав-учасниць СНД, Координаційною радою генеральних прокурорів держав - учасниць СНД, Радою командувачів Прикордонними військами, їхніми робочими органами, а також Бюро по координації боротьби з організованою злочинністю та іншими небезпечними видами злочинів на території держав-учасниць СНД.