Проводимая ЭСКАТО деятельность по линии межучрежденческого сотрудничества включает в себя реагирование на стихийные бедствия и обеспечение подготовленности к ним, борьбу с ВИЧ/СПИДом, меры по охране окружающей среды, ликвидацию проблемы насилия в отношении женщин (включая торговлю женщинами), присоединение к ВТО и обновление статистической информации, содержащейся в докладе об осуществлении ЦРДТ.
亚洲及太平洋经济社会委员会的机构间合作包括救灾防灾、防治艾滋病毒/艾滋病、环境保护、对妇女的暴力行为（包括贩卖人口）、加入世贸组织以及千年发展目标报告的资料补充等。