МФСР также вовлечен в ряд проектов, посвященных гендерным проблемам, в том числе в проекты, направленные на сокращение рабочей нагрузки на женщин представительниц коренного населения в Китае и расширение локальных знаний женщин в Индии, а также в Южно-азиатскую инициативу по созданию соответствующих возможностей для женщин-сельхозпроизводителей посредством обмена знаниями на уровне общин и программ профессиональной подготовки.
农发基金还参与若干着重于性别问题的项目，包括中国减少土著妇女工作负担的项目，扩大印度妇女土著知识的项目、关于南亚通过社区交流和培训方案扶持女性农民的倡议。