КОНПО активно поддерживала процесс перехода от Комиссии по правам человека к Совету по правам человека, и ее Президент направил на имя Председателя Генеральной Ассамблеи письмо (26 января 2006 года) о необходимости обеспечить право НПО на полноправное участие в работе этого нового Совета.
非政府组织会议积极参与到委员会过渡到人权理事会的工作中，主席向大会主席写了封信（2006年1月26日），阐述了需要保障非政府组织充分参与新的理事会的权利。