ЦКМ принял также активное участие в работе таких комитетов НПО, как Справочная группа по гуманитарным последствиям санкций Межучрежденческого постоянного комитета (эта группа была распущена после снятия санкций с Ирака); Рабочая группа НПО по Совету Безопасности, работа которой освещалась в регулярных брифингах, проводимых послами стран, представленных в Совете Безопасности; Центральноафриканский форум по вопросам политики, который представляет собой ежемесячное совещание представителей НПО, миссий при Организации Объединенных Наций, учреждений и департаментов Организации Объединенных Наций и научных кругов, которое проводится с целью изучения политических вариантов достижения мира в районе Великих Озер и соседних стран Центральной Африки; Рабочая группа по проблемам Уганды; Рабочая группа по проблемам Демократической Республики Конго; и Рабочая группа НПО по Израилю и Палестине.
门诺派中央委员会还积极参加若干个非政府组织委员会，其中包括：制裁的人道主义后果咨商小组机构间常设委员会（解除对伊拉克的制裁后，该小组解散）；安全理事会非政府组织工作组，参加在安全理事会工作的各国大使就该机构的工作举行的情况介绍会；中非政策论坛，每月举办一次，非政府组织、联合国特派团、联合国机构、部门和学术组织共同参加，探讨中非大湖地区和周边国家实现和平的政策选择；乌干达工作组；刚果民主共和国工作组；以及非政府组织以色列和巴勒斯坦问题工作组。