Sin embargo, las instituciones del Pacto Andino, a diferencia de las del MERCOSUR, tienen autoridad supranacional; los Estados miembros o las empresas con un interés legítimo pueden pedir a la Junta del Acuerdo de Cartagena autorización para aplicar medidas con el fin de impedir o corregir una amenaza de daño o un daño a la producción o a las exportaciones, cuando ello se deba a prácticas comerciales restrictivas. Las órdenes de la Junta tienen un efecto directo en las normas jurídicas de los Estados miembros.
Однако, в отличие от МЕРКОСУР, учреждения Андского пакта обладают надгосударственными полномочиями; государства-члены или любое предприятие, имеющее законные интересы, могут обратиться к Совету Картахенского соглашения за разрешением на применение мер с целью предупреждения или устранения ущерба или угрозы причинения ущерба производству или экспорту, которые являются следствием ОДП, и постановления Совета имеют прямое действие в правовых системах государств-членов.