La cooperación sobre programas operacionales tiende a establecerse entre los miembros del Grupo de Trabajo que tienen capacidades operacionales: el Departamento de Operaciones de Mantenimiento de la Paz, el Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia y el PNUD participaron en las dependencias integradas de desarme, desmovilización y reintegración en Haití y el Sudán.
Сотрудничество в рамках оперативных программ осуществляют, как правило, те члены Рабочей группы, которые располагают оперативным потенциалом: Департамент операций по поддержанию мира, Детский фонд Организации Объединенных Наций и Программа развития Организации Объединенных Наций участвовали в деятельности совместных подразделений по вопросам разоружения, демобилизации и реинтеграции в Гаити и Судане.