La acuicultura también tiene un efecto sobre el medio ambiente al agotar y deteriorar los recursos (propagación de agentes patógenos de las poblaciones de criadero hacia las poblaciones en libertad y contaminación por el vertido de efluentes, residuos sólidos y escapes).
Рыбхозы могут также наносить вред окружающей среде, истощая природные ресурсы и ухудшая их качество (перенос болезнетворных микроорганизмов в естественную среду и ее заражение в результате сброса или утечки твердых отходов).