El Centro de Operaciones Aéreas de la Misión se encarga de coordinar la utilización de los recursos con los contratistas de servicios de aviación de las Naciones Unidas y las unidades de aviación de los contingentes en lo relativo al uso de horas de tripulación y horas de vuelo, teniendo en cuenta la rotación de las tripulaciones, el mantenimiento de las aeronaves y el tiempo de indisponibilidad por causas imprevistas, de manera que el servicio esté asegurado; recibir solicitudes de vuelo de los centros de operaciones aéreas del sector y las oficinas de Jartum, coordinarlas de manera que se ajusten la disponibilidad de recursos y asesorar a los clientes sobre la utilización de los recursos aéreos; coordinar las solicitudes de vuelo especiales y las solicitudes de transporte de mercancías; informar a las tripulaciones acerca de las tareas asignadas, los permisos de vuelo, el control del tráfico aéreo, los gestores de los aeropuertos y representantes del Gobierno local y las autoridades de aviación civil, y los servicios de inteligencia militar; evaluar los riesgos de cada vuelo teniendo en cuenta las opiniones del Centro Mixto de Análisis de la Misión; difundir las previsiones del tiempo entre las tripulaciones; obtener autorizaciones de seguridad de las Naciones Unidas para los vuelos; y coordinar todos los vuelos con los centros de operaciones aéreas del sector que corresponda.
Центр управления воздушными перевозками Миссии отвечает за координацию использования имущества авиационными подрядчиками Организации Объединенных Наций и авиационными подразделениями контингентов в том, что касается налетных часов экипажей и авиатранспортных средств, учета ротации экипажей, технического обслуживания авиатранспортных средств и незапланированного простоя, с тем чтобы всегда имелись в наличии свободные авиатранспортные средства; прием запросов на полеты из секторальных центров воздушных перевозок и объектов в Хартуме; а также за координацию таких полетов в целях подбора для клиентов подходящих авиасредств и их консультирования по вопросам пользования авиатранспортным имуществом; координацию запросов в отношении специальных рейсов и заказов на перевозку грузов; проведение для экипажей инструктажей по вопросам, касающимся выполнения конкретных функций, получения разрешений на полеты, авиадиспетчерского контроля, связи с начальником аэропорта и местными органами управления, а также работы представителей Управления гражданской авиации и военной разведки; оценку рисков, связанных с каждым полетом, с учетом рекомендаций Объединенного аналитического центра Миссии; ознакомление экипажей с прогнозами погоды; получение разрешений на полеты от служб безопасности Организации Объединенных Наций; и координацию всех полетов, по мере необходимости, с соответствующими секторальными центрами воздушных перевозок.