Cuando ha sido necesario, la UNCTAD ha colaborado también estrechamente con la OMC, el CCI, el Banco Mundial, el Departamento de Asuntos Económicos y Sociales de las Naciones Unidas, el PNUD, el PNUMA, la Oficina del Alto Representante de las Naciones Unidas para los PMA, los países en desarrollo sin litoral y los pequeños Estados insulares en desarrollo, las comisiones regionales de las Naciones Unidas, el Fondo Común para los Productos Básicos, las organizaciones internacionales de productos básicos, los bancos de importación y exportación, las autoridades de la competencia, la Unión Africana, las secretarías de integración regional, la Unión Europea, el Departamento de Desarrollo Internacional del Reino Unido, el Organismos Sueco de Desarrollo Internacional (OSDI), instituciones académicas y organizaciones de la sociedad civil, inclusive el sector privado.
При необходимости ЮНКТАД также тесно сотрудничала, в частности с ВТО, МТЦ, Всемирным банком, Департаментом по экономическим и социальным вопросам Организации Объединенных Наций, ПРООН, ЮНЕП, канцелярией Высокого представителя Организации Объединенных Наций по НРС, РСНВМ и МОРГ, региональными комиссиями Организации Объединенных Наций, Общим фондом для сырьевых товаров, международными организациями по сырьевым товарам, экспортно-импортными банками, органами, ведающими вопросами конкуренции, Африканским союзом, секретариатами региональных организаций по вопросам интеграции, Европейским союзом, министерством по вопросам международного развития Соединенного Королевства, СИДА (Швеция), научными учреждениями и организациями гражданского общества, включая частный сектор.