Dos acuerdos regionales, celebrados bajo los auspicios de la Convención sobre especies migratorias, se refieren a la conservación de los cetáceos: el Acuerdo de 1991 sobre la conservación de pequeños cetáceos del Mar Báltico y el Mar del Norte y el Acuerdo de 1996 sobre la conservación de cetáceos en el Mar Negro, el Mar Mediterráneo y la zona atlántica contigua.
Два региональных соглашения, заключенных в рамках Конвенции о мигрирующих видах, регулируют вопросы сохранения китообразных: Соглашение об охране малых китов Балтийского и Северного морей 1991 года (АСКОБАНС) и Соглашение по сохранению китообразных Черного и Средиземного морей и прилегающей атлантической акватории 1996 года (АККОБАМС).