Pese a las ofertas hechas por el Estado a la familia Sankara de una indemnización con cargo a un fondo creado el 30 de mayo de 2001 por el Gobierno en favor de las víctimas de la violencia en la vida política, la viuda y los hijos del Sr. Sankara no han deseado nunca recibir tal indemnización. El 29 de junio de 2006, en cumplimiento del dictamen del comité sobre la indemnización de la familia, el Gobierno ha evaluado y liquidado el importe de la indemnización debida a la Sra. Sankara y a sus hijos en 434.450.000 CFA (843.326,951 dólares de los EE.UU. aproximadamente).
Несмотря на предложения государства выплатить семье Санкары компенсацию из учрежденного 30 марта 2001 года правительством фонда в интересах жертв насилия в политической сфере, вдова и дети г-на Санкары ни разу не изъявили желания получить такую компенсацию. 29 июня 2006 года в свете соображений Комитета о выплате компенсации правительство рассчитало и определило сумму причитающейся г-же Санкаре и ее детям компенсации в размере 43 445 000 франков КФА (около 843 326 долл. США).