El objetivo de la Comisión era coordinar la labor de sus miembros y su interacción con otros órganos e instituciones del Estado y con las organizaciones de la sociedad civil a fin de establecer mecanismos que permitieran buscar, investigar y determinar el paradero de personas que fueron objeto de desapariciones forzosas durante el conflicto armado interno.
Комиссия должна координировать работу входящих в ее состав членов и их взаимодействие с другими государственными организациями и учреждениями, а также с организациями гражданского общества, для создания механизмов поиска, проведения расследований и установления местонахождения лиц, ставших в период внутреннего вооруженного конфликта жертвами насильственного или недобровольного исчезновения.