La Misión tiene una estructura orgánica unificada, basada en zonas y descentralizada, compuesta por un cuartel general de la Misión en Jartum y un cuartel general sobre el terreno en Juba, en el Sudán meridional.
6. Миссия имеет единую и децентрализованную организационную структуру районного базирования в составе штаба Мисси в Хартуме и полевого отделения в Южном Судане в Джубе.