El cuartel general de la Misión en Jartum sirve de enlace principal con el Gobierno de Unidad Nacional y el cuartel general sobre el terreno en Juba con el Gobierno del Sudán meridional, de conformidad con lo dispuesto en el Acuerdo General de Paz.
В соответствии с положениями Всеобъемлющего мирного соглашения штаб Миссии в Хартуме является основным каналом связи с правительством национального единства, а полевой штаб в Джубе -- с правительством Южного Судана.