وعندما اختتم المؤتمر في عام ٢٩٩١، محبطا آمال الكثيرين، كان قد انتخب رئيسا للوزراء وبرلمانا انتقاليا )برئاسة أسقف كيزانغاني، المونسينيور موسنغفو، الذي كان رئيسا لهذا المؤتمر(. ولكن الرئيس موبوتو وأعوانه لم يقبلوا هذه النتيجة، مما أدى إلى انقسام السلطات ووجود رئيسين للوزراء يدﱠعي كل منهما الشرعية. وفي ٩ نيسان/أبريل ٤٩٩١، أُصدر دستور انتقالي يُنتخب بموجبه رئيس الوزراء من جانب المجلس اﻷعلى للجمهورية - البرلمان اﻻنتقالي )المؤلف من أعضاء معيﱠنين من جانب المؤتمر الوطني السيادي ومن برلمانيين سابقين انتهت مدة وﻻيتهم في عام ١٩٩١، اﻷمر الذي يضمن اﻷكثرية لﻷحزاب المقرﱠبة من الرئيس( ومن صفوف اﻷسرة السياسية التي ﻻ ينتمي إليها رئيس الدولة.
Al clausurarse la CNS en 1992 -frustrándose muchas esperanzas- se estableció un Primer Ministro y un Parlamento de Transición elegidos por aquélla (y presidido por el Obispo de Kisangani, Monseñor Monsengwo, que había dirigido la CNS), lo que no fue aceptado por Mobutu y su entorno, produciéndose una división de poderes, con dos Primeros Ministros que reclamaban la legitimidad, hasta que el 9 de abril de 1994, la clase política acuerda un Acta Constitucional de Transición, que consagra que el Primer Ministro sería elegido por el Parlamento, HCR-PT (integrado por los elegidos por la CNS, más los antiguos parlamentarios cuyos mandatos habían cesado en 1991, lo que asegura la mayoría a los sectores ligados al Presidente) entre los integrantes de la familia política diferente a la del Jefe del Estado.