واذا ما تقرر أن ينشئ البروتوكول هيئاته الفرعية المستقلة الخاصة به، فسيحتاج اﻷمر الى النظر في نوع آخر من القضايا مثل اﻵثار المترتبة على برامج عمل الهيئة الفرعية للمشورة العلمية والتكنولوجية والهيئة الفرعية للتنفيذ، والتنسيق بين النظم المختلفة والموارد التي تحتاجها اﻻتفاقية واﻷطراف فرادى لدعم ترتيب من هذا القبيل.
Si un protocolo estableciera sus propios órganos subsidiarios independientes, sería necesario tener en cuenta un tipo diferente de problemas, por ejemplo, las consecuencias para los programas de trabajo del Organo subsidiario de asesoramiento científico y tecnológico y el Organo subsidiario de ejecución, la coordinación entre los diferentes sistemas y los recursos necesarios para que la Convención y cada una de las Partes pudieran apoyar este tipo de arreglo.