ويتكون عنصر المراقبين العسكريين للبعثة من وحدة مقر قيادة موجودة في كيغالي، وهي مسؤولة عن العمليات والتخطيط وإدارة شؤون اﻷفراد واﻻمدادات واﻷنشطة اﻻنسانية؛ وأفرقة المراقبين الموزعة في المواقع العشرة التالية: بيومبا، وكيبنغو، وغيتاراما، وغيكونغورو، وكيباي، وسيانغوغو، وغيسني، وروهنغري، وبوتاري، وكيغالي.
Компонент военных наблюдателей МООНПР, который состоит из штабной группы, отвечающей за проведение операций, планирование, управление кадрами, материально-техническое обеспечение и гуманитарную деятельность, дислоцируется в Кигали; группы наблюдателей размещены в следующих 10 секторах: в Бьюмбе, Кибунго, Гитараме, Гиконгоро, Кибуе, Чьянгугу, Гисеньи, Рухенгери, Бутаре и Кигали.