ويتمثل الشاغل الثاني في الآثار الواقعة على النظام الإيكولوجي بسبب المصائد التي تستخدم شباك الصيد التي تجر على قاع البحر والناشئة عن: (أ) الاختيار السيئ لشباك الجر وما يترتب على ذلك من آثار على الأنواع المستهدفة (من خلال صيد صغار السمك) وعلى الأنواع غير المستهدفة سواء مرتجعة أو غير مرتجعة؛ (ب) وأثرها المادي على القاع وما يحويه من حيوانات، والضرر الناتج الذي يلحق بالنظم الإيكولوجية الضعيفة بوصفها موائل بالغة الأهمية للتنوع البيولوجي البحري(28)(33).
El segundo está relacionado con los efectos de la pesca de arrastre en los ecosistemas que se derivan de: a) la selección inadecuada de las redes de arrastre y su consiguiente repercusión en las especies objeto de pesca (mediante la captura de peces juveniles) y las que no lo son, tanto si se descartan como si no; y b) la incidencia física en el fondo marino y su fauna, así como los daños ocasionados a los ecosistemas vulnerables que constituyen un hábitat de importancia fundamental para la biodiversidad marina28, 33.