وحيث أن تنفيذ برنامج تخطيط موارد المؤسسة ينطوي على مخاطر، ومعرض لتجاوز التكاليف المقررة، فلا بد من وجود استراتيجية لمراقبة التكاليف من أجل إدارة أي تعديلات، الأمر الذي سيزيد من مخاطر التأخير في المشروع وارتفاع تكاليفه.
En vista de que los sistemas de planificación de los recursos institucionales suponen riesgos considerables y están expuestos a sobrecostos, será necesario contar con una estrategia de control de los costos para administrar la adaptación del sistema a las necesidades específicas, que aumenta la posibilidad de demoras y de una escalada de los costos.