وستدير الصندوق إدارة أو وكالة واحدة، من قبيل منظمة الأمم المتحدة للطفولة أو برنامج الأمم المتحدة الإنمائي، باسم المنظومة، والخيار الثاني هو أن تُجمع مساهمات يتفق عليها من كل منظمة موجودة من منظمات الأمم المتحدة، في كل بلد يكون فيه للأمم المتحدة وجود، في صندوق مشترك على أن يتولى المنسق المقيم/منسق الشؤون الإنسانية المسؤولية الكاملة عنه.
Un único departamento u organismo, como el Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia o el Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo, administraría el fondo en nombre de todo el sistema. Otra opción sería establecer, en todos los países donde hubiera una presencia de las Naciones Unidas, un fondo común bajo la responsabilidad del Coordinador Residente y de Asuntos Humanitarios al que cada una de las organizaciones presentes haría contribuciones previamente convenidas.