وفي أوائل القرن الثالث عشر، كانت آسيا الوسطى (بالإضافة إلى أذربيجان وإيران) تابعة فترة قصيرة لدولة ملوك خوارزم، التي اندثرت بعد هجوم جحافل جنكيز خان.
13世纪初，中亚(同阿塞拜疆和伊朗一起)有很短的一段时间曾属于花拉子模国，后来该国被成吉思汗的军队打败并灭亡。