وتُغفَل التكاليف غير المباشرة عادة من ميزانية مشاريع نظم التخطيط ومن التكاليف المتوقعة للصيانة والترقية البرمجية، رغم أنها تشكل أكبر نسبة من التكلفة في دورة حياة النظام، ورغم وجود علاقة سببية مباشرة بين التكييفات المدخلة في البداية على النظام وتكلفة صيانته وترقيته لاحقاً.
尽管在企业资源规划系统生命周期中，间接成本以及维护和升级成本所占的比例最大，同时一开始对某一系统定制化与系统未来的维护和升级成本之间有着直接的因果关系，但是在企业资源规划项目的预算中常常忽略了间接成本，同时也未能预见维护和升级成本。