وعلى الرغم من أن اللجنة كان لها في كوسوفو سلطة أوسع تكفل تنفيذ قراراتها، فقد أثار عدد من الجهات المعنية الوطنية والمحلية بعض الصعوبات، وكان من بين تلك الجهات إدارات محلية في صربيا ظلت تمنع الاطلاع على السجلات المساحية، إلى أن تم في 2 كانون الأول/ديسمبر 2002 التوصل إلى اتفاق في هذا الشأن؛ وموظفون إداريون وموظفون آخرون من موظفي إنفاذ القانون على الصعيد المحلي أبدوا عزوفا شديدا عن منع من طردوا من العقارات عملا بقرارات اللجنة من إعادة شغل تلك العقارات؛ ومحاكم محلية خلصت في قضايا خارجية إلى نتائج تتعارض مع استنتاجات اللجنة، أو تتجاهل ولايتها أو قراراتها السابقة.
虽然科索沃委员会有更大的权力来执行其决定，但其面临的挑战来自包括以下各方在内的国家和地方利益攸关方：2002年12月2日签署协议之前，塞尔维亚地方行政当局拒绝提供地籍登记册；行政和其他当地执法人员极不愿意阻止那些根据委员会决定被驱逐的人重新占领地产；当地法院就无关问题做出与委员会调查结果相冲突的结论，或无视委员会管辖权或先前的裁决。