ولم يُعَمِّر الاتحاد إلاّ لمدة قصيرة، وكانت السلفادور آخر مقاطعة تنفصل عن الاتحاد. وأدّت هذه الأحداث إلى إنشاء جمهوريات غواتيمالا وهندوراس والسلفادور ونيكاراغوا وكوستاريكا.
随后不久中美洲联邦就宣布解体，先后成立了危地马拉共和国、洪都拉斯共和国、萨尔瓦多共和国、尼加拉瓜共和国和哥斯达黎加共和国，而萨尔瓦多成为最后脱离联邦的国家。