وعلى سبيل المثال، أعرب المقرر الخاص المعني بتعزيز وحماية حقوق الإنسان في سياق مكافحة الإرهاب، عن قلقه إزاء تدني ضمانات المحاكمة العادلة الذي كثيرا ما تتصف به ممارسات المحاكم العسكرية والمحاكم الخاصة، والذي يعزى إلى طول فترات الاحتجاز قبل المحاكمة، مع عدم إتاحة الفرصة الكافية للاستعانة بمستشار قانوني، والتغول على سرية المعلومات بين المحامي وموكله، وفرض قيود صارمة على الحق في الاستئناف والإفراج بكفالة (A/63/223، الفقرة 27).
例如，在反恐怖主义过程中促进和保护人权与基本自由问题特别报告员关切的是，军事法庭和特别法庭的审判在实践中经常不太公平，原因是指控前和审判前的拘留时间很长，没有什么机会得到律师援助，侵犯律师-当事人保密性，并严格限制上诉和保释权利(A/63/223，第27段)。