وعندما دخلت الاتفاقية حيز النفاذ، استُخدمت الاشتراكات المقررة في الصندوق الاستئماني العام للاتفاقية في تعويض تكاليف الموظفين التي كانت تمول في السابق من ميزانيات برنامج الأمم المتحدة للبيئة، بما في ذلك بعض الوظائف التي كانت تُغطَّي عن طريق تكاليف دعم البرنامج وبعض التكاليف المماثلة للموظفين التابعين لمنظمة الأغذية والزراعة، بينما واصلت منظمة الأغذية والزراعة الدفع مقابل بعض الموظفين من الميزانية العادية للمنظمة.
《公约》生效后，缔约方向普通信托基金缴纳的分摊会费被用于偿付之前由环境署预算出资的工作人员费用（包括由方案支助费用供资的某些职位的费用）及部分同样由粮农组织出资的工作人员费用，但粮农组织仍通过其经常预算继续为部分工作人员费用提供资金。