فعلى الرغم من اتفاقهما على إعطاء الأولوية للمناطق المتنازع عليها، فالخلاف يكمن في ما إذا كان التعامل مع المناطق المطالب بها ينبغي أن يتم في عملية موازية لتسوية المناطق المتنازع عليها (موقف جنوب السودان) أو في عملية لاحقة لتلك التسوية (موقف السودان).
虽然双方同意优先解决有争议地区，但分歧在于是应该同时解决有主权主张的地区(南苏丹的立场)、还是在解决有争议地区问题之后再解决此问题(苏丹的立场)。