وعلى امتداد تاريخ العلاقات الدبلوماسية، وقعت بنما وكوبا 22 اتفاقا تسري أحكامها بالكامل، منها 14 اتفاقا مبرما بين مؤسسات في البلدين في شتى مجالات التعاون، يذكر منها اتفاق مكافحة الاتجار بالمخدرات، واتفاق التعاون الأساسي، واتفاق التعاون في مجال الثقافة والتعليم، واتفاق إعفاء حاملي جوازات السفر الدبلوماسية من تأشيرات الدخول، وآلية المشاورات السياسية، واتفاق معادلة الشهادات الجامعية، واتفاق الخدمات الجوية، والاتفاق التجاري ذو النطاق الجزئي، والاتفاق المتعلق بتقديم المساعدة القانونية في المجال الجنائي.
巴拿马和古巴自两国建立外交关系以来，已签署22项依然有效的协定，其中14项是打击贩毒、基本合作、文化和教育领域合作、取消对外交护照的签证要求、政治协商机制、相互承认大学学历等合作领域的机构间协定；航空服务协定；部分贸易协定；刑事案件法律协助协定。