وقد أنشأ الصندوق حتى الآن ثلاثة صناديق مواضيعية للأغراض التالية: (أ) مكافحة ناسور الولادة؛ و (ب) أمن سلع الصحة الإنجابية؛ و (ج) صحة الأم.
На сегодняшний день в ЮНФПА создано три тематических фонда: а) для ликвидации послеродовых свищей; b) для гарантированного обеспечения средствами охраны репродуктивного здоровья; а также с) для охраны здоровья матери.