وتتضمن خطة جوهانسبرغ للتنفيذ نُهجا وأدوات مختلفة للحفاظ على التنوع البيولوجي البحري واستخدامه على نحو مستدام، بما في ذلك تطبيق نَهج النظم الإيكولوجية بحلول عام 2010 (الفقرة 30 (د))()، وإنشاء مناطق بحرية محمية بما يتوافق والقانون الدولي، وبالاستناد إلى المعلومات العلمية، بما في ذلك الشبكات الممثلة بحلول عام 2012، ووضع برامج وطنية وإقليمية ودولية لوقف فقدان التنوع البيولوجي البحري (الفقرة 32 (ج) و (د)).
В Йоханнесбургском плане упоминаются различные подходы и инструменты для сохранения и устойчивого использования морского биоразнообразия, включая внедрение к 2010 году экосистемного подхода (пункт 30 (d)), создание охраняемых морских районов в соответствии с международным правом и на основе научной информации, включая репрезентативные сети к 2012 году, и разработку национальных, региональных и международных программ остановки потери морского биоразнообразия (пункт 32 (c) и (d)).