إلا أن البرنامج واجه (أ) انقطاعات من حينٍ لآخر في خدمات منع انتقال الفيروس نقص المناعة البشرية من الأم إلى الطفل بسبب النقص في العقاقير، (ب) والعطل في معدات الفحص مما نتج عنه عدم الانتظام في اختبارات فيروس نقص المناعة البشيرة ومعالجة النساء والأطفال عادة دون التأكد من حملهم للفيروس؛ (ج) ندرة البيانات المتعلقة بنقل الفيروس من الأم إلى الطفل؛ (د) انعدام الحافز وارتفاع معدل استنزاف المهنيين المدربين بسبب تدني مستوى الأجور.
Однако в ходе реализации программы приходится сталкиваться со следующими проблемами: а) частое прерывание осуществляемого обслуживания ввиду дефицита медикаментов; b) поломки аналитического оборудования, обусловливающие нерегулярность анализов на ВИЧ, и при этом женщины с грудными детьми зачастую подвергаются лечению без подтверждения их ВИЧинфицированности; с) дефицит данных о передаче ВИЧ от матери ребенку; и d) недостаточная заинтересованность и высокая текучесть кадров среди квалифицированных специалистов ввиду малых размеров оплаты труда.