وفي الوقت ذاته، يقال إن الكائنات المعدلة وراثيا تقدم فوائد للبيئة، من قبيل أنها تحد من مساحة الأرض المطلوبة لإنتاج الأغذية وذلك بفضل تحسين الإنتاجية، وتحد من المواد الكيميائية المطلوبة لحماية المحاصيل، وتتيح الفرصة لإصلاح الأراضي المعطوبة أو الأقل خصوبة، وتحد من النفايات بفضل إنتاجها منتجات ذات عمر افتراضي أطول، وإنتاجها مواد عضوية لتوفير الطاقة (وقود حيوي).
В то же время считается, что генетически измененные организмы дают в экологическом отношении такие преимущества, как сокращение площади земель, требуемых для производства продуктов питания в связи с повышением производительности; снижение количества химикатов, необходимых для защиты сельскохозяйственных культур; создание возможностей для восстановления нарушенных или менее плодородных земель; сокращение отходов благодаря производству продуктов с более длительным сроком хранения; и производство органического материала для получения энергии (биотопливо).