وتشكو الوكالة أيضا من أن مبانيها اُستخدمت بشكل متكرر كمراكز للاحتجاز. وفي 9 نيسان/أبريل 2002، اقتحمت قوات إسرائيلية خاصة ووحدات من الجيش مركز الأونروا للتدريب المهني للرجال في رام الله واعتقلت عميده و 104 آخرين.
БАПОР жалуется также на то, что его помещения неоднократно использовались в качестве мест заключения. 9 апреля 2002 года специальные израильские силы и армейские подразделения ворвались в Рамаллахский мужской учебный центр БАПОР и арестовали его декана и еще 104 человека.