ومن الناحية البيئية، يقال إن الجينات قد ينتهي بها الأمر في أماكن غير متوقعة، وقد تتحول وتكون لها آثار ضارة (من ذلك مثلا أنها تؤدي إلى ظهور &quot; أعشاب شديدة المناعة &quot; تقاوم الآفات ومبيدات الأعشاب)، كذلك فإن الجينات &quot; النائمة &quot; يمكن أن تستيقظ صدفة وأن تصبح الجينات النشطة &quot; هامدة &quot; ، ويمكن أن تتفاعل الجينات مع الكائنات البرية والمحلية بما قد يترتب على ذلك من آثار سلبية على الطيور والحشرات والأتربة، في حين يعود ذلك دون قصد بالضرر على الكائنات المفيدة التي تتغذى على آفات المحاصيل.
В экологическом плане утверждается, что манипуляции с генами могут принести неожиданные результаты и вызвать мутации с пагубными последствиями (например, создать &lt; &lt; суперсорняки &gt; &gt; , стойкие к вредителям и гербицидам), что &lt; &lt; спящие &gt; &gt; гены могут случайно активизироваться, а активные гены могут стать &lt; &lt; пассивными &gt; &gt; , и что гены могут вступить во взаимодействие с дикими и местными популяциями животных, что имело бы неблагоприятные последствия для птиц, насекомых и почвы, причинив непроизвольный вред полезным хищникам, истребляющим вредителей сельскохозяйственных культур.