وعلاوة على مذكرتي التفاهم مع المنظمة البحرية الدولية والأكاديمية البحرية الدولية، تسير العلاقات من خلال صلاحيات اللجان المشتركة، بما في ذلك فريق المواءمة المشترك بين المنظمة البحرية الدولية والمنظمة الهيدروغرافية الدولية والمعني بالنظام الإليكتروني لعرض الخرائط والمعلومات؛ واللجنة التوجيهية المشتركة بين المنظمة الهيدروغرافية الدولية واللجنة الإقيانوغرافية الحكومية الدولية لوضع خريطة عامة لأعماق البحار؛ واللجنة الفرعية المعنية بأسماء تضاريس القاع، واللجنة الفرعية المعنية بالقياس الرقمي للأعماق؛ والمجلس الاستشاري المشترك بين المنظمة الهيدروغرافية الدولية والرابطة الدولية للجيوديسيا واللجنة الإقيانوغرافية الحكومية الدولية المعني بقانون البحار؛ وفريق المواءمة المعني بمواضيع المعلومات البحرية المشترك بين اللجنة الكهربائية التقنية الدولية والمنظمة الهيدروغرافية الدولية.
С ИМО и ИМА заключены меморандумы о взаимопонимании; кроме того, сотрудничество осуществляется в рамках совместных комитетов, включая: Группу ИМО и МГО по унификации ЭКНИС, Совместный руководящий комитет МГО и МОК по Генеральной батиметрической карте океанов, Подкомитет по названиям подводных форм рельефа, Подкомитет по цифровой батиметрии, Консультативный совет МГО, Международной геодезической ассоциации и МОК по морскому праву и Группу Международной электротехнической комиссии и МГО по унификации морских информационных объектов.