وبعد نشوب النزاع في الأرض الفلسطينية المحتلة في أيلول/سبتمبر 2000، وجهت الوكالة عددا من النداءات الطارئة وبدأت، بدعم من المانحين، في تعزيز المساعدة الطارئة المقدمة إلى ما يزيد على مليون من اللاجئين المتضررين من بينها المعونة الغذائية وتهيئة فرص للعمل والعلاج الطبي فضلا عن إجراء إصلاحات لأماكن الإيواء وإعادة بنائها.
После беспорядков, начавшихся на оккупированной палестинской территории в сентябре 2000 года, БАПОР обратилось с рядом призывов относительно оказания чрезвычайной помощи и при поддержке доноров приступило к оказанию чрезвычайной помощи пострадавшим беженцам, число которых составляло свыше 1 миллиона человек, включающей продовольственную помощь, помощь в обеспечении занятости, медицинское лечение беженцев, а также ремонт жилья и восстановительные работы.