وتحمي هذه الاتفاقية التنوع البيولوجي إذ تمنع الاتجار الدولي بقائمة متفق عليها من الأنواع المعرضة للانقراض (المرفق الأول) وتنظّم وترصد الاتجار بأنواع أخرى قد تصبح مهددة بالانقراض (المرفق الثاني). واتُخذت مقررات بالغة الأهمية في الدورة الثانية عشرة لمؤتمر الأطراف، التي عُقدت في تشرين الثاني/نوفمبر 2002، إذ أُضيفت إلى المرفق الثاني السلحفاة كبيرة الرأس والسلحفاة ذات الرأس الأصفر والسلحفاة الماليزية الضخمة، والقرش الحوتي، والقرش الكسول، وجنس فرس البحر بكامله، وأُبقي على الدلفين ذي المنقار المستدير في المرفق الثاني، مع إضافة حاشية تلغي بالكامل الحصة التي كان يُسمح بتصديرها من العينات الحية من دلفين البحر الأسود ذي المنقار المستدير الذي كان يُنتزع من بيئته البرية لأغراض تجارية في المقام الأول.
ЦИТЕС обеспечивает защиту биологического разнообразия за счет запрета на коммерческую международную торговлю перечисленными в согласованном списке видами, находящимися под угрозой исчезновения (приложение I), и за счет регулирования и мониторинга торговли другими видами, которые могут оказаться под угрозой исчезновения (приложение II). На двенадцатой сессии Конференции Сторон, состоявшейся в ноябре 2002 года, были приняты важнейшие решения о том, чтобы добавить в приложение II большеголовую черепаху, желтоголовую черепаху, малайзийскую гигантскую черепаху, гигантских и китовых акул и всего рода морских коньков, а также о сохранении афалины в добавлении II с аннотацией о нулевой экспортной квоте живых образцов черноморских афалин, пойманных на свободе, при торговле преимущественно в коммерческих целях.