وبلغ متوسط إنفاق الوكالة على الصحة والأنشطة المتصلة بها في عام 2002، بما في ذلك خدمات الرعاية الطبية الوقائية والعلاجية وأنشطة النظافة الصحية البيئية في المخيمات وتقديم المعونات الغذائية إلى الفئات الضعيفة، 13 دولارا لكل لاجئ، الأمر الذي أبقى الميزانية الصحية للوكالة في عداد ميزانيات أقل البلدان نموا بينما تجعلها الإنجازات التي حققها برنامجها الصحي أقرب إلى البلدان المتوسطة الدخل.
В 2002 году средние расходы Агентства на здравоохранение и мероприятия, связанные с охраной здоровья, включая оказание профилактических и медицинских услуг, поддержание санитарии в лагерях и предоставление продовольственной помощи уязвимым группам, составили 13 долл. США на одного беженца, т.е. бюджет БАПОР на охрану здоровья соответствует расходам на эти цели наименее развитых стран, а по показателям достигнутого прогресса его программы Агентство стоит ближе к категории стран со средним уровнем дохода.