وفي غياب نظام داخلي خاص للطوارئ، واجه مكتب التنسيق صعوبات وحالات من التأخير في تقديم الدعم الإداري في الوقت المناسب في حالات الطوارئ، لا سيما خلال المرحلة الأولية للعمليات الإنسانية الرئيسية، كتيمور الشرقية.
A falta de normas y procedimientos especiales de emergencia, la Oficina de Coordinación de Asuntos Humanitarios encontraba dificultades y demoras para prestar apoyo administrativo oportuno en situaciones de emergencia, especialmente durante la fase inicial de las principales operaciones humanitarias, como la de Timor Oriental.