غير أن محكمة العدل الأوروبية استخدمت مذهب الموضوع الأساسي المحدد لا لإضفاء الحصانة على حقوق الملكية الفكرية من مراقبة المنافسة وإنما لإضفاء الشرعية على إجراءات الاتحاد الأوروبي التي يُحتمل أن تؤثر على استخدام حقوق الملكية الممنوحة من الدول الأعضاء(10)؛ من ذلك، على سبيل المثال، أن مذهب الموضوع المحدد استخدم لتبرير تطبيق الاتحاد الأوروبي لقانون المنافسة على ترتيبات الترخيص المتعلقة بالمنتجات غير المحمية أو الأجزاء غير المحمية من منتجات محمية، أو شروط عــدم الاعتراض التي تحافظ على الوجود غير الشرعي لحقوق الملكية الفكرية(11).
Sin embargo, el TEJ ha aplicado la doctrina de la materia específica no tanto para eximir los DPI de los controles de defensa de la competencia, sino para legitimar las medidas de la UE que pueden afectar al ejercicio de derecho de propiedad otorgados por los Estados miembros; así, por ejemplo, ha invocado esa doctrina para justificar la aplicación de la legislación de la UE sobre la competencia a los acuerdos de cesión de licencias de explotación de productos no protegidos o de partes no protegidas de productos protegidos, o a cláusulas de no oposición que mantienen la existencia ilegítima de derechos de propiedad intelectual.