ويتألف مجلس التحالف من ممثلين لجميع الشركاء، وقد أنشئت فرق عمل لطرق مسائل البحث والتطوير (برئاسة مشتركة بين منظمة الصحة العالمية والمجتمع الأكاديمي وقطاع الصناعة)؛ والدعوة (برئاسة منظمة الأمم المتحدة للطفولة)؛ والتنسيق القطري (برئاسة منظمة الصحة العالمية)؛ والتمويل (برئاسة البنك الدولي).
Están representados en el Consejo de Administración de la Alianza todos los participantes y se han creado grupos de trabajo para hacerse cargo de las actividades de investigación y desarrollo (copresididos por la OMS, miembros de los círculos académicos e industriales); promoción de derechos (presidido por el UNICEF), coordinación entre los países (presidido por la OMS); y financiación (presidido por el Banco Mundial).