وساهم البرنامج أيضاً عن كثب مع برنامج الأمم المتحدة الإنمائي، والبنك الدولي، في إطار مرفق البيئة العالمية، ومع اللجنة الإوقيانوغرافية الحكومية الدولية التابعة لليونسكو، ومع المنظمة العالمية للأرصاد الجوية، والمجلس الدولي للإتحادات العلمية، في نظم المراقبة العالمية، ومع منظمة الصحة العالمية، ومنظمة الأرصاد الجوية واليونسكو داخل إطار البرنامج العالمي لرصد نوعية المياه.
El PNUMA también colaborará estrechamente con el Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo (PNUD) y el Banco Mundial en el marco del FMAM, con la Comisión Oceanográfica Intergubernamental (COI) de la Organización de las Naciones Unidas para la Educación, la Ciencia y la Cultura (UNESCO), la Organización Meteorológica Mundial (OMM) y el Consejo Internacional de Uniones Científicas en la esfera de los sistemas mundiales de observación, y con la Organización Mundial de la Salud (OMS), la OMM y la UNESCO en el marco del SIMUVIMA/Agua.