وتقوم البرامج الإقليمية، كما كان متوقعا، بدور هام في هذه المجالات وغيرها من مجالات التعاون عبر الحدود، مثلما هو الحال على سبيل المثال، في المكتب الإقليمي لأوروبا ورابطة الدول المستقلة، حيث أنشئ صندوق استئماني في عام 2000، بتمويل من حكومة الجمهورية التشيكية، لدعم التعاون الإقليمي؛ وفي المكتب الإقليمي للدول العربية، بشأن وضع سياسات للانضمام إلى الهيئات الإقليمية/الدولية؛ وفي المكتب الإقليمي لآسيا والمحيط الهادئ، بشأن تطوير القدرات وتوثيق الروابط مع التجمعات دون الإقليمية مثل رابطة أمم جنوب شرق آسيا - ورابطة جنوب آسيا للتعاون الإقليمي ولجنة المحيط الهادئ.
Como cabía esperar, los programas regionales desempeñan un notable papel en la colaboración transfronteriza; en la DRECEI se estableció en el 2000 un fondo fiduciario de apoyo a la cooperación regional; financiado por el Gobierno de la República Checa en la DREA; la asistencia se centra en la formulación de políticas de adhesión a los órganos regionales e internacionales; y en la Dirección Regional de Asia y el Pacífico, se llevan a cabo actividades de creación de capacidad y de estrechamiento de los lazos existentes entre las agrupaciones subregionales, como la Asociación de Naciones del Asia Sudoriental (ASEAN), la Asociación del Asia Meridional para la Cooperación Regional (SAARC) y la Comisión del Pacífico.