وبعد عدة عقود من الحرب الأهلية التي كانت واحدة من أطول وأعنف حروب القرن العشرين (الحرب الأهلية السودانية الأولى والحرب الأهلية السودانية الثانية) بين الحكومة المسلمة والعربية المتمركزة في الشمال، والمسيحيون والوثنيون السود المطالبين بالحكم الذاتي لإقليم الجنوب، تم توقع اتفاقية السلام المعروفة باسم اتفاقية نايڤاشا في 9 يناير، 2005, والتي أعطت حق الحكم الذاتي للولاية.
After several decades of a civil war that was one of the longest lasting and deadliest wars of the latter 20th century (the First Sudanese Civil War and the Second Sudanese Civil War) between the primarily Muslim and Arab government based in the north, and black Christian and animist people of the south who were demanding more regional autonomy, a peace agreement known as the Naivasha Agreement was signed on January 9, 2005, giving autonomy to the state.