وعلى عكس خوارزميات البحث عن الأبحاث النصية المستخدمة على مواقع الإنترنت مثل جوجل أو ويكيبيديا، يتطلب البحث عن المجموعات المتشابهة وراثيًّا العثور على المجموعات غير المتطابقة ببساطة، ولكن المتشابهة.
Unlike text-searching algorithms that are used on websites such as Google or Wikipedia, searching for sections of genetic similarity requires one to find strings that are not simply identical, but similar.