نظرًا لأن هذه التقنية هي تقنية منطقية (قطعية) وليست إحصائية (احتمالية)، مع التحليل المقارن النوعي الخاص بفئة "Crisp-Set" (csQCA)، وهو التطبيق الأصلي من التحليل المقارن النوعي، يمكن للمتغيرات أن يكون لها قيمتين فقط وهو ما يُعتبر إشكالية نظرًا لأن الباحث مضطر لتحديد قيم كل متغير.
==Criticism==As this is a logical (deterministic) and not a statistical (probabilistic) technique, with "Crisp-Set" QCA (csQCA), the original application of QCA, variables can only have two values, which is problematic as the researcher has to determine the values of each variable.