البروتينات تفصل بحسب النقطة متوازنة الكهربة (تركيز أيونات الهيدروجين pH الذي تكون فيه الشحنة متعادلة) في البعد الأول، وبحسب الوزن الجزيئي في البعد الثاني.
Proteins are separated according to isoelectric point (pH at which they have neutral net charge) in the first dimension, and according to their molecular weight in the second dimension.