الأسباب المقدمة لفشل الميكروسكوب المباشر تشمل مايلي يلي : (1) التسليط المتغير : كمية المتبرعمة الكيسية الحية تختلف كثيرا بين يوم واخر في البشر والحيوانات المصابة ؛ {85} (2) المظهر : بعض أشكال المتبرعمة الكيسية يشبه الخلايا الدهنية أو خلايا الدم البيضاء {86}، مما يجعل من الصعب التمييز بين الكائنات الحية وبين الخلايا الأخرى في عينات البراز، (3) عدد الأشكال المورفولوجية الكبير : يمكن ان تتخذ خلايا المتبرعمة الكيسية مجموعة متنوعة من الأشكال، وصف بعضها بالتفصيل في الآونة الأخيرة فقط ولذلك من الممكن أن توجد أشكال أخرى لم يتم تحديدها بعد.
Reasons given for the failure of Direct Microscopy include: (1) Variable Shedding: The quantity of "Blastocystis" organisms varies substantially from day to day in infected humans and animals; (2) Appearance: Some forms of "Blastocystis" resemble fat cells or white blood cells, making it difficult to distinguish the organism from other cells in the stool sample; (3) Large number of morphological forms: "Blastocystis" cells can assume a variety of shapes, some have been described in detail only recently, so it is possible that additional forms exist but have not been identified.