في 21 أغسطس 2006، ألقي القبض عليه في بوجمبورا على خلفية اتهامه ان له دور مزعوم في مؤامرة انقلاب في وقت سابق من العام.
On 21 August 2006, Ndayizeye was arrested in Bujumbura in relation to his alleged role in a coup plot earlier in the year.