تمتد حديقة بوناكن الوطنية على مساحة 890.65 كيلومتر مربع منها 3٪ فقط من اليابسة، بما في ذلك جزيرة بوناكن، فضلا عن جزر مانادو توا ومنتهاج وناين وسيلادين.
Bunaken National Park extends over an area of 890.65 km² of which only 3% is terrestrial, including Bunaken Island, as well as the islands of Manado Tua, Mantehage, Nain and Siladen.