توفي البابا في 19:49 بالتوقيت المحلي نتيجة التهاب الصفاق وسرطان المعدة في 3 يونيو وله من العمر 81 عامًا، ودفن يوم 6 يونيو بعد حبرية أربع سنوات وسبعة أشهر.
John XXIII died of peritonitis caused by a perforated stomach at 19:49 local time on 3 June 1963 at the age of 81, ending a historic pontificate of four years and seven months.