تضمن المتحف أساساً عينات لبعض الحيوانات وخصوصا الطيور وهذا تسبب في تسمية المبنى القديم للمتحف والذي كان يقع في وسط ريو دي جانيرو بأنه "بيت الطيور" حسب السكان المحليين.
Initially the Museum sheltered botanical and animal specimens, especially birds, what caused the old building where it was located in center of Rio de Janeiro, to be known by the population as the "House of the Birds".