أما حكومات الشعوب الأصلية، فيزكيها أبناء جماعات هذه الشعوب، وحكومات المقاطعات التي يفطنون فيها، حيث إنهم يعملون سويا مع مختلف الكيانات الحكومية المركزية، مثل وزارة الداخلية والعدل، وذلك من خلال إدارة شؤون الشعوب الأصلية، ووزارة البيئة، والإسكان والتخطيط العمراني، ووزارة التعليم، ووزارة الثقافة، ومعهد الأمازون للبحوث العلمية، ووحدة المنتزهات الوطنية، والهيئات الإقليمية، وكذلك بالتعاون مع المنظمات غير الحكومية، وتعاونية فالي لأخصائيي الصحة، ومؤسسة غايا، ومنظمة تروبانبوس الدولية للحفظ، ومنظمة انلتانو وغيرها.
The indigenous governments are supported by their communities and the departmental Government, which work together with various central government bodies, such as the Ministry of the Interior and Justice, through its Department of Indigenous Affairs, the Ministry of the Environment, Housing and Territorial Development, the Ministry of Education, the Ministry of Culture, the Amazon Scientific Research Institute (SINCHI), the Natural Parks Department and regional corporations, as well as in cooperation with the NGOs COOMEVA, Gaia Foundation, Tropenbos, Conservation International and Enollano, among others.