إن الإقليم عرضة للخطر أيضاً بسبب الآثار التي تخلفها تجارة المخدرات. ومع أن المخدرات غير المشروعة تنتقل عبر كافة دول آسيا الوسطى، إلا أن طاجيكستان تتحمل الوطأة العظمى من العقاب والتوبيخ بسبب موقعها على الحدود الشمالية لأفغانستان. وطبقاً للتقديرات فإن ما يصل إلى مائة طن من الهيروين تمر عبر طاجيكستان كل عام، وهذا ما يعادل إجمالي الطلب السنوي المقدر في أميركا الشمالية وغرب أوروبا. وما لم تتعاون دول آسيا الوسطى مع الدول المجاورة لها من أجل السيطرة على إنتاج المخدرات واستخدامها وتهريبها، فإنها لن تتمكن أبداً من استئصال هذا المصدر المستمر للمخاطر الصحية الشديدة والفساد والجريمة.
Up to 100 tons of heroin are estimated to pass through Tajikistan each year, which is equivalent to the estimated annual North American and West European demand. Unless Central Asian countries and their neighbors cooperate in controlling drug production, use, and trafficking, this source of major health risks, corruption, and crime will not be eradicated.