غير أن بعثة الأمم المتحدة في السودان وفرت الدعم اللوجستي والتقني إلى حكومة جنوب السودان عند وضع برنامج لنزع سلاح المدنيين طوعيا في قضائيّ ولاية جونقلي: أكوبو (تموز/يوليه إلى آب/أغسطس 2006) وبيبور (كانون الثاني/يناير إلى أيار/مايو 2007)، حيث جُمع 203 1 أسلحة و 126 1 وحدة من الذخيرة المتصلة بها.
Однако МООНВС оказывала поддержку в обеспечении снабжения и техническую поддержку правительству Южного Судана в связи с осуществлением программы добровольного разоружения гражданского населения в двух округах штата Джонглей: Акобо (июль-август 2006 года) и Пибор (январь-май 2007 года), в рамках которой было собрано соответственно 1203 единицы оружия и 1126 единиц оружия и соответствующие боеприпасы.