Selon une méta-analyse britannique récente, les émissions d'ammoniac, le lessivage à l'azote et les émissions d'oxyde d'azote par unité de production étaient plus élevés dans les systèmes biologiques que dans l'agriculture conventionnelle, de même que l'utilisation des terres et le potentiel d'eutrophisation (les réactions des écosystèmes défavorables à l'ajout d'engrais et de déchets) et l'acidification.
Согласно недавнему британскому мета-анализу, выбросы аммиака, выщелачивания азота и выделения закиси азота на единицу продукции были выше в органических системах, чем в традиционном сельском хозяйстве. Использование земли и возможность этерификации - неблагоприятной реакции экосистемы на удобрения и отходы - и подкисления, также были превышены.