La teoría de la evolución se desestabiliza aún más debido a la creciente convicción acerca de que muchos factores, no sólo el genoma, determinan el desarrollo de un organismo individual. Irónicamente, si bien el descubrimiento de la estructura del ADN – que inicialmente fue aclamado como el acto final del triunfo de la nueva síntesis – condujo a una mejor comprensión del funcionamiento de los genomas, terminó debilitando la creencia sobre el papel exclusivo que desempeña en el direccionamiento del desarrollo biológico.
进一步动摇进化论的是人们逐渐意识到，许多因素（而不仅仅是基因组）决定了个体生命的发展。讽刺的是，DNA结构的发现——当初被称为新综合范式彻底胜利的最后一击——使人们更好地理解了基因组的功能，最终却削弱了人们关于它们单独决定了生物发展方向的观念。那些长期以来强烈抗议进化模型忽略发育过程的人——几十年来，这一批评被冠以进化发育生物学的名号——以及坚持生命体的发育需要利用各种资源的人被证明是正确的。