Luego ocurrieron los sucesos del 9/11, cuando -bajo intensa presión de los Estados Unidos para que apoyara las represalias estadounidenses en Afganistán o se atuviera a las consecuencias- se vio obligado a abandonar a sus protegidos. Los talibanes, bajo cuyo régimen Osama bin Laden había encontrado refugio, habían sido creados (y, en batallas cruciales, dirigidos) por Los Interservicios Secretos de Pakistán (ISI).
随后发生了911事件。美国强烈要求巴基斯坦支持在阿富汗实行报复，否则就会面临后果。此时他被迫断绝了与这些被保护人的关系。巴基斯坦的联合情报部门(ISI)建立了塔利班并且在关键性战役中指挥他们，而本拉登则在塔利班的统治下建立了安全老巢。现在，为了保持巴基斯坦与世界唯一超级大国(以及该国最大的援助国)的联盟，穆沙拉夫不得不背叛自己人。