El ejército reaccionó calificando al partido y a sus partidarios de fuerza atea del mal que se debía aniquilar. La matanza resultante fue deliberada, sistemática y en todo el país, si bien la violencia más intensa y espantosa se dio en la Java central y oriental, Bali y Sumatra septentrional.
杀戮开始于1965年10月一场失败的政变之后。据称这场政变由印尼共策划。军方将印尼共及其支持者描述为邪恶的无神论势力，必须清剿。随后的大屠杀是一次有预谋、成系统、遍及全国，其中爪哇中部和东部、巴厘和苏门答腊北部的暴力最恐怖、最严重。