La tenacidad de la AIEA también ha revelado gran parte del programa nuclear de Irán, aunque sólo después de que un grupo disidente iraní divulgara la existencia de algunos de los centros nucleares secretos del régimen. A principios de 2003, su presencia in situ en Irak determinó que Saddam no tenía un programa de armas nucleares, contrariamente a lo que afirmaba el gobierno de Bush.
该机构坚持不懈，还发现了伊朗的核子项目，尽管这是伊朗的异议团体揭发伊朗政权的某些秘密设施之后才发现的。在2003年早些时候，与布什当局的说法相反的是，其在伊拉克的现场检查员确认萨达姆并没有核子武器项目。在2004年，该机构揭发了南韩没有防护的钸和浓缩试验。