Si bien los nuevos estándares se aplicarían a los proveedores de todos los países exportadores, los costos de cumplimiento normalmente varían, lo que significa que aquellos que estén menos equipados para cumplir estándares superiores podrían verse afectados. A fines de los años 1990, cuando la UE decidió armonizar los estándares para las aflatoxinas (un grupo de compuestos tóxicos producidos por ciertos mohos), ocho estados miembro –entre ellos Italia, Holanda y España- elevaron sustancialmente sus estándares nacionales, lo que probablemente haya causado que cayeran las exportaciones africanas de cereales, frutas disecadas y frutas secas a Europa en 670 millones de dólares.
尽管新标准将适用于所有出口国供应商，但合规成本通常各不相同，这意味着更难以满足高标准的企业会遭受损失。20世纪90年代末，欧盟决定协调黄曲霉素标准（黄曲霉素是某些霉菌产生的有毒成分族），八个成员国——包括意大利、荷兰和西班牙——大幅度提高了国家标准，这或许就是非洲国家队欧洲的谷物、水果干和坚果对欧出口下降6.7亿美元的原因。