Otros tipos de variedades de cultivos modificados genéticamente, como aquellos que son resistentes a las enfermedades y las pestes, mejoran de manera indirecta la eficiencia del uso del agua. Dado que gran parte de la pérdida por enfermedades o pestes se produce después de que las plantas han crecido plenamente -es decir, después de que ya se ha suministrado la mayor parte del agua necesaria para su crecimiento-, la resistencia implica una mayor producción agrícola por unidad de agua invertida.
具有抗病及抗虫特性的其他种类的转基因作物品种可以间接提高水资源利用的质量。因为病虫害造成的损失多发于作物充分生长之后——也就是在多数生长所需的水资源已经消耗完毕之后——抗御病虫害意味着提高单位水资源投入的农业产量。总之，在降水量不变的前提下农民可以实现更多产量。