Al aportar el Irán, dominado por los chiíes, armas, dinero, tropas y formación a las fuerzas de Asad, la dimensión sectaria del conflicto ha cobrado una mayor importancia. De hecho, las fuerzas gubernamentales han pasado a ser un ejército sectario, motivado por el miedo a que, si los rebeldes, en su mayoría suníes, resultan victoriosos, aniquilen a la minoría alauí, de filiación chií, que ha gobernado a Siria durante decenios.
伊朗的介入反映了另一场历史远为悠久的斗争——逊尼派和什叶派对中东地区的争夺战。什叶派主导的伊朗为巴沙尔军队提供武器、金钱、军队和训练，让冲突的宗派色彩更加浓厚了。事实上，政府军已经演化为宗派部队，其作战动机是担心一旦逊尼派占多数的反对派获胜，他们就会清除统治叙利亚几十年之久的、人数占少数地位的、属于什叶派的阿拉维派。