La planta producida con agricultura biofarmacéutica se mezclaría en una gran recolección, en la que las substancias farmacéuticas estarían muy diluidas. Después el agente activo tendría que sobrevivir a la molienda y a otros procesos y luego al cocinado y tendría que estar oralmente activa, cosa que raras veces se da en los medicamentos con proteínas, porque se digieren en el estómago.
即使一些作物被污染，活跃药物成分出现以足够大量出现在最终食品产品中、足以给人类健康造成负面影响的概率也十分低。生物制药作物将与各种作物混杂在一起，其药用成分将大大稀释。活跃成分还将经历研磨和其他处理过程，然后被烹饪，还需要在口腔中就见效（orally active，大部分蛋白质药物不具备这一性质），因为在胃中它们会被消化。