Cuando Patterson intentó colaborar con el gobierno de Morsi para poder perseguir los intereses de los EE.UU., ejerciendo incluso presiones para que aplicara políticas menos excluyentes y más respetuosas de los derechos, la oposición liberal consideró que estaba apoyando a los Hermanos Musulmanes, pero, cuando los EE.UU. se negaron a llamar “golpe militar” la destitución de Morsi por el ejército egipcio (designación que habría obligado a dejar de conceder los 1.500 millones de dólares de ayuda prestada anualmente al ejército egipcio), los partidarios de los Hermanos Musulmanes concluyeron que los Estados Unidos apoyaban la decisión del ejército.
Toen Patterson probeerde samen te werken met de regering-Morsi, op manieren die haar in staat moesten stellen Amerikaanse belangen na te streven, waaronder het aandringen op een beleid dat de rechten van minderheden respecteerde, had de liberale oppositie het idee dat zij de Moslimbroederschap steunde. Maar toen de VS weigerden de omverwerping van Morsi door het Egyptische leger een coup te noemen (een betiteling die het leger zou hebben gedwongen de $1,5 mrd aan hulp in te trekken die jaarlijks aan het Egyptische leger wordt verstrekt), concludeerden de aanhangers van de Moslimbroederschap dat Amerika het besluit van het leger steunde.