No obstante, durante los años 90 Anwar aumentó su influencia dentro del partido, incomodando a muchos de la vieja guardia. Las cosas llegaron a un punto de conflicto después de la crisis financiera de 1997, cuando Anwar, viceprimer ministro, adoptó un enfoque aún más liberal en lo económico que Mahathir.
ただし 1990 年代の間、アンワルは党内での影響力を強め、従来の安全装置を不安定化した。1997 年の経済危機後、アンワル副首相がマハティールよりも経済的にリベラルな手法を採用した際にこの問題が取り上げられた。アンワルはこの挑戦への措置を一因として、解任された。