Tras la invasión estadounidense a Afganistán en 2001, los Haqqani se refugiaron en la Zona Tribal de Waziristán del Norte, situación tolerada por los ISI con la idea de que el grupo pastún actuaría como agente de Pakistán en Afganistán una vez que las tropas estadounidenses se marcharan en 2014.
À la suite de l’invasion de l’Afghanistan par les États-Unis en 2001, les Haqqanis ont établi un sanctuaire dans l’agence tribale du Waziristan du Nord. L’ISI a permis que cela se produise, dans l’espoir de voir par la suite le groupe pachtoune agir en tant qu’intermédiaire du Pakistan en Afghanistan, après le départ des forces combattantes américaines fin 2014.