To understand why, consider that their proposal for a permanent Council President was paired with a proposal that the Commission President--currently nominated by the Council of Ministers--should in future be elected by the European Parliament, and subsequently be endorsed by a majority vote of the Council of Ministers.
Para entender por qué, supongamos que su propuesta de un Presidente permanente del Consejo se equiparara con una propuesta de que el Presidente de la Comisión, actualmente nombrado por el Consejo de Ministros, sea elegido en el futuro por el Parlamento Europeo, apoyado posteriormente por un voto de mayoría del Consejo de Ministros.