Nach Ansicht Khomeinis durfte der oberste Rechtsgelehrte, je nach seiner Interpretation der Erfordernisse des Regimes, religiöse Gesetze abändern. Dies hatte zur Folge, dass religiöse Interpretation – eine vorher höchst dezentralisierte Angelegenheit, die den unterschiedlichen theologischen Hochschulen oblag – jetzt in den Händen eines politischen Führers lag.
变化发生在阿亚图拉霍梅尼提出“法学家执政”的理论之后。在霍梅尼看来，执政的法学家可以根据自己对政府需求的理解来修改宗教法律。于是，此前由不同神学院履行的高度分散的职能逐渐被集中到了政治领袖的手中。进而，神学院组织也不再只是管理宗教事务的民间机构，而是演变成了为政府利益服务的统一的意识形态组织。