Die Hartnäckigkeit der IAEA hat außerdem einen Großteil des iranischen Nuklearprogramms ausgeräuchert – allerdings erst, nachdem iranische Dissidentengruppen die Existenz einiger der geheimen Anlagen des Regimes aufgedeckt hatten. Anfang 2003 belegte ihre Anwesenheit im Irak, dass Saddam Hussein – anders als von der Bush-Administration behauptet – nicht über ein Atomwaffenprogramm verfügte.
该机构坚持不懈，还发现了伊朗的核子项目，尽管这是伊朗的异议团体揭发伊朗政权的某些秘密设施之后才发现的。在2003年早些时候，与布什当局的说法相反的是，其在伊拉克的现场检查员确认萨达姆并没有核子武器项目。在2004年，该机构揭发了南韩没有防护的钸和浓缩试验。