Lees Nachfolge war klar geregelt: nach der Übergabe des Premierministeramtes im Jahr 1990 (im erstaunlich jungen Alter von 66 Jahren) an seinen loyalen Mitstreiter Goh Chok Tong, baute er seinen ältesten Sohn, Brigadegeneral Lee Hsien Loong, für diesen Posten auf. Dieser übernahm das Amt im Jahr 2004, nachdem er zuvor als Handelsminister, Finanzminister und stellvertretender Premierminister tätig gewesen war.
李光耀的继承人非常明确：在20世纪90年代（年仅66岁）将总理宝座交给值得信赖的同事吴作栋后，李光耀全力培养自己的长子准将李显龙。在历任新加坡贸易部长、财政部长和副总理后，李显龙于2004年登上了总理宝座。之后传位给谁、怎么传位尚不明确。