Robert McNamara, Kennedys Verteidigungsminister, sagte, er sei im Laufe der Krise immer vorsichtiger geworden. Er habe die Wahrscheinlichkeit, dass die Krise zu einem Atomkrieg führen würde, auf vielleicht 1:50 geschätzt (obwohl er das Risiko als viel höher einstufte, als er in den 1990er Jahren erfuhr, dass die Sowjets bereits Atomwaffen nach Kuba geliefert hatten).
1987年，我参与了哈佛大学与肯尼迪依然健在的顾问见面研究这场危机的学者团。时任肯尼迪国防部长罗伯特·麦克纳马拉表示随着危机逐渐展开，他自己也变得越来越谨慎。当时他曾认为危机引发核战争的可能性是五十分之一（尽管20世纪90年代获悉苏联已将核武器运抵古巴后，麦克纳马拉大幅提高了自己的风险评分）。