Ein weiteres Manko des Kriegs gegen den Terror ist, dass er sich auf eine rein militärische Vorgehensweise stützt und politische Ansätze außer Acht lässt. Anstatt mit der libanesischen Regierung und der palästinensischen Behörde politische Übereinkünfte zu schließen, zog sich Israel aus dem Libanon und später aus Gaza unilateral zurück.
反恐战争这一概念的另一个缺陷是，它依赖于军事行动、排除政治途径。以色列先后单方面从黎巴嫩和加沙地带撤军，而非与黎巴嫩政府和巴勒斯坦权力机构谈判。这一行动的直接后果就是加强了真主党和哈马斯。反恐战争概念由于分清“我们”和“他们”，并且否认我们的行动可能会塑造他们的行为，因而，它阻碍了承认这一事实。