Aber nach dem Putsch schlossen die AU und die Wirtschaftsgemeinschaft Westafrikanischer Staaten (ECOWAS) mit Unterstützung der UN Mali umgehend von der AU-Mitgliedschaft aus, belegten das Land mit wirtschaftlichen und diplomatischen Sanktionen und beschränkten die Reisefreiheit der Putschisten. Nur gut zwei Wochen später gab die ECOWAS eine Übereinkunft mit den Anführern des Umsturzes bekannt, die als Gegenleistung für die Aufhebung der Sanktionen die Gründung einer Zivilregierung vorsah.
马里的情况更加复杂，该国一直存在分裂运动，终于在3月21日发生了政变。但是，政变发生后，非盟和西非国家经济共同体（Economic Community of West African States，受联合国支持）立刻中止了马里的成员资格，对其进行了经济和外交制裁，并限制政变领导人的出行。区区两周后，西非国家经济共同体就宣布它与政变领导人达成了一致，马里恢复文官政府，以换取去取消制裁。