Diese nicht identifizierten Gensequenzen stellen ein Problem dar, weil nicht bekannt ist, ob außer Viren, Bakterien, Archaeen und Eukaryoten noch andere Vehikel existieren. Umgekehrt wissen wir jedoch, dass durch Genduplikation, Genfusion oder weitere unbekannte Mechanismen neue Gene, so genannte ORFans („Orphangene“) gebildet werden.
那些未能定义的基因序列也因此带来了一个问题，因为不知道除了病毒、细菌，古生菌和真核细胞之外是否还有其他载体存在。相反，我们知道新基因，特定的“孤儿基因”（orphan genes），经常会在基因复制，融合或者其它未知机制中产生。但依照达尔文的生命树概念，这种现象是不可能出现的。