Podobně existují i důkazy, že prefrontální kůra - klíčová struktura pro emocionální regulaci, ale i pro rozhodovací proces a funkční paměť - se v případě závažných depresí zmenšuje. Naproti tomu amygdala, centrum emočních vzpomínek, neatrofuje, ale stává se hyperaktivní jak u posttraumatické stresové poruchy, tak i u depresivního onemocnění, a výzkumy na zvířatech prokázaly hypertrofii nervových buněk po opakovaném stresu.
同样地，有证据显示，在主导型抑郁症中，前额叶皮层--情绪调节、做决定以及工作记忆的关键组织--也会萎缩。另一方面，在创伤后压力障碍症和抑郁症中，类扁桃体--感情记忆的所在--非但不萎缩，还会变得亢进。动物研究得到的证据还显示反复的压力之后神经细胞会变得过度肥大。