V průběhu následujících dvou desetiletí kladl stát fungování Harvardovy univerzity stále větší překážky – například tím, že pro ni odmítal uvolňovat prostředky a brzdil jmenování profesorů. Toto chování vyvrcholilo v roce 1862, kdy zákonodárný sbor zablokoval jmenování rektora.
哈佛几乎是立刻受到了口诛笔伐，人们认为它太过精英主义、太排外、太昂贵。甚至哈佛大学的课程也受到了挑战。在此后20年中，马萨诸塞州通过拒绝出资和阻挠教授任命等方式越来越多地影响哈佛大学的运转。这类行为的高峰在1862年，立法机构驳回了哈佛的校长任命议案。