Do roku 2012 se procento nakažených mužů majících sex s muži zvýšilo na 17%. Stále vyšší počet mužů přitom uvádí, že se ve zdravotnických centrech setkává s homofobií, což snižuje pravděpodobnost, že vyhledají pomoc.
官方认可的尼日利亚恐同氛围已经破坏了抗击艾滋病斗争的成果。2006年， 一项研究发现尼日利亚男同性性交群体13%的人艾滋病毒测试呈阳性，而该数据在尼全体民众中仅有4.5%。截止2012年，男同性性交群体中的艾滋病毒感染率已经上升至17%。此外，报告在医疗中心遭遇同性恋恐惧症的人越来越多，使他们寻求治疗的积极性大打折扣。