Přestože byl Barghútí už v roce 1996 zvolen do Palestinské zákonodárné rady, jeho reputace prudce stoupla, když v srpnu 2000 začala současná intifáda. Podpora útoků proti izraelským vojákům a osadníkům na okupovaných územích, o nichž prohlašuje, že jsou v souladu s mezinárodním právem, mu zajistila obrovskou popularitu mezi Palestinci, ale také pět doživotních trestů a ještě 40 let navrch v izraelské věznici.
虽然他在1996年就当选巴勒斯坦立法委员会，但是他声名大振还是在2000年9月开始的因提法达起义中。他主张暴力袭击在巴被占领土上的以色列士兵和定居者，且认为这在国际法框架内属合法行为。他的这一立场另他在许多巴勒斯坦人中享有威望，但他也因此被以色列判了5次终身监禁另加40年监禁。