Během několika měsíců ovšem Mušaraf provedl puč proti smolaři Navázi Šarífovi a rok nato se prohlásil prezidentem, což byl titul, který měl upevnit jeho význam, když v červenci 2001 zavítal do Indie kvůli mírovým rozhovorům. Mušaraf se ale dostal k moci jako patron džihádistů, jimž jeho armáda zajišťovala ke vpádům na indické území finance, výzbroj i výcvik, a málokdo v Novém Dillí se domníval, že s takto dvojakým mužem by bylo možné dosáhnout opravdového míru.
但是在几个月内，穆沙拉夫主导了军事政变，推翻了软弱无力的沙里夫总理。一年以后他自立为总统，目的在于当他在2001年7月访问印度进行和平会谈的时候提升自己的地位。但是穆沙拉夫掌权是圣战者的保护人，其军队为这些圣战者提供资助和装备，并且训练他们以便入侵印度领土。印度几乎没人认为与这样一个狡诈的人可以实现真正的和平。