Mezi tři otázky centrálních institucí, před nimiž Mezivládní konference stojí, patří otázka budoucího uspořádání Evropské komise a Evropské rady a otázka stanovení role budoucího předsedy Evropské rady.
Las tres cuestiones institucionales centrales a las que se enfrenta la Conferencia Intergubernamental son la organización futura de la Comisión y del Consejo, así como la definición del papel del futuro Presidente del Consejo Europeo.