كما تخشى مصر اندلاع حرب أهلية بين حماس وفتح. وعلى الرغم من أن حماس قد استبعدت هذا الاحتمال، إلا أنها لم تبد أي تردد في استخدام القوة الصارمة ضد معارضيها. وعلى نحو مماثل يقول محمود الزهار وزير خارجية حكومة حماس إن أي محاولة لحل الحكومة الحالية أو الدعوة إلى إجراء انتخابات مبكرة من جانب عباس من شأنه أن يؤدي إلى اندلاع حرب أهلية. ولقد كان الخوف من وقوع معارك ساخنة سبباً في دفع العديد من الفلسطينيين إلى محاولة الدخول إلى مصر، فاضطرت الحكومة المصرية بالتالي إلى نشر قواتها على الحدود بهدف السيطرة على أي خروج جماعي.
Министр иностранных дел в правительстве «Хамаса» Махмуд аль-Захар также говорит, что роспуск правительства или призыв Аббаса к досрочным выборам – верный путь к гражданской войне. Из опасения перед большой войной многие палестинцы уже перебираются в Египет, что привело к размещению египетских военных подразделений на границе, для того чтобы сдержать массовый исход населения.