كان المقصود من استخدام تكنولوجيا الجينات البكتيرية المعدلة مع القطن في مستهل الأمر هو السيطرة على الآفات. ولكن آفات جديدة ظهرت في القطن المعدل وراثياً، الأمر الذي أدى إلى استخدام المبيدات بكثافة أعلى. وفي منطقة فيداربا التابعة لولاية مهاراشترا، والتي شهدت أعلى معدلات انتحار بين المزارعين، تزايدت المساحة المزروعة بالقطن المعدل وراثياً بواسطة البكتريا من 0,2 مليون هكتار في عام 2004 إلى 2,88 مليون هكتار في عام 2007. وارتفعت تكاليف المبيدات الحشرية التي يتحملها المزارعون إلى ثلاثة عشر ضعفاً أثناء الفترة نفسها.
Однако в хлопке «Bt» появились новые вредители, ведя к более высокому уровню использования пестицидов. В регионе Видхарбха в провинции Махараштра, в котором зафиксировано наибольшее количество самоубийств, посевные площади под хлопком «Bt» увеличилась с 0,2 миллионов гектаров в 2004 году до 2,88 миллионов гектаров в 2007 году.