وخلال السنوات الأخيرة من ثمانينيات القرن العشرين كان حتى موقف سوهارتو تجاه الإسلام قد أخذ يتغير. فقد تضمنت الامتيازات التي قدمتها الحكومة لاسترضاء المشاعر الدينية إعلان قانون الأسرة الإسلامي في عام 1989، وتأسيس رابطة المفكرين المسلمين الإندونيسيين في عام 1990، ورفع الحظر على ارتداء بنات المدارس لغطاء الرأس في عام 1991، وتأسيس بنك إسلامي (بنك معاملات) في عام 1992، وإلغاء اليانصيب التابع للدولة. ولقد أقنعت هذه الإجراءات مسلمي إندونيسيا بأنهم يستطيعون الحياة وفقاً لتعاليم الإسلام دون أن تتحول إندونيسيا إلى دولة إسلامية.
Уступки правительства религиозным настроениям включали опубликование Исламского семейного права в 1989 году, создание Индонезийской ассоциации мусульманских интеллектуалов в 1990-м году, снятие запрета на ношение школьницами джилбаба (головной накидки) в 1991 году, учреждение исламского банка (Банк Муамалат) в 1992 году и отмену государственной лотереи. Эти меры убедили индонезийских мусульман, что они могут жить в соответствии с исламским учением без превращения Индонезии в исламское государство.