في أوج الحرب السوفييتية الأفغانية في ثمانينيات القرن العشرين، كانت باكستان تخدم كقناة سرية للمقاتلين المسلمين الفلبينيين، يمرون عبرها إلى أفغانستان ثم يعودون إلى جزيرة مينداناو، التي ظلت لمدة طويلة معقلاً للمتمردين المسلمين. ولقد كانت خبراتهم وتجاربهم في حرب العصابات سبباً في ظهور الزعماء بينهم، من أمثال الأخوين عبد الرزاق و خدافي جنجلاني اللذين أسسا جماعة أبو سيف الإرهابية، والتي تعيث فساداً ودماراً في الفلبين الآن.
В разгар советско-афганской войны в 1980-ые годы Пакистан был тайным каналом, по которому филиппинские мусульманские боевики попадали в Афганистан и уходили обратно на остров Минданао, который долгое время был цитаделью мусульманских мятежников. Их опыт в партизанской войне произвел на свет таких лидеров, как братья Абдураджак и Хадаффи Джанжалани, которые основали террористическую группу Абу-Саяфа, наводящую сегодня беспорядки в Филиппинах.